RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392066.7

ACSL3-202, Transcript of acyl-CoA synthetase long chain family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene ACSL3, Length 3,147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3-202ENST00000392066 BCL11AQ9H165 835 aa22.73■■□□□ 1.23
ACSL3-202ENST00000392066 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.72■■□□□ 1.23
ACSL3-202ENST00000392066 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ACSL3-202ENST00000392066 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.222e-6■■■□□ 17.6
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ACSL3-202ENST00000392066 CLIP1P30622 1438 aa22.66■■□□□ 1.22
ACSL3-202ENST00000392066 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ACSL3-202ENST00000392066 IFT140Q96RY7 1462 aa22.66■■□□□ 1.22
ACSL3-202ENST00000392066 PBRM1Q86U86 1689 aa22.64■■□□□ 1.21
ACSL3-202ENST00000392066 MIER1Q8N108 512 aa22.62■■□□□ 1.21
ACSL3-202ENST00000392066 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ACSL3-202ENST00000392066 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
ACSL3-202ENST00000392066 GRIN2BQ13224 1484 aa22.51■■□□□ 1.19
ACSL3-202ENST00000392066 ADAMTS12P58397 1594 aa22.5■■□□□ 1.19
ACSL3-202ENST00000392066 ARAP1Q96P48 1450 aa22.5■■□□□ 1.19
ACSL3-202ENST00000392066 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.49■■□□□ 1.19
ACSL3-202ENST00000392066 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.48■■□□□ 1.19
ACSL3-202ENST00000392066 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.48■■□□□ 1.19
ACSL3-202ENST00000392066 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.45■■□□□ 1.18
ACSL3-202ENST00000392066 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.44■■□□□ 1.18
ACSL3-202ENST00000392066 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.42■■□□□ 1.18
ACSL3-202ENST00000392066 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ACSL3-202ENST00000392066 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.33■■□□□ 1.17
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ACSL3-202ENST00000392066 P3H3Q8IVL6 736 aa22.29■■□□□ 1.16
ACSL3-202ENST00000392066 GRIN2AQ12879 1464 aa22.28■■□□□ 1.16
ACSL3-202ENST00000392066 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.26■■□□□ 1.15
ACSL3-202ENST00000392066 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.25■■□□□ 1.15
ACSL3-202ENST00000392066 SAMD9Q5K651 1589 aa22.24■■□□□ 1.15
ACSL3-202ENST00000392066 SYNJ2O15056 1496 aa22.24■■□□□ 1.15
ACSL3-202ENST00000392066 IQGAP2Q13576 1575 aa22.23■■□□□ 1.15
ACSL3-202ENST00000392066 CEP170Q5SW79 1584 aa22.2■■□□□ 1.14
ACSL3-202ENST00000392066 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ACSL3-202ENST00000392066 FBLN2P98095 1184 aa22.17■■□□□ 1.14
ACSL3-202ENST00000392066 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ACSL3-202ENST00000392066 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.14■■□□□ 1.14
ACSL3-202ENST00000392066 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ACSL3-202ENST00000392066 APLP2Q06481 763 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSL3-202ENST00000392066 BCANQ96GW7 911 aa22.11■■□□□ 1.13
ACSL3-202ENST00000392066 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.1■■□□□ 1.13
ACSL3-202ENST00000392066 NUP160Q12769 1436 aa22.1■■□□□ 1.13
ACSL3-202ENST00000392066 CHD1O14646 1710 aa22.09■■□□□ 1.13
ACSL3-202ENST00000392066 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ACSL3-202ENST00000392066 TIAM1Q13009 1591 aa22.05■■□□□ 1.12
ACSL3-202ENST00000392066 DISP1Q96F81 1524 aa22.05■■□□□ 1.12
ACSL3-202ENST00000392066 FMN1Q68DA7 1419 aa22.04■■□□□ 1.12
ACSL3-202ENST00000392066 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.04■■□□□ 1.12
ACSL3-202ENST00000392066 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.04■■□□□ 1.12
ACSL3-202ENST00000392066 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.04■■□□□ 1.12
ACSL3-202ENST00000392066 KIAA0556O60303 1618 aa22.02■■□□□ 1.12
ACSL3-202ENST00000392066 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.02■■□□□ 1.11
ACSL3-202ENST00000392066 MAP3K1Q13233 1512 aa22■■□□□ 1.11
ACSL3-202ENST00000392066 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ACSL3-202ENST00000392066 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.97■■□□□ 1.11
ACSL3-202ENST00000392066 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ACSL3-202ENST00000392066 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.94■■□□□ 1.1
ACSL3-202ENST00000392066 JPH4Q96JJ6 628 aa21.93■■□□□ 1.1
ACSL3-202ENST00000392066 HECW1Q76N89 1606 aa21.85■■□□□ 1.09
ACSL3-202ENST00000392066 SHROOM2Q13796 1616 aa21.82■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.82■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.81■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 FKBP8Q14318 412 aa21.81■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.8■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.8■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 ARID3CA6NKF2 412 aa21.8■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.79■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.78■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.77■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.77■■□□□ 1.08
ACSL3-202ENST00000392066 KCNH8Q96L42 1107 aa21.76■■□□□ 1.07
ACSL3-202ENST00000392066 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.73■■□□□ 1.07
ACSL3-202ENST00000392066 ITGAEP38570 1179 aa21.73■■□□□ 1.07
ACSL3-202ENST00000392066 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.71■■□□□ 1.07
ACSL3-202ENST00000392066 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.71■■□□□ 1.07
ACSL3-202ENST00000392066 ABCA8O94911 1581 aa21.69■■□□□ 1.06
ACSL3-202ENST00000392066 NCOA2Q15596 1464 aa21.67■■□□□ 1.06
ACSL3-202ENST00000392066 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
ACSL3-202ENST00000392066 ARHGEF11O15085 1522 aa21.64■■□□□ 1.06
ACSL3-202ENST00000392066 PTPRGP23470 1445 aa21.64■■□□□ 1.05
ACSL3-202ENST00000392066 MSH5O43196 834 aa21.64■■□□□ 1.05
ACSL3-202ENST00000392066 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.59■■□□□ 1.05
ACSL3-202ENST00000392066 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.58■■□□□ 1.05
ACSL3-202ENST00000392066 NEFLP07196 543 aa21.56■■□□□ 1.04
ACSL3-202ENST00000392066 ATP10BO94823 1461 aa21.56■■□□□ 1.04
ACSL3-202ENST00000392066 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.56■■□□□ 1.04
ACSL3-202ENST00000392066 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ACSL3-202ENST00000392066 UACAQ9BZF9 1416 aa21.52■■□□□ 1.04
ACSL3-202ENST00000392066 KIF14Q15058 1648 aa21.52■■□□□ 1.03
ACSL3-202ENST00000392066 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ACSL3-202ENST00000392066 OSCARQ8IYS5 282 aa21.49■■□□□ 1.03
ACSL3-202ENST00000392066 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.48■■□□□ 1.03
ACSL3-202ENST00000392066 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.47■■□□□ 1.03
ACSL3-202ENST00000392066 ABCC2Q92887 1545 aa21.47■■□□□ 1.03
ACSL3-202ENST00000392066 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.033e-6■□□□□ 10.3
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