RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383331.4

HCG27-201, Transcript of HLA complex group 27, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HCG27, Length 1,720 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG27-201ENST00000383331 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HCG27-201ENST00000383331 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HCG27-201ENST00000383331 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HCG27-201ENST00000383331 PBRM1Q86U86 1689 aa23.5■■□□□ 1.35
HCG27-201ENST00000383331 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.49■■□□□ 1.35
HCG27-201ENST00000383331 SYNJ2O15056 1496 aa23.46■■□□□ 1.35
HCG27-201ENST00000383331 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.42■■□□□ 1.34
HCG27-201ENST00000383331 ARAP1Q96P48 1450 aa23.42■■□□□ 1.34
HCG27-201ENST00000383331 CLIP1P30622 1438 aa23.4■■□□□ 1.34
HCG27-201ENST00000383331 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.37■■□□□ 1.33
HCG27-201ENST00000383331 ADAMTS12P58397 1594 aa23.37■■□□□ 1.33
HCG27-201ENST00000383331 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.32■■□□□ 1.32
HCG27-201ENST00000383331 GRIN2AQ12879 1464 aa23.26■■□□□ 1.31
HCG27-201ENST00000383331 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.25■■□□□ 1.31
HCG27-201ENST00000383331 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HCG27-201ENST00000383331 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.2■■□□□ 1.3
HCG27-201ENST00000383331 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
HCG27-201ENST00000383331 CEP170Q5SW79 1584 aa23.17■■□□□ 1.3
HCG27-201ENST00000383331 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.17■■□□□ 1.3
HCG27-201ENST00000383331 NUP160Q12769 1436 aa23.16■■□□□ 1.3
HCG27-201ENST00000383331 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
HCG27-201ENST00000383331 HRCP23327 699 aa23.13■■□□□ 1.29
HCG27-201ENST00000383331 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.1■■□□□ 1.29
HCG27-201ENST00000383331 IQGAP2Q13576 1575 aa23.09■■□□□ 1.29
HCG27-201ENST00000383331 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.06■■□□□ 1.28
HCG27-201ENST00000383331 SAMD9Q5K651 1589 aa23.06■■□□□ 1.28
HCG27-201ENST00000383331 SHROOM2Q13796 1616 aa23.03■■□□□ 1.28
HCG27-201ENST00000383331 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23■■□□□ 1.27
HCG27-201ENST00000383331 APLP2Q06481 763 aa22.96■■□□□ 1.27
HCG27-201ENST00000383331 JPH4Q96JJ6 628 aa22.96■■□□□ 1.27
HCG27-201ENST00000383331 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
HCG27-201ENST00000383331 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HCG27-201ENST00000383331 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.94■■□□□ 1.26
HCG27-201ENST00000383331 FMN1Q68DA7 1419 aa22.94■■□□□ 1.26
HCG27-201ENST00000383331 MAP3K1Q13233 1512 aa22.9■■□□□ 1.26
HCG27-201ENST00000383331 P3H3Q8IVL6 736 aa22.88■■□□□ 1.25
HCG27-201ENST00000383331 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.88■■□□□ 1.25
HCG27-201ENST00000383331 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HCG27-201ENST00000383331 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.86■■□□□ 1.25
HCG27-201ENST00000383331 KIAA0556O60303 1618 aa22.85■■□□□ 1.25
HCG27-201ENST00000383331 DISP1Q96F81 1524 aa22.83■■□□□ 1.25
HCG27-201ENST00000383331 TIAM1Q13009 1591 aa22.8■■□□□ 1.24
HCG27-201ENST00000383331 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.79■■□□□ 1.24
HCG27-201ENST00000383331 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.78■■□□□ 1.24
HCG27-201ENST00000383331 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
HCG27-201ENST00000383331 HECW1Q76N89 1606 aa22.7■■□□□ 1.23
HCG27-201ENST00000383331 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
HCG27-201ENST00000383331 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.68■■□□□ 1.22
HCG27-201ENST00000383331 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.67■■□□□ 1.22
HCG27-201ENST00000383331 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
HCG27-201ENST00000383331 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.66■■□□□ 1.22
HCG27-201ENST00000383331 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.65■■□□□ 1.22
HCG27-201ENST00000383331 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HCG27-201ENST00000383331 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.63■■□□□ 1.21
HCG27-201ENST00000383331 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.62■■□□□ 1.21
HCG27-201ENST00000383331 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HCG27-201ENST00000383331 PTPRGP23470 1445 aa22.61■■□□□ 1.21
HCG27-201ENST00000383331 MAPKBP1O60336 1514 aa22.59■■□□□ 1.21
HCG27-201ENST00000383331 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HCG27-201ENST00000383331 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.57■■□□□ 1.2
HCG27-201ENST00000383331 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.57■■□□□ 1.2
HCG27-201ENST00000383331 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HCG27-201ENST00000383331 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.54■■□□□ 1.2
HCG27-201ENST00000383331 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HCG27-201ENST00000383331 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HCG27-201ENST00000383331 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.53■■□□□ 1.2
HCG27-201ENST00000383331 ABCA8O94911 1581 aa22.53■■□□□ 1.2
HCG27-201ENST00000383331 DIP2BQ9P265 1576 aa22.51■■□□□ 1.19
HCG27-201ENST00000383331 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.5■■□□□ 1.19
HCG27-201ENST00000383331 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.5■■□□□ 1.19
HCG27-201ENST00000383331 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HCG27-201ENST00000383331 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HCG27-201ENST00000383331 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HCG27-201ENST00000383331 ABCC2Q92887 1545 aa22.46■■□□□ 1.19
HCG27-201ENST00000383331 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.45■■□□□ 1.18
HCG27-201ENST00000383331 UACAQ9BZF9 1416 aa22.44■■□□□ 1.18
HCG27-201ENST00000383331 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.44■■□□□ 1.18
HCG27-201ENST00000383331 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HCG27-201ENST00000383331 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.41■■□□□ 1.18
HCG27-201ENST00000383331 NCOA2Q15596 1464 aa22.4■■□□□ 1.18
HCG27-201ENST00000383331 ASXL2Q76L83 1435 aa22.38■■□□□ 1.17
HCG27-201ENST00000383331 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HCG27-201ENST00000383331 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
HCG27-201ENST00000383331 TSPOAP1O95153 1857 aa22.36■■□□□ 1.17
HCG27-201ENST00000383331 ATP10BO94823 1461 aa22.34■■□□□ 1.17
HCG27-201ENST00000383331 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HCG27-201ENST00000383331 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.33■■□□□ 1.17
HCG27-201ENST00000383331 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.33■■□□□ 1.16
HCG27-201ENST00000383331 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.31■■□□□ 1.16
HCG27-201ENST00000383331 ARID3CA6NKF2 412 aa22.31■■□□□ 1.16
HCG27-201ENST00000383331 KDM6BO15054 1643 aa22.29■■□□□ 1.16
HCG27-201ENST00000383331 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HCG27-201ENST00000383331 GLI2P10070 1586 aa22.26■■□□□ 1.15
HCG27-201ENST00000383331 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.26■■□□□ 1.15
HCG27-201ENST00000383331 MIA2Q96PC5 1412 aa22.26■■□□□ 1.15
HCG27-201ENST00000383331 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HCG27-201ENST00000383331 KIF14Q15058 1648 aa22.22■■□□□ 1.15
HCG27-201ENST00000383331 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HCG27-201ENST00000383331 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.21■■□□□ 1.15
HCG27-201ENST00000383331 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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