RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377060.7

CNNM3-202, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNNM3, Length 3,308 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3-202ENST00000377060 IGF1RP08069 1367 aa26.5■■□□□ 1.83
CNNM3-202ENST00000377060 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CNNM3-202ENST00000377060 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.48■■□□□ 1.83
CNNM3-202ENST00000377060 NEFLP07196 543 aa26.47■■□□□ 1.83
CNNM3-202ENST00000377060 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.45■■□□□ 1.82
CNNM3-202ENST00000377060 ANP32CO43423 234 aa26.43■■□□□ 1.82
CNNM3-202ENST00000377060 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CNNM3-202ENST00000377060 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.41■■□□□ 1.82
CNNM3-202ENST00000377060 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.4■■□□□ 1.82
CNNM3-202ENST00000377060 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.37■■□□□ 1.81
CNNM3-202ENST00000377060 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.37■■□□□ 1.81
CNNM3-202ENST00000377060 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.34■■□□□ 1.81
CNNM3-202ENST00000377060 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.34■■□□□ 1.81
CNNM3-202ENST00000377060 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.32■■□□□ 1.8
CNNM3-202ENST00000377060 TONSLQ96HA7 1378 aa26.31■■□□□ 1.8
CNNM3-202ENST00000377060 NCAPD3P42695 1498 aa26.3■■□□□ 1.8
CNNM3-202ENST00000377060 CFTRP13569 1480 aa26.27■■□□□ 1.8
CNNM3-202ENST00000377060 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.26■■□□□ 1.79
CNNM3-202ENST00000377060 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
CNNM3-202ENST00000377060 FOXD1Q16676 465 aa26.26■■□□□ 1.79
CNNM3-202ENST00000377060 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.25■■□□□ 1.79
CNNM3-202ENST00000377060 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CNNM3-202ENST00000377060 WDR97A6NE52 1622 aa26.24■■□□□ 1.79
CNNM3-202ENST00000377060 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.24■■□□□ 1.79
CNNM3-202ENST00000377060 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.22■■□□□ 1.79
CNNM3-202ENST00000377060 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.21■■□□□ 1.79
CNNM3-202ENST00000377060 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.2■■□□□ 1.78
CNNM3-202ENST00000377060 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CNNM3-202ENST00000377060 MAPKBP1O60336 1514 aa26.17■■□□□ 1.78
CNNM3-202ENST00000377060 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CNNM3-202ENST00000377060 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.12■■□□□ 1.77
CNNM3-202ENST00000377060 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.1■■□□□ 1.77
CNNM3-202ENST00000377060 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.09■■□□□ 1.77
CNNM3-202ENST00000377060 TIAM1Q13009 1591 aa26.08■■□□□ 1.77
CNNM3-202ENST00000377060 NESP48681 1621 aa26.05■■□□□ 1.76
CNNM3-202ENST00000377060 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CNNM3-202ENST00000377060 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26■■□□□ 1.75
CNNM3-202ENST00000377060 HMGXB3Q12766 1538 aa26■■□□□ 1.75
CNNM3-202ENST00000377060 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CNNM3-202ENST00000377060 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.96■■□□□ 1.75
CNNM3-202ENST00000377060 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
CNNM3-202ENST00000377060 CCDC184Q52MB2 194 aa25.95■■□□□ 1.74
CNNM3-202ENST00000377060 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CNNM3-202ENST00000377060 PTPRKQ15262 1439 aa25.9■■□□□ 1.74
CNNM3-202ENST00000377060 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.88■■□□□ 1.73
CNNM3-202ENST00000377060 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.88■■□□□ 1.73
CNNM3-202ENST00000377060 CCER2I3L3R5 266 aa25.87■■□□□ 1.73
CNNM3-202ENST00000377060 MRS2Q9HD23 443 aa25.86■■□□□ 1.73
CNNM3-202ENST00000377060 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
CNNM3-202ENST00000377060 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.85■■□□□ 1.73
CNNM3-202ENST00000377060 FBLN2P98095 1184 aa25.83■■□□□ 1.73
CNNM3-202ENST00000377060 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.82■■□□□ 1.72
CNNM3-202ENST00000377060 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CNNM3-202ENST00000377060 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.81■■□□□ 1.72
CNNM3-202ENST00000377060 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.8■■□□□ 1.72
CNNM3-202ENST00000377060 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.721e-6■■■□□ 16.1
CNNM3-202ENST00000377060 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CNNM3-202ENST00000377060 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CNNM3-202ENST00000377060 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CNNM3-202ENST00000377060 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.78■■□□□ 1.72
CNNM3-202ENST00000377060 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.72
CNNM3-202ENST00000377060 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.76■■□□□ 1.71
CNNM3-202ENST00000377060 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CNNM3-202ENST00000377060 FMN1Q68DA7 1419 aa25.75■■□□□ 1.71
CNNM3-202ENST00000377060 TOPBP1Q92547 1522 aa25.71■■□□□ 1.71
CNNM3-202ENST00000377060 NCOA2Q15596 1464 aa25.71■■□□□ 1.71
CNNM3-202ENST00000377060 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.68■■□□□ 1.7
CNNM3-202ENST00000377060 NAIPQ13075 1403 aa25.68■■□□□ 1.7
CNNM3-202ENST00000377060 UACAQ9BZF9 1416 aa25.67■■□□□ 1.7
CNNM3-202ENST00000377060 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.67■■□□□ 1.7
CNNM3-202ENST00000377060 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.67■■□□□ 1.7
CNNM3-202ENST00000377060 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.64■■□□□ 1.7
CNNM3-202ENST00000377060 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.63■■□□□ 1.69
CNNM3-202ENST00000377060 MAP3K1Q13233 1512 aa25.62■■□□□ 1.69
CNNM3-202ENST00000377060 MSH5O43196 834 aa25.61■■□□□ 1.69
CNNM3-202ENST00000377060 HFM1A2PYH4 1435 aa25.61■■□□□ 1.69
CNNM3-202ENST00000377060 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.57■■□□□ 1.68
CNNM3-202ENST00000377060 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CNNM3-202ENST00000377060 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.56■■□□□ 1.68
CNNM3-202ENST00000377060 NBR1Q14596 966 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM3-202ENST00000377060 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.5■■□□□ 1.67
CNNM3-202ENST00000377060 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CNNM3-202ENST00000377060 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CNNM3-202ENST00000377060 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.48■■□□□ 1.67
CNNM3-202ENST00000377060 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CNNM3-202ENST00000377060 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.47■■□□□ 1.67
CNNM3-202ENST00000377060 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.47■■□□□ 1.67
CNNM3-202ENST00000377060 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.45■■□□□ 1.67
CNNM3-202ENST00000377060 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.45■■□□□ 1.67
CNNM3-202ENST00000377060 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.45■■□□□ 1.66
CNNM3-202ENST00000377060 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CNNM3-202ENST00000377060 PKD2Q13563 968 aa25.43■■□□□ 1.66
CNNM3-202ENST00000377060 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.43■■□□□ 1.66
CNNM3-202ENST00000377060 CCDC7Q96M83 1385 aa25.41■■□□□ 1.66
CNNM3-202ENST00000377060 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.665e-7■□□□□ 9.7
CNNM3-202ENST00000377060 TMC1Q8TDI8 760 aa25.4■■□□□ 1.66
CNNM3-202ENST00000377060 RGL3Q3MIN7 710 aa25.4■■□□□ 1.66
CNNM3-202ENST00000377060 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CNNM3-202ENST00000377060 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.38■■□□□ 1.65
CNNM3-202ENST00000377060 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
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