RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373209.2

PRF1-201, Transcript of perforin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRF1, Length 2,492 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1-201ENST00000373209 MIER1Q8N108 512 aa22.34■■□□□ 1.17
PRF1-201ENST00000373209 TIAM1Q13009 1591 aa22.33■■□□□ 1.16
PRF1-201ENST00000373209 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.29■■□□□ 1.16
PRF1-201ENST00000373209 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.28■■□□□ 1.16
PRF1-201ENST00000373209 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PRF1-201ENST00000373209 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PRF1-201ENST00000373209 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.25■■□□□ 1.15
PRF1-201ENST00000373209 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.24■■□□□ 1.15
PRF1-201ENST00000373209 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.24■■□□□ 1.15
PRF1-201ENST00000373209 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PRF1-201ENST00000373209 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PRF1-201ENST00000373209 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PRF1-201ENST00000373209 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.19■■□□□ 1.14
PRF1-201ENST00000373209 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.16■■□□□ 1.14
PRF1-201ENST00000373209 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.15■■□□□ 1.14
PRF1-201ENST00000373209 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.15■■□□□ 1.14
PRF1-201ENST00000373209 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.15■■□□□ 1.14
PRF1-201ENST00000373209 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.14■■□□□ 1.14
PRF1-201ENST00000373209 MAP3K1Q13233 1512 aa22.14■■□□□ 1.13
PRF1-201ENST00000373209 WDR97A6NE52 1622 aa22.13■■□□□ 1.13
PRF1-201ENST00000373209 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.13■■□□□ 1.13
PRF1-201ENST00000373209 CUL7Q14999 1698 aa22.12■■□□□ 1.13
PRF1-201ENST00000373209 MAPKBP1O60336 1514 aa22.08■■□□□ 1.13
PRF1-201ENST00000373209 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.06■■□□□ 1.12
PRF1-201ENST00000373209 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.05■■□□□ 1.12
PRF1-201ENST00000373209 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.04■■□□□ 1.12
PRF1-201ENST00000373209 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.04■■□□□ 1.12
PRF1-201ENST00000373209 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.03■■□□□ 1.12
PRF1-201ENST00000373209 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.03■■□□□ 1.12
PRF1-201ENST00000373209 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.03■■□□□ 1.12
PRF1-201ENST00000373209 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.01■■□□□ 1.11
PRF1-201ENST00000373209 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.01■■□□□ 1.11
PRF1-201ENST00000373209 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.98■■□□□ 1.11
PRF1-201ENST00000373209 FMN1Q68DA7 1419 aa21.94■■□□□ 1.1
PRF1-201ENST00000373209 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PRF1-201ENST00000373209 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
PRF1-201ENST00000373209 SAMD9Q5K651 1589 aa21.92■■□□□ 1.1
PRF1-201ENST00000373209 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.92■■□□□ 1.1
PRF1-201ENST00000373209 ARID3CA6NKF2 412 aa21.9■■□□□ 1.1
PRF1-201ENST00000373209 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.88■■□□□ 1.09
PRF1-201ENST00000373209 PTPRKQ15262 1439 aa21.87■■□□□ 1.09
PRF1-201ENST00000373209 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PRF1-201ENST00000373209 GRIN2BQ13224 1484 aa21.84■■□□□ 1.09
PRF1-201ENST00000373209 PBRM1Q86U86 1689 aa21.84■■□□□ 1.09
PRF1-201ENST00000373209 NCOA2Q15596 1464 aa21.82■■□□□ 1.08
PRF1-201ENST00000373209 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.81■■□□□ 1.08
PRF1-201ENST00000373209 KCNH8Q96L42 1107 aa21.81■■□□□ 1.08
PRF1-201ENST00000373209 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PRF1-201ENST00000373209 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.75■■□□□ 1.07
PRF1-201ENST00000373209 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.74■■□□□ 1.07
PRF1-201ENST00000373209 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.74■■□□□ 1.07
PRF1-201ENST00000373209 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
PRF1-201ENST00000373209 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PRF1-201ENST00000373209 ADAMTS12P58397 1594 aa21.72■■□□□ 1.07
PRF1-201ENST00000373209 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PRF1-201ENST00000373209 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.72■■□□□ 1.07
PRF1-201ENST00000373209 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PRF1-201ENST00000373209 IQGAP2Q13576 1575 aa21.71■■□□□ 1.07
PRF1-201ENST00000373209 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.71■■□□□ 1.07
PRF1-201ENST00000373209 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.7■■□□□ 1.06
PRF1-201ENST00000373209 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.69■■□□□ 1.06
PRF1-201ENST00000373209 HFM1A2PYH4 1435 aa21.67■■□□□ 1.06
PRF1-201ENST00000373209 NAIPQ13075 1403 aa21.67■■□□□ 1.06
PRF1-201ENST00000373209 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.67■■□□□ 1.06
PRF1-201ENST00000373209 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PRF1-201ENST00000373209 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PRF1-201ENST00000373209 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PRF1-201ENST00000373209 HECW1Q76N89 1606 aa21.62■■□□□ 1.05
PRF1-201ENST00000373209 ARHGEF11O15085 1522 aa21.61■■□□□ 1.05
PRF1-201ENST00000373209 UACAQ9BZF9 1416 aa21.61■■□□□ 1.05
PRF1-201ENST00000373209 TONSLQ96HA7 1378 aa21.6■■□□□ 1.05
PRF1-201ENST00000373209 ERCC6Q03468 1493 aa21.59■■□□□ 1.05
PRF1-201ENST00000373209 KDM6BO15054 1643 aa21.59■■□□□ 1.05
PRF1-201ENST00000373209 WDR62O43379 1518 aa21.57■■□□□ 1.04
PRF1-201ENST00000373209 TRIM52Q96A61 297 aa21.54■■□□□ 1.04
PRF1-201ENST00000373209 IFT140Q96RY7 1462 aa21.54■■□□□ 1.04
PRF1-201ENST00000373209 FOXD1Q16676 465 aa21.53■■□□□ 1.04
PRF1-201ENST00000373209 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.53■■□□□ 1.04
PRF1-201ENST00000373209 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PRF1-201ENST00000373209 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PRF1-201ENST00000373209 DISP1Q96F81 1524 aa21.52■■□□□ 1.04
PRF1-201ENST00000373209 FBLN2P98095 1184 aa21.51■■□□□ 1.03
PRF1-201ENST00000373209 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PRF1-201ENST00000373209 KIAA0556O60303 1618 aa21.49■■□□□ 1.03
PRF1-201ENST00000373209 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRF1-201ENST00000373209 GRIN2AQ12879 1464 aa21.47■■□□□ 1.03
PRF1-201ENST00000373209 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.46■■□□□ 1.03
PRF1-201ENST00000373209 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.46■■□□□ 1.03
PRF1-201ENST00000373209 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
PRF1-201ENST00000373209 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.45■■□□□ 1.02
PRF1-201ENST00000373209 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PRF1-201ENST00000373209 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PRF1-201ENST00000373209 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.4■■□□□ 1.02
PRF1-201ENST00000373209 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.4■■□□□ 1.02
PRF1-201ENST00000373209 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.39■■□□□ 1.01
PRF1-201ENST00000373209 MIA2Q96PC5 1412 aa21.39■■□□□ 1.01
PRF1-201ENST00000373209 CEP170Q5SW79 1584 aa21.39■■□□□ 1.01
PRF1-201ENST00000373209 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PRF1-201ENST00000373209 DAPK1P53355 1430 aa21.36■■□□□ 1.01
PRF1-201ENST00000373209 ABCC5O15440 1437 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms