RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL34Q8N239 644 aa11.33□□□□□ -0.6
CTPS1-201ENST00000372616 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC88BA6NC98 1476 aa11.3□□□□□ -0.6
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CTPS1-201ENST00000372616 MYT1Q01538 1121 aa11.27□□□□□ -0.61
CTPS1-201ENST00000372616 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CTPS1-201ENST00000372616 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CTPS1-201ENST00000372616 CAPN15O75808 1086 aa11.25□□□□□ -0.61
CTPS1-201ENST00000372616 RGL2O15211 777 aa11.24□□□□□ -0.61
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CTPS1-201ENST00000372616 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.13□□□□□ -0.63
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CTPS1-201ENST00000372616 RNF39Q9H2S5 420 aa11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-201ENST00000372616 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-201ENST00000372616 ABCC8Q09428 1581 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-201ENST00000372616 OSCARQ8IYS5 282 aa11□□□□□ -0.65
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CTPS1-201ENST00000372616 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.95□□□□□ -0.66
CTPS1-201ENST00000372616 TOP2BQ02880 1626 aa10.95□□□□□ -0.66
CTPS1-201ENST00000372616 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.95□□□□□ -0.66
CTPS1-201ENST00000372616 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CTPS1-201ENST00000372616 NESP48681 1621 aa10.93□□□□□ -0.66
CTPS1-201ENST00000372616 SYNJ1O43426 1573 aa10.93□□□□□ -0.66
CTPS1-201ENST00000372616 NBR1Q14596 966 aa10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-201ENST00000372616 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.91□□□□□ -0.66
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CTPS1-201ENST00000372616 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.89□□□□□ -0.67
CTPS1-201ENST00000372616 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.89□□□□□ -0.67
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CTPS1-201ENST00000372616 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CTPS1-201ENST00000372616 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.87□□□□□ -0.67
CTPS1-201ENST00000372616 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.86□□□□□ -0.67
CTPS1-201ENST00000372616 SPDYE2BA6NHP3 402 aa10.85□□□□□ -0.67
CTPS1-201ENST00000372616 SPDYE6P0CI01 402 aa10.85□□□□□ -0.67
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CTPS1-201ENST00000372616 SPDYE2Q495Y8 402 aa10.85□□□□□ -0.67
CTPS1-201ENST00000372616 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
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CTPS1-201ENST00000372616 TOPBP1Q92547 1522 aa10.82□□□□□ -0.68
CTPS1-201ENST00000372616 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.82□□□□□ -0.68
CTPS1-201ENST00000372616 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.8□□□□□ -0.68
CTPS1-201ENST00000372616 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.79□□□□□ -0.68
CTPS1-201ENST00000372616 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
CTPS1-201ENST00000372616 ERCC6Q03468 1493 aa10.78□□□□□ -0.68
CTPS1-201ENST00000372616 SOGA1O94964 1423 aa10.78□□□□□ -0.68
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHG5O94827 1062 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-201ENST00000372616 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-201ENST00000372616 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-201ENST00000372616 KIF27Q86VH2 1401 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-201ENST00000372616 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-201ENST00000372616 WDR62O43379 1518 aa10.75□□□□□ -0.69
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CTPS1-201ENST00000372616 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.75□□□□□ -0.69
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CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-201ENST00000372616 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-201ENST00000372616 NEUROD1Q13562 356 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-201ENST00000372616 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.72□□□□□ -0.69
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CTPS1-201ENST00000372616 KIF21BO75037 1637 aa10.71□□□□□ -0.7
CTPS1-201ENST00000372616 WDR97A6NE52 1622 aa10.7□□□□□ -0.7
CTPS1-201ENST00000372616 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.69□□□□□ -0.7
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CTPS1-201ENST00000372616 STK25O00506 426 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA3Q08378 1498 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-201ENST00000372616 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-201ENST00000372616 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-201ENST00000372616 IFT140Q96RY7 1462 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-201ENST00000372616 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-201ENST00000372616 NUBP1P53384 320 aa10.66□□□□□ -0.7
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CTPS1-201ENST00000372616 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-201ENST00000372616 CUL7Q14999 1698 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-201ENST00000372616 PRXQ9BXM0 1461 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-201ENST00000372616 GSE1Q14687 1217 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-201ENST00000372616 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-201ENST00000372616 IGF1RP08069 1367 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-201ENST00000372616 TNIKQ9UKE5 1360 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-201ENST00000372616 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-201ENST00000372616 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-201ENST00000372616 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.59□□□□□ -0.71
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