RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371417.3

ARRDC1-AS1-201, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,409 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ARHGEF11O15085 1522 aa35.27■■■■□ 3.24
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.2■■■■□ 3.23
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 APLP2Q06481 763 aa34.35■■■■□ 3.09
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.29■■■■□ 3.08
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.28■■■■□ 3.08
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.22■■■■□ 3.07
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KCNH8Q96L42 1107 aa34.19■■■■□ 3.06
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.18■■■■□ 3.06
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DIP2BQ9P265 1576 aa34.1■■■■□ 3.05
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GLI2P10070 1586 aa34.06■■■■□ 3.04
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NCOA2Q15596 1464 aa34■■■■□ 3.03
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.99■■■■□ 3.03
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.93■■■■□ 3.02
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CD109Q6YHK3 1445 aa33.91■■■■□ 3.02
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.89■■■■□ 3.02
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLCH2O75038 1416 aa33.85■■■■□ 3.01
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.85■■■■□ 3.01
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.84■■■■□ 3.01
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PREX2Q70Z35 1606 aa33.81■■■■□ 3
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.79■■■■□ 3
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.79■■■■□ 3
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.78■■■■□ 3
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TSPOAP1O95153 1857 aa33.78■■■■□ 3
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