RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370587.5

MCOLN3-202, Transcript of mucolipin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MCOLN3, Length 2,953 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3-202ENST00000370587 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3-202ENST00000370587 NESP48681 1621 aa16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3-202ENST00000370587 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.41■□□□□ 0.22
MCOLN3-202ENST00000370587 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.4■□□□□ 0.22
MCOLN3-202ENST00000370587 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3-202ENST00000370587 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3-202ENST00000370587 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3-202ENST00000370587 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3-202ENST00000370587 WDR97A6NE52 1622 aa16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3-202ENST00000370587 ITGAEP38570 1179 aa16.33■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.32■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 MIER1Q8N108 512 aa16.31■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.31■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 P3H3Q8IVL6 736 aa16.3■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.29■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.29■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.29■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.29■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.28■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.27■□□□□ 0.2
MCOLN3-202ENST00000370587 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
MCOLN3-202ENST00000370587 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.25■□□□□ 0.19
MCOLN3-202ENST00000370587 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
MCOLN3-202ENST00000370587 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
MCOLN3-202ENST00000370587 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.25■□□□□ 0.19
MCOLN3-202ENST00000370587 FMN1Q68DA7 1419 aa16.24■□□□□ 0.19
MCOLN3-202ENST00000370587 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3-202ENST00000370587 MAPKBP1O60336 1514 aa16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3-202ENST00000370587 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3-202ENST00000370587 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3-202ENST00000370587 SAMD9Q5K651 1589 aa16.21■□□□□ 0.18
MCOLN3-202ENST00000370587 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
MCOLN3-202ENST00000370587 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3-202ENST00000370587 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3-202ENST00000370587 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
MCOLN3-202ENST00000370587 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.14■□□□□ 0.17
MCOLN3-202ENST00000370587 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
MCOLN3-202ENST00000370587 PBRM1Q86U86 1689 aa16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3-202ENST00000370587 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3-202ENST00000370587 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.12■□□□□ 0.17
MCOLN3-202ENST00000370587 GRIN2BQ13224 1484 aa16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3-202ENST00000370587 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3-202ENST00000370587 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3-202ENST00000370587 NCOA2Q15596 1464 aa16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3-202ENST00000370587 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3-202ENST00000370587 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3-202ENST00000370587 ADAMTS12P58397 1594 aa16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3-202ENST00000370587 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3-202ENST00000370587 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.02■□□□□ 0.16
MCOLN3-202ENST00000370587 IQGAP2Q13576 1575 aa16.02■□□□□ 0.16
MCOLN3-202ENST00000370587 HECW1Q76N89 1606 aa16.02■□□□□ 0.15
MCOLN3-202ENST00000370587 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.02■□□□□ 0.15
MCOLN3-202ENST00000370587 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3-202ENST00000370587 HFM1A2PYH4 1435 aa16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3-202ENST00000370587 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16■□□□□ 0.15
MCOLN3-202ENST00000370587 ARHGEF11O15085 1522 aa15.98■□□□□ 0.15
MCOLN3-202ENST00000370587 PTPRKQ15262 1439 aa15.97■□□□□ 0.15
MCOLN3-202ENST00000370587 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.97■□□□□ 0.15
MCOLN3-202ENST00000370587 UACAQ9BZF9 1416 aa15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3-202ENST00000370587 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.96■□□□□ 0.15
MCOLN3-202ENST00000370587 NAIPQ13075 1403 aa15.94■□□□□ 0.14
MCOLN3-202ENST00000370587 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3-202ENST00000370587 IFT140Q96RY7 1462 aa15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3-202ENST00000370587 WDR62O43379 1518 aa15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3-202ENST00000370587 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3-202ENST00000370587 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3-202ENST00000370587 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3-202ENST00000370587 TONSLQ96HA7 1378 aa15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3-202ENST00000370587 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
MCOLN3-202ENST00000370587 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
MCOLN3-202ENST00000370587 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
MCOLN3-202ENST00000370587 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
MCOLN3-202ENST00000370587 AKNAQ7Z591 1439 aa15.85■□□□□ 0.13
MCOLN3-202ENST00000370587 MIA2Q96PC5 1412 aa15.85■□□□□ 0.13
MCOLN3-202ENST00000370587 KIAA0556O60303 1618 aa15.85■□□□□ 0.13
MCOLN3-202ENST00000370587 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.84■□□□□ 0.13
MCOLN3-202ENST00000370587 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
MCOLN3-202ENST00000370587 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3-202ENST00000370587 DISP1Q96F81 1524 aa15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3-202ENST00000370587 GRIN2AQ12879 1464 aa15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3-202ENST00000370587 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3-202ENST00000370587 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3-202ENST00000370587 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3-202ENST00000370587 ARID3CA6NKF2 412 aa15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3-202ENST00000370587 KCNH8Q96L42 1107 aa15.78■□□□□ 0.12
MCOLN3-202ENST00000370587 KDM6BO15054 1643 aa15.77■□□□□ 0.12
MCOLN3-202ENST00000370587 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.77■□□□□ 0.11
MCOLN3-202ENST00000370587 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3-202ENST00000370587 TRIM52Q96A61 297 aa15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3-202ENST00000370587 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3-202ENST00000370587 ANP32CO43423 234 aa15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3-202ENST00000370587 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3-202ENST00000370587 ERCC6Q03468 1493 aa15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3-202ENST00000370587 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3-202ENST00000370587 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3-202ENST00000370587 DAPK1P53355 1430 aa15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3-202ENST00000370587 CCER2I3L3R5 266 aa15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3-202ENST00000370587 ROCK1Q13464 1354 aa15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms