RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
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LTV1-201ENST00000367576 CEP170Q5SW79 1584 aa28.31■■■□□ 2.12
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LTV1-201ENST00000367576 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
LTV1-201ENST00000367576 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
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LTV1-201ENST00000367576 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
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LTV1-201ENST00000367576 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
LTV1-201ENST00000367576 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.88■■□□□ 1.89
LTV1-201ENST00000367576 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.87■■□□□ 1.89
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