RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366974.8

TATDN3-202, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TATDN3, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-202ENST00000366974 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TATDN3-202ENST00000366974 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.82■■□□□ 1.08
TATDN3-202ENST00000366974 WDR62O43379 1518 aa21.8■■□□□ 1.08
TATDN3-202ENST00000366974 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.79■■□□□ 1.08
TATDN3-202ENST00000366974 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TATDN3-202ENST00000366974 ERCC6Q03468 1493 aa21.75■■□□□ 1.07
TATDN3-202ENST00000366974 PBRM1Q86U86 1689 aa21.72■■□□□ 1.07
TATDN3-202ENST00000366974 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.71■■□□□ 1.07
TATDN3-202ENST00000366974 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TATDN3-202ENST00000366974 IFT140Q96RY7 1462 aa21.69■■□□□ 1.06
TATDN3-202ENST00000366974 APLP2Q06481 763 aa21.68■■□□□ 1.06
TATDN3-202ENST00000366974 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.061e-6■■■■□ 20.7
TATDN3-202ENST00000366974 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TATDN3-202ENST00000366974 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TATDN3-202ENST00000366974 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.61■■□□□ 1.05
TATDN3-202ENST00000366974 GRIN2BQ13224 1484 aa21.59■■□□□ 1.05
TATDN3-202ENST00000366974 MIER1Q8N108 512 aa21.59■■□□□ 1.05
TATDN3-202ENST00000366974 ADAMTS12P58397 1594 aa21.59■■□□□ 1.05
TATDN3-202ENST00000366974 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.58■■□□□ 1.04
TATDN3-202ENST00000366974 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.57■■□□□ 1.04
TATDN3-202ENST00000366974 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TATDN3-202ENST00000366974 P3H3Q8IVL6 736 aa21.52■■□□□ 1.04
TATDN3-202ENST00000366974 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TATDN3-202ENST00000366974 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.51■■□□□ 1.03
TATDN3-202ENST00000366974 SAMD9Q5K651 1589 aa21.48■■□□□ 1.03
TATDN3-202ENST00000366974 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TATDN3-202ENST00000366974 MAP3K1Q13233 1512 aa21.46■■□□□ 1.03
TATDN3-202ENST00000366974 TIAM1Q13009 1591 aa21.46■■□□□ 1.03
TATDN3-202ENST00000366974 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.45■■□□□ 1.02
TATDN3-202ENST00000366974 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TATDN3-202ENST00000366974 IQGAP2Q13576 1575 aa21.4■■□□□ 1.02
TATDN3-202ENST00000366974 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.4■■□□□ 1.02
TATDN3-202ENST00000366974 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.39■■□□□ 1.02
TATDN3-202ENST00000366974 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.38■■□□□ 1.01
TATDN3-202ENST00000366974 FMN1Q68DA7 1419 aa21.38■■□□□ 1.01
TATDN3-202ENST00000366974 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TATDN3-202ENST00000366974 GRIN2AQ12879 1464 aa21.35■■□□□ 1.01
TATDN3-202ENST00000366974 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.35■■□□□ 1.01
TATDN3-202ENST00000366974 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TATDN3-202ENST00000366974 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TATDN3-202ENST00000366974 SYNJ2O15056 1496 aa21.3■■□□□ 1
TATDN3-202ENST00000366974 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.29■■□□□ 1
TATDN3-202ENST00000366974 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.29■■□□□ 1
TATDN3-202ENST00000366974 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.28■■□□□ 1
TATDN3-202ENST00000366974 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
TATDN3-202ENST00000366974 CEP170Q5SW79 1584 aa21.24■□□□□ 0.99
TATDN3-202ENST00000366974 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
TATDN3-202ENST00000366974 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.22■□□□□ 0.99
TATDN3-202ENST00000366974 KIAA0556O60303 1618 aa21.19■□□□□ 0.98
TATDN3-202ENST00000366974 DISP1Q96F81 1524 aa21.19■□□□□ 0.98
TATDN3-202ENST00000366974 FBLN2P98095 1184 aa21.18■□□□□ 0.98
TATDN3-202ENST00000366974 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.18■□□□□ 0.98
TATDN3-202ENST00000366974 NUP160Q12769 1436 aa21.17■□□□□ 0.98
TATDN3-202ENST00000366974 HECW1Q76N89 1606 aa21.15■□□□□ 0.98
TATDN3-202ENST00000366974 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
TATDN3-202ENST00000366974 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.11■□□□□ 0.97
TATDN3-202ENST00000366974 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.1■□□□□ 0.97
TATDN3-202ENST00000366974 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
TATDN3-202ENST00000366974 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.07■□□□□ 0.96
TATDN3-202ENST00000366974 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.06■□□□□ 0.96
TATDN3-202ENST00000366974 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.05■□□□□ 0.96
TATDN3-202ENST00000366974 CHD1O14646 1710 aa21.05■□□□□ 0.96
TATDN3-202ENST00000366974 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
TATDN3-202ENST00000366974 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.04■□□□□ 0.96
TATDN3-202ENST00000366974 JPH4Q96JJ6 628 aa21.03■□□□□ 0.96
TATDN3-202ENST00000366974 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
TATDN3-202ENST00000366974 ITGAEP38570 1179 aa21.03■□□□□ 0.96
TATDN3-202ENST00000366974 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.03■□□□□ 0.96
TATDN3-202ENST00000366974 NCOA2Q15596 1464 aa21.02■□□□□ 0.96
TATDN3-202ENST00000366974 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
TATDN3-202ENST00000366974 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21■□□□□ 0.95
TATDN3-202ENST00000366974 FGD6Q6ZV73 1430 aa21■□□□□ 0.95
TATDN3-202ENST00000366974 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
TATDN3-202ENST00000366974 ARHGEF11O15085 1522 aa20.98■□□□□ 0.95
TATDN3-202ENST00000366974 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
TATDN3-202ENST00000366974 ARID3CA6NKF2 412 aa20.96■□□□□ 0.95
TATDN3-202ENST00000366974 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.95■□□□□ 0.94
TATDN3-202ENST00000366974 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.92■□□□□ 0.94
TATDN3-202ENST00000366974 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.88■□□□□ 0.93
TATDN3-202ENST00000366974 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.88■□□□□ 0.93
TATDN3-202ENST00000366974 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TATDN3-202ENST00000366974 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.87■□□□□ 0.93
TATDN3-202ENST00000366974 SHROOM2Q13796 1616 aa20.86■□□□□ 0.93
TATDN3-202ENST00000366974 ABCA8O94911 1581 aa20.86■□□□□ 0.93
TATDN3-202ENST00000366974 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
TATDN3-202ENST00000366974 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
TATDN3-202ENST00000366974 PTPRKQ15262 1439 aa20.8■□□□□ 0.92
TATDN3-202ENST00000366974 MIA2Q96PC5 1412 aa20.79■□□□□ 0.92
TATDN3-202ENST00000366974 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TATDN3-202ENST00000366974 PTPRGP23470 1445 aa20.77■□□□□ 0.92
TATDN3-202ENST00000366974 NEFLP07196 543 aa20.77■□□□□ 0.91
TATDN3-202ENST00000366974 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.76■□□□□ 0.91
TATDN3-202ENST00000366974 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.76■□□□□ 0.91
TATDN3-202ENST00000366974 ATP10BO94823 1461 aa20.74■□□□□ 0.91
TATDN3-202ENST00000366974 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.74■□□□□ 0.91
TATDN3-202ENST00000366974 KIF14Q15058 1648 aa20.73■□□□□ 0.91
TATDN3-202ENST00000366974 FKBP8Q14318 412 aa20.72■□□□□ 0.91
TATDN3-202ENST00000366974 HFM1A2PYH4 1435 aa20.71■□□□□ 0.91
TATDN3-202ENST00000366974 BCL11AQ9H165 835 aa20.7■□□□□ 0.9
TATDN3-202ENST00000366974 MAPKBP1O60336 1514 aa20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms