RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366934.3

GPATCH2-201, Transcript of G-patch domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GPATCH2, Length 3,218 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH2-201ENST00000366934 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.45■□□□□ 0.06
GPATCH2-201ENST00000366934 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.45■□□□□ 0.06
GPATCH2-201ENST00000366934 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.44■□□□□ 0.06
GPATCH2-201ENST00000366934 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.43■□□□□ 0.06
GPATCH2-201ENST00000366934 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
GPATCH2-201ENST00000366934 TOP2BQ02880 1626 aa15.43■□□□□ 0.06
GPATCH2-201ENST00000366934 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.42■□□□□ 0.06
GPATCH2-201ENST00000366934 CUX1P39880 1505 aa15.42■□□□□ 0.06
GPATCH2-201ENST00000366934 IGF1RP08069 1367 aa15.4■□□□□ 0.06
GPATCH2-201ENST00000366934 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
GPATCH2-201ENST00000366934 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.4■□□□□ 0.06
GPATCH2-201ENST00000366934 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.06
GPATCH2-201ENST00000366934 TONSLQ96HA7 1378 aa15.39■□□□□ 0.05
GPATCH2-201ENST00000366934 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.38■□□□□ 0.05
GPATCH2-201ENST00000366934 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.37■□□□□ 0.05
GPATCH2-201ENST00000366934 WDR97A6NE52 1622 aa15.37■□□□□ 0.05
GPATCH2-201ENST00000366934 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.35■□□□□ 0.05
GPATCH2-201ENST00000366934 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.34■□□□□ 0.05
GPATCH2-201ENST00000366934 MAPKBP1O60336 1514 aa15.32■□□□□ 0.04
GPATCH2-201ENST00000366934 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.32■□□□□ 0.04
GPATCH2-201ENST00000366934 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.32■□□□□ 0.04
GPATCH2-201ENST00000366934 FOXD1Q16676 465 aa15.31■□□□□ 0.04
GPATCH2-201ENST00000366934 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.28■□□□□ 0.04
GPATCH2-201ENST00000366934 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.27■□□□□ 0.04
GPATCH2-201ENST00000366934 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 CCER2I3L3R5 266 aa15.24■□□□□ 0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 CCDC184Q52MB2 194 aa15.23■□□□□ 0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 BCL11AQ9H165 835 aa15.22■□□□□ 0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 CFTRP13569 1480 aa15.21■□□□□ 0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.21■□□□□ 0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.2■□□□□ 0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.2■□□□□ 0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.2■□□□□ 0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 NCAPD3P42695 1498 aa15.2■□□□□ 0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.2■□□□□ 0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 TIAM1Q13009 1591 aa15.2■□□□□ 0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 MSH5O43196 834 aa15.18■□□□□ 0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 MRS2Q9HD23 443 aa15.17■□□□□ 0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.17■□□□□ 0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.16■□□□□ 0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 HMGXB3Q12766 1538 aa15.15■□□□□ 0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.13■□□□□ 0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 PTPRKQ15262 1439 aa15.12■□□□□ 0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.11■□□□□ 0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.11■□□□□ 0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.11■□□□□ 0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.09■□□□□ 0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 NBR1Q14596 966 aa15.08■□□□□ 0
GPATCH2-201ENST00000366934 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.07■□□□□ 0
GPATCH2-201ENST00000366934 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.05■□□□□ 0
GPATCH2-201ENST00000366934 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
GPATCH2-201ENST00000366934 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.03■□□□□ -0
GPATCH2-201ENST00000366934 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
GPATCH2-201ENST00000366934 NESP48681 1621 aa15.02□□□□□ -0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.02□□□□□ -0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.01□□□□□ -0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 UACAQ9BZF9 1416 aa15.01□□□□□ -0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15□□□□□ -0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 NBPF8Q3BBV2 869 aa15□□□□□ -0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 NAIPQ13075 1403 aa14.99□□□□□ -0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 FMN1Q68DA7 1419 aa14.98□□□□□ -0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.97□□□□□ -0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 NCOA2Q15596 1464 aa14.96□□□□□ -0.01
GPATCH2-201ENST00000366934 MAP3K1Q13233 1512 aa14.96□□□□□ -0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 HFM1A2PYH4 1435 aa14.95□□□□□ -0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.94□□□□□ -0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.94□□□□□ -0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.93□□□□□ -0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 FBLN2P98095 1184 aa14.91□□□□□ -0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.91□□□□□ -0.02
GPATCH2-201ENST00000366934 CCDC7Q96M83 1385 aa14.89□□□□□ -0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 TMC1Q8TDI8 760 aa14.89□□□□□ -0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.89□□□□□ -0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 TOPBP1Q92547 1522 aa14.87□□□□□ -0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 AKNAQ7Z591 1439 aa14.86□□□□□ -0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.86□□□□□ -0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.86□□□□□ -0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.84□□□□□ -0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
GPATCH2-201ENST00000366934 PKD2Q13563 968 aa14.82□□□□□ -0.04
GPATCH2-201ENST00000366934 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.81□□□□□ -0.04
GPATCH2-201ENST00000366934 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GPATCH2-201ENST00000366934 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.81□□□□□ -0.04
GPATCH2-201ENST00000366934 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.81□□□□□ -0.04
GPATCH2-201ENST00000366934 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.81□□□□□ -0.04
GPATCH2-201ENST00000366934 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms