RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357631.6

LRRC20-202, Transcript of leucine rich repeat containing 20, humanhuman

TSL 2

Gene LRRC20, Length 2,906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC20-202ENST00000357631 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26■■□□□ 1.75
LRRC20-202ENST00000357631 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
LRRC20-202ENST00000357631 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26■■□□□ 1.75
LRRC20-202ENST00000357631 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.99■■□□□ 1.75
LRRC20-202ENST00000357631 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
LRRC20-202ENST00000357631 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.98■■□□□ 1.75
LRRC20-202ENST00000357631 MAP3K1Q13233 1512 aa25.97■■□□□ 1.75
LRRC20-202ENST00000357631 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
LRRC20-202ENST00000357631 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
LRRC20-202ENST00000357631 CUL7Q14999 1698 aa25.93■■□□□ 1.74
LRRC20-202ENST00000357631 MIER1Q8N108 512 aa25.92■■□□□ 1.74
LRRC20-202ENST00000357631 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.92■■□□□ 1.74
LRRC20-202ENST00000357631 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
LRRC20-202ENST00000357631 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
LRRC20-202ENST00000357631 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.88■■□□□ 1.73
LRRC20-202ENST00000357631 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.87■■□□□ 1.73
LRRC20-202ENST00000357631 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.87■■□□□ 1.73
LRRC20-202ENST00000357631 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.86■■□□□ 1.73
LRRC20-202ENST00000357631 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.85■■□□□ 1.73
LRRC20-202ENST00000357631 WDR97A6NE52 1622 aa25.85■■□□□ 1.73
LRRC20-202ENST00000357631 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.81■■□□□ 1.72
LRRC20-202ENST00000357631 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.81■■□□□ 1.72
LRRC20-202ENST00000357631 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.8■■□□□ 1.72
LRRC20-202ENST00000357631 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.79■■□□□ 1.72
LRRC20-202ENST00000357631 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.79■■□□□ 1.72
LRRC20-202ENST00000357631 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.78■■□□□ 1.72
LRRC20-202ENST00000357631 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.76■■□□□ 1.71
LRRC20-202ENST00000357631 FMN1Q68DA7 1419 aa25.74■■□□□ 1.71
LRRC20-202ENST00000357631 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
LRRC20-202ENST00000357631 MAPKBP1O60336 1514 aa25.67■■□□□ 1.7
LRRC20-202ENST00000357631 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.66■■□□□ 1.7
LRRC20-202ENST00000357631 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.66■■□□□ 1.7
LRRC20-202ENST00000357631 SAMD9Q5K651 1589 aa25.62■■□□□ 1.69
LRRC20-202ENST00000357631 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
LRRC20-202ENST00000357631 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.59■■□□□ 1.69
LRRC20-202ENST00000357631 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.57■■□□□ 1.68
LRRC20-202ENST00000357631 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.54■■□□□ 1.68
LRRC20-202ENST00000357631 GRIN2BQ13224 1484 aa25.52■■□□□ 1.68
LRRC20-202ENST00000357631 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
LRRC20-202ENST00000357631 PBRM1Q86U86 1689 aa25.51■■□□□ 1.67
LRRC20-202ENST00000357631 NCOA2Q15596 1464 aa25.48■■□□□ 1.67
LRRC20-202ENST00000357631 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.48■■□□□ 1.67
LRRC20-202ENST00000357631 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.43■■□□□ 1.66
LRRC20-202ENST00000357631 ARID3CA6NKF2 412 aa25.42■■□□□ 1.66
LRRC20-202ENST00000357631 PTPRKQ15262 1439 aa25.42■■□□□ 1.66
LRRC20-202ENST00000357631 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
LRRC20-202ENST00000357631 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
LRRC20-202ENST00000357631 ADAMTS12P58397 1594 aa25.41■■□□□ 1.66
LRRC20-202ENST00000357631 IQGAP2Q13576 1575 aa25.41■■□□□ 1.66
LRRC20-202ENST00000357631 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.41■■□□□ 1.66
LRRC20-202ENST00000357631 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.39■■□□□ 1.66
LRRC20-202ENST00000357631 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.36■■□□□ 1.65
LRRC20-202ENST00000357631 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
LRRC20-202ENST00000357631 HFM1A2PYH4 1435 aa25.34■■□□□ 1.65
LRRC20-202ENST00000357631 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
LRRC20-202ENST00000357631 HECW1Q76N89 1606 aa25.32■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.32■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.32■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.3■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.3■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 IFT140Q96RY7 1462 aa25.29■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 NAIPQ13075 1403 aa25.29■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.28■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 UACAQ9BZF9 1416 aa25.27■■□□□ 1.64
LRRC20-202ENST00000357631 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
LRRC20-202ENST00000357631 TONSLQ96HA7 1378 aa25.26■■□□□ 1.63
LRRC20-202ENST00000357631 ARHGEF11O15085 1522 aa25.25■■□□□ 1.63
LRRC20-202ENST00000357631 WDR62O43379 1518 aa25.23■■□□□ 1.63
LRRC20-202ENST00000357631 KCNH8Q96L42 1107 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC20-202ENST00000357631 ERCC6Q03468 1493 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC20-202ENST00000357631 TRIM52Q96A61 297 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRC20-202ENST00000357631 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRC20-202ENST00000357631 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LRRC20-202ENST00000357631 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LRRC20-202ENST00000357631 GRIN2AQ12879 1464 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC20-202ENST00000357631 DISP1Q96F81 1524 aa25.12■■□□□ 1.61
LRRC20-202ENST00000357631 KIAA0556O60303 1618 aa25.12■■□□□ 1.61
LRRC20-202ENST00000357631 FBLN2P98095 1184 aa25.11■■□□□ 1.61
LRRC20-202ENST00000357631 MIA2Q96PC5 1412 aa25.09■■□□□ 1.61
LRRC20-202ENST00000357631 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
LRRC20-202ENST00000357631 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.06■■□□□ 1.6
LRRC20-202ENST00000357631 KDM6BO15054 1643 aa25.05■■□□□ 1.6
LRRC20-202ENST00000357631 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
LRRC20-202ENST00000357631 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.02■■□□□ 1.6
LRRC20-202ENST00000357631 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
LRRC20-202ENST00000357631 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
LRRC20-202ENST00000357631 AKNAQ7Z591 1439 aa25■■□□□ 1.59
LRRC20-202ENST00000357631 FOXD1Q16676 465 aa24.98■■□□□ 1.59
LRRC20-202ENST00000357631 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.98■■□□□ 1.59
LRRC20-202ENST00000357631 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
LRRC20-202ENST00000357631 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
LRRC20-202ENST00000357631 DAPK1P53355 1430 aa24.96■■□□□ 1.59
LRRC20-202ENST00000357631 ANP32CO43423 234 aa24.96■■□□□ 1.59
LRRC20-202ENST00000357631 CEP170Q5SW79 1584 aa24.95■■□□□ 1.59
LRRC20-202ENST00000357631 SYNJ2O15056 1496 aa24.94■■□□□ 1.58
LRRC20-202ENST00000357631 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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