RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.61□□□□□ -0.87
CCR6-201ENST00000341935 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CCR6-201ENST00000341935 CLIP1P30622 1438 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-201ENST00000341935 SYNJ2O15056 1496 aa9.55□□□□□ -0.88
CCR6-201ENST00000341935 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CCR6-201ENST00000341935 GRIN2AQ12879 1464 aa9.54□□□□□ -0.88
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.52□□□□□ -0.88
CCR6-201ENST00000341935 ARAP1Q96P48 1450 aa9.52□□□□□ -0.89
CCR6-201ENST00000341935 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CCR6-201ENST00000341935 IQGAP2Q13576 1575 aa9.51□□□□□ -0.89
CCR6-201ENST00000341935 CHD1O14646 1710 aa9.5□□□□□ -0.89
CCR6-201ENST00000341935 CEP170Q5SW79 1584 aa9.5□□□□□ -0.89
CCR6-201ENST00000341935 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.5□□□□□ -0.89
CCR6-201ENST00000341935 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.49□□□□□ -0.89
CCR6-201ENST00000341935 SAMD9Q5K651 1589 aa9.49□□□□□ -0.89
CCR6-201ENST00000341935 FBLN2P98095 1184 aa9.48□□□□□ -0.89
CCR6-201ENST00000341935 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.48□□□□□ -0.89
CCR6-201ENST00000341935 NUP160Q12769 1436 aa9.47□□□□□ -0.89
CCR6-201ENST00000341935 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.46□□□□□ -0.9
CCR6-201ENST00000341935 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.44□□□□□ -0.9
CCR6-201ENST00000341935 P3H3Q8IVL6 736 aa9.43□□□□□ -0.9
CCR6-201ENST00000341935 KIAA0556O60303 1618 aa9.42□□□□□ -0.9
CCR6-201ENST00000341935 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CCR6-201ENST00000341935 DISP1Q96F81 1524 aa9.41□□□□□ -0.9
CCR6-201ENST00000341935 FMN1Q68DA7 1419 aa9.4□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 SHROOM2Q13796 1616 aa9.38□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.38□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.38□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.38□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 APLP2Q06481 763 aa9.37□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 JPH4Q96JJ6 628 aa9.37□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.37□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.36□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 TIAM1Q13009 1591 aa9.36□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 MAP3K1Q13233 1512 aa9.36□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.36□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 HECW1Q76N89 1606 aa9.34□□□□□ -0.91
CCR6-201ENST00000341935 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.32□□□□□ -0.92
CCR6-201ENST00000341935 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CCR6-201ENST00000341935 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CCR6-201ENST00000341935 PCGF6Q9BYE7 350 aa9.31□□□□□ -0.92
CCR6-201ENST00000341935 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.3□□□□□ -0.92
CCR6-201ENST00000341935 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.3□□□□□ -0.92
CCR6-201ENST00000341935 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.3□□□□□ -0.92
CCR6-201ENST00000341935 ABCA8O94911 1581 aa9.28□□□□□ -0.92
CCR6-201ENST00000341935 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CCR6-201ENST00000341935 OSCARQ8IYS5 282 aa9.28□□□□□ -0.92
CCR6-201ENST00000341935 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
CCR6-201ENST00000341935 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.27□□□□□ -0.92
CCR6-201ENST00000341935 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CCR6-201ENST00000341935 PTPRGP23470 1445 aa9.26□□□□□ -0.93
CCR6-201ENST00000341935 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.25□□□□□ -0.93
CCR6-201ENST00000341935 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.25□□□□□ -0.93
CCR6-201ENST00000341935 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CCR6-201ENST00000341935 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.23□□□□□ -0.93
CCR6-201ENST00000341935 UACAQ9BZF9 1416 aa9.22□□□□□ -0.93
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CCR6-201ENST00000341935 ABCC2Q92887 1545 aa9.21□□□□□ -0.93
CCR6-201ENST00000341935 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF11O15085 1522 aa9.2□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 ATP10BO94823 1461 aa9.2□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.2□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 NCOA2Q15596 1464 aa9.19□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.19□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 BCL11AQ9H165 835 aa9.19□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.19□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.16□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 KIF14Q15058 1648 aa9.15□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.15□□□□□ -0.94
CCR6-201ENST00000341935 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.15□□□□□ -0.95
CCR6-201ENST00000341935 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.14□□□□□ -0.95
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CCR6-201ENST00000341935 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.13□□□□□ -0.95
CCR6-201ENST00000341935 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
CCR6-201ENST00000341935 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CCR6-201ENST00000341935 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.11□□□□□ -0.95
CCR6-201ENST00000341935 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CCR6-201ENST00000341935 MIA2Q96PC5 1412 aa9.1□□□□□ -0.95
CCR6-201ENST00000341935 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.1□□□□□ -0.95
CCR6-201ENST00000341935 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CCR6-201ENST00000341935 TTC37Q6PGP7 1564 aa9.08□□□□□ -0.96
CCR6-201ENST00000341935 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
CCR6-201ENST00000341935 PREX2Q70Z35 1606 aa9.07□□□□□ -0.96
CCR6-201ENST00000341935 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.07□□□□□ -0.96
CCR6-201ENST00000341935 ITGAEP38570 1179 aa9.07□□□□□ -0.96
CCR6-201ENST00000341935 MYO5CQ9NQX4 1742 aa9.06□□□□□ -0.96
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