RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 JPH4Q96JJ6 628 aa44.2■■■■■ 4.67
CRIP1-201ENST00000330233 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.19■■■■■ 4.66
CRIP1-201ENST00000330233 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.19■■■■■ 4.66
CRIP1-201ENST00000330233 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.19■■■■■ 4.66
CRIP1-201ENST00000330233 SHROOM2Q13796 1616 aa44.17■■■■■ 4.66
CRIP1-201ENST00000330233 KIF21BO75037 1637 aa44.12■■■■■ 4.65
CRIP1-201ENST00000330233 IQGAP2Q13576 1575 aa44.06■■■■■ 4.64
CRIP1-201ENST00000330233 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.06■■■■■ 4.64
CRIP1-201ENST00000330233 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
CRIP1-201ENST00000330233 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.9■■■■■ 4.62
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA3Q08378 1498 aa43.89■■■■■ 4.62
CRIP1-201ENST00000330233 ARAP1Q96P48 1450 aa43.87■■■■■ 4.61
CRIP1-201ENST00000330233 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.86■■■■■ 4.61
CRIP1-201ENST00000330233 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.84■■■■■ 4.61
CRIP1-201ENST00000330233 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.83■■■■■ 4.61
CRIP1-201ENST00000330233 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
CRIP1-201ENST00000330233 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.79■■■■■ 4.6
CRIP1-201ENST00000330233 DISP1Q96F81 1524 aa43.69■■■■■ 4.59
CRIP1-201ENST00000330233 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.62■■■■■ 4.57
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA0556O60303 1618 aa43.61■■■■■ 4.57
CRIP1-201ENST00000330233 PTPRGP23470 1445 aa43.57■■■■■ 4.57
CRIP1-201ENST00000330233 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.5■■■■■ 4.55
CRIP1-201ENST00000330233 SAMD9Q5K651 1589 aa43.47■■■■■ 4.55
CRIP1-201ENST00000330233 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
CRIP1-201ENST00000330233 P3H3Q8IVL6 736 aa43.41■■■■■ 4.54
CRIP1-201ENST00000330233 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.39■■■■■ 4.54
CRIP1-201ENST00000330233 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.3■■■■■ 4.52
CRIP1-201ENST00000330233 UACAQ9BZF9 1416 aa43.27■■■■■ 4.52
CRIP1-201ENST00000330233 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.25■■■■■ 4.51
CRIP1-201ENST00000330233 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.22■■■■■ 4.51
CRIP1-201ENST00000330233 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.21■■■■■ 4.51
CRIP1-201ENST00000330233 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.2■■■■■ 4.51
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.19■■■■■ 4.51
CRIP1-201ENST00000330233 ABCC2Q92887 1545 aa43.15■■■■■ 4.5
CRIP1-201ENST00000330233 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.13■■■■■ 4.49
CRIP1-201ENST00000330233 ABCA8O94911 1581 aa43.12■■■■■ 4.49
CRIP1-201ENST00000330233 CLIP1P30622 1438 aa43.11■■■■■ 4.49
CRIP1-201ENST00000330233 FMN1Q68DA7 1419 aa43.02■■■■■ 4.48
CRIP1-201ENST00000330233 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.01■■■■■ 4.47
CRIP1-201ENST00000330233 CEP162Q5TB80 1403 aa43■■■■■ 4.47
CRIP1-201ENST00000330233 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.99■■■■■ 4.47
CRIP1-201ENST00000330233 MAPKBP1O60336 1514 aa42.92■■■■■ 4.46
CRIP1-201ENST00000330233 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
CRIP1-201ENST00000330233 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
CRIP1-201ENST00000330233 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
CRIP1-201ENST00000330233 ATP10BO94823 1461 aa42.8■■■■■ 4.44
CRIP1-201ENST00000330233 ASXL2Q76L83 1435 aa42.77■■■■■ 4.44
CRIP1-201ENST00000330233 ARID3CA6NKF2 412 aa42.75■■■■■ 4.43
CRIP1-201ENST00000330233 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
CRIP1-201ENST00000330233 HECW1Q76N89 1606 aa42.73■■■■■ 4.43
CRIP1-201ENST00000330233 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
CRIP1-201ENST00000330233 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
CRIP1-201ENST00000330233 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.7■■■■■ 4.43
CRIP1-201ENST00000330233 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.68■■■■■ 4.42
CRIP1-201ENST00000330233 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.62■■■■■ 4.41
CRIP1-201ENST00000330233 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.62■■■■■ 4.41
CRIP1-201ENST00000330233 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.62■■■■■ 4.41
CRIP1-201ENST00000330233 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
CRIP1-201ENST00000330233 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.6■■■■■ 4.41
CRIP1-201ENST00000330233 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
CRIP1-201ENST00000330233 DIP2BQ9P265 1576 aa42.59■■■■■ 4.41
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.57■■■■■ 4.41
CRIP1-201ENST00000330233 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
CRIP1-201ENST00000330233 KCNH8Q96L42 1107 aa42.51■■■■■ 4.4
CRIP1-201ENST00000330233 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
CRIP1-201ENST00000330233 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.5■■■■■ 4.39
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.5■■■■■ 4.39
CRIP1-201ENST00000330233 GLI2P10070 1586 aa42.49■■■■■ 4.39
CRIP1-201ENST00000330233 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.47■■■■■ 4.39
CRIP1-201ENST00000330233 TSPOAP1O95153 1857 aa42.31■■■■■ 4.36
CRIP1-201ENST00000330233 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.29■■■■■ 4.36
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.28■■■■■ 4.36
CRIP1-201ENST00000330233 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
CRIP1-201ENST00000330233 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.24■■■■■ 4.35
CRIP1-201ENST00000330233 CD109Q6YHK3 1445 aa42.22■■■■■ 4.35
CRIP1-201ENST00000330233 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.12■■■■■ 4.33
CRIP1-201ENST00000330233 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.12■■■■■ 4.33
CRIP1-201ENST00000330233 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
CRIP1-201ENST00000330233 KIF14Q15058 1648 aa42.12■■■■■ 4.33
CRIP1-201ENST00000330233 APLP2Q06481 763 aa42.11■■■■■ 4.33
CRIP1-201ENST00000330233 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.11■■■■■ 4.33
CRIP1-201ENST00000330233 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.11■■■■■ 4.33
CRIP1-201ENST00000330233 MAP3K1Q13233 1512 aa42.1■■■■■ 4.33
CRIP1-201ENST00000330233 TIAM1Q13009 1591 aa42.09■■■■■ 4.33
CRIP1-201ENST00000330233 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.03■■■■■ 4.32
CRIP1-201ENST00000330233 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42■■■■■ 4.31
CRIP1-201ENST00000330233 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.95■■■■■ 4.31
CRIP1-201ENST00000330233 PLCH2O75038 1416 aa41.93■■■■■ 4.3
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.92■■■■■ 4.3
CRIP1-201ENST00000330233 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.91■■■■■ 4.3
CRIP1-201ENST00000330233 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
CRIP1-201ENST00000330233 NEO1Q92859 1461 aa41.86■■■■■ 4.29
CRIP1-201ENST00000330233 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.86■■■■■ 4.29
CRIP1-201ENST00000330233 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.83■■■■■ 4.29
CRIP1-201ENST00000330233 FANCAO15360 1455 aa41.83■■■■■ 4.29
CRIP1-201ENST00000330233 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.83■■■■■ 4.29
CRIP1-201ENST00000330233 KDM6BO15054 1643 aa41.83■■■■■ 4.29
CRIP1-201ENST00000330233 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.8■■■■■ 4.28
CRIP1-201ENST00000330233 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.79■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms