RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317135.12

LRCH2-201, Transcript of leucine rich repeats and calponin homology domain containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRCH2, Length 4,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2-201ENST00000317135 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
LRCH2-201ENST00000317135 CFTRP13569 1480 aa24.33■■□□□ 1.49
LRCH2-201ENST00000317135 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.33■■□□□ 1.48
LRCH2-201ENST00000317135 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
LRCH2-201ENST00000317135 FMN1Q68DA7 1419 aa24.32■■□□□ 1.48
LRCH2-201ENST00000317135 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.32■■□□□ 1.48
LRCH2-201ENST00000317135 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.3■■□□□ 1.48
LRCH2-201ENST00000317135 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.3■■□□□ 1.48
LRCH2-201ENST00000317135 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
LRCH2-201ENST00000317135 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
LRCH2-201ENST00000317135 IGF1RP08069 1367 aa24.21■■□□□ 1.47
LRCH2-201ENST00000317135 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
LRCH2-201ENST00000317135 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.17■■□□□ 1.46
LRCH2-201ENST00000317135 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.16■■□□□ 1.46
LRCH2-201ENST00000317135 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.16■■□□□ 1.46
LRCH2-201ENST00000317135 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.16■■□□□ 1.46
LRCH2-201ENST00000317135 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.14■■□□□ 1.46
LRCH2-201ENST00000317135 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.13■■□□□ 1.45
LRCH2-201ENST00000317135 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.13■■□□□ 1.45
LRCH2-201ENST00000317135 BCANQ96GW7 911 aa24.13■■□□□ 1.45
LRCH2-201ENST00000317135 SYNJ1O43426 1573 aa24.11■■□□□ 1.45
LRCH2-201ENST00000317135 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.1■■□□□ 1.45
LRCH2-201ENST00000317135 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.07■■□□□ 1.44
LRCH2-201ENST00000317135 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
LRCH2-201ENST00000317135 NESP48681 1621 aa24.07■■□□□ 1.44
LRCH2-201ENST00000317135 JPH4Q96JJ6 628 aa24.06■■□□□ 1.44
LRCH2-201ENST00000317135 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.04■■□□□ 1.44
LRCH2-201ENST00000317135 TOP2BQ02880 1626 aa24.01■■□□□ 1.43
LRCH2-201ENST00000317135 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.99■■□□□ 1.43
LRCH2-201ENST00000317135 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
LRCH2-201ENST00000317135 CUX1P39880 1505 aa23.96■■□□□ 1.43
LRCH2-201ENST00000317135 KIF21BO75037 1637 aa23.95■■□□□ 1.42
LRCH2-201ENST00000317135 TOPBP1Q92547 1522 aa23.93■■□□□ 1.42
LRCH2-201ENST00000317135 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
LRCH2-201ENST00000317135 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.92■■□□□ 1.42
LRCH2-201ENST00000317135 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.92■■□□□ 1.42
LRCH2-201ENST00000317135 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.91■■□□□ 1.42
LRCH2-201ENST00000317135 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.88■■□□□ 1.41
LRCH2-201ENST00000317135 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.87■■□□□ 1.41
LRCH2-201ENST00000317135 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
LRCH2-201ENST00000317135 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
LRCH2-201ENST00000317135 GRIN2BQ13224 1484 aa23.86■■□□□ 1.41
LRCH2-201ENST00000317135 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.86■■□□□ 1.41
LRCH2-201ENST00000317135 RGL3Q3MIN7 710 aa23.85■■□□□ 1.41
LRCH2-201ENST00000317135 PRXQ9BXM0 1461 aa23.83■■□□□ 1.41
LRCH2-201ENST00000317135 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.83■■□□□ 1.41
LRCH2-201ENST00000317135 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.82■■□□□ 1.4
LRCH2-201ENST00000317135 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.81■■□□□ 1.4
LRCH2-201ENST00000317135 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.81■■□□□ 1.4
LRCH2-201ENST00000317135 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.81■■□□□ 1.4
LRCH2-201ENST00000317135 IFT140Q96RY7 1462 aa23.79■■□□□ 1.4
LRCH2-201ENST00000317135 PTPRGP23470 1445 aa23.79■■□□□ 1.4
LRCH2-201ENST00000317135 NEFMP07197 916 aa23.76■■□□□ 1.39
LRCH2-201ENST00000317135 MIER1Q8N108 512 aa23.76■■□□□ 1.39
LRCH2-201ENST00000317135 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.74■■□□□ 1.39
LRCH2-201ENST00000317135 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.71■■□□□ 1.39
LRCH2-201ENST00000317135 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.7■■□□□ 1.39
LRCH2-201ENST00000317135 KANK1Q14678 1352 aa23.7■■□□□ 1.39
LRCH2-201ENST00000317135 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
LRCH2-201ENST00000317135 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.69■■□□□ 1.38
LRCH2-201ENST00000317135 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.69■■□□□ 1.38
LRCH2-201ENST00000317135 TMC1Q8TDI8 760 aa23.69■■□□□ 1.38
LRCH2-201ENST00000317135 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.66■■□□□ 1.38
LRCH2-201ENST00000317135 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
LRCH2-201ENST00000317135 PKD2Q13563 968 aa23.65■■□□□ 1.38
LRCH2-201ENST00000317135 ARAP1Q96P48 1450 aa23.65■■□□□ 1.38
LRCH2-201ENST00000317135 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.65■■□□□ 1.38
LRCH2-201ENST00000317135 MRS2Q9HD23 443 aa23.65■■□□□ 1.38
LRCH2-201ENST00000317135 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.64■■□□□ 1.38
LRCH2-201ENST00000317135 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
LRCH2-201ENST00000317135 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
LRCH2-201ENST00000317135 OSCARQ8IYS5 282 aa23.63■■□□□ 1.37
LRCH2-201ENST00000317135 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
LRCH2-201ENST00000317135 NUP155O75694 1391 aa23.6■■□□□ 1.37
LRCH2-201ENST00000317135 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.59■■□□□ 1.37
LRCH2-201ENST00000317135 CDCA8Q53HL2 280 aa23.59■■□□□ 1.37
LRCH2-201ENST00000317135 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.58■■□□□ 1.36
LRCH2-201ENST00000317135 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.57■■□□□ 1.36
LRCH2-201ENST00000317135 FOXD1Q16676 465 aa23.56■■□□□ 1.36
LRCH2-201ENST00000317135 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
LRCH2-201ENST00000317135 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.54■■□□□ 1.36
LRCH2-201ENST00000317135 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.53■■□□□ 1.36
LRCH2-201ENST00000317135 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
LRCH2-201ENST00000317135 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.51■■□□□ 1.35
LRCH2-201ENST00000317135 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.51■■□□□ 1.35
LRCH2-201ENST00000317135 GGT6Q6P531 493 aa23.5■■□□□ 1.35
LRCH2-201ENST00000317135 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
LRCH2-201ENST00000317135 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LRCH2-201ENST00000317135 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.49■■□□□ 1.35
LRCH2-201ENST00000317135 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.49■■□□□ 1.35
LRCH2-201ENST00000317135 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
LRCH2-201ENST00000317135 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LRCH2-201ENST00000317135 PRDM2Q13029 1718 aa23.44■■□□□ 1.34
LRCH2-201ENST00000317135 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
LRCH2-201ENST00000317135 KIF3BO15066 747 aa23.43■■□□□ 1.34
LRCH2-201ENST00000317135 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
LRCH2-201ENST00000317135 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
LRCH2-201ENST00000317135 SLC24A1O60721 1099 aa23.42■■□□□ 1.34
LRCH2-201ENST00000317135 NCOA2Q15596 1464 aa23.42■■□□□ 1.34
LRCH2-201ENST00000317135 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.41■■□□□ 1.34
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