RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316097.12

SCAMP4-201, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP4, Length 2,684 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-201ENST00000316097 ARAP1Q96P48 1450 aa25.86■■□□□ 1.73
SCAMP4-201ENST00000316097 P3H3Q8IVL6 736 aa25.85■■□□□ 1.73
SCAMP4-201ENST00000316097 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.83■■□□□ 1.72
SCAMP4-201ENST00000316097 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.81■■□□□ 1.72
SCAMP4-201ENST00000316097 APLP2Q06481 763 aa25.8■■□□□ 1.72
SCAMP4-201ENST00000316097 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SCAMP4-201ENST00000316097 WDR62O43379 1518 aa25.78■■□□□ 1.72
SCAMP4-201ENST00000316097 CUL7Q14999 1698 aa25.72■■□□□ 1.71
SCAMP4-201ENST00000316097 MYT1Q01538 1121 aa25.72■■□□□ 1.71
SCAMP4-201ENST00000316097 IFT140Q96RY7 1462 aa25.68■■□□□ 1.7
SCAMP4-201ENST00000316097 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SCAMP4-201ENST00000316097 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SCAMP4-201ENST00000316097 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SCAMP4-201ENST00000316097 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4-201ENST00000316097 PBRM1Q86U86 1689 aa25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4-201ENST00000316097 GRIN2BQ13224 1484 aa25.59■■□□□ 1.69
SCAMP4-201ENST00000316097 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.59■■□□□ 1.69
SCAMP4-201ENST00000316097 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.56■■□□□ 1.68
SCAMP4-201ENST00000316097 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
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SCAMP4-201ENST00000316097 FBLN2P98095 1184 aa25.51■■□□□ 1.67
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SCAMP4-201ENST00000316097 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.5■■□□□ 1.67
SCAMP4-201ENST00000316097 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SCAMP4-201ENST00000316097 ADAMTS12P58397 1594 aa25.49■■□□□ 1.67
SCAMP4-201ENST00000316097 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
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SCAMP4-201ENST00000316097 MIER1Q8N108 512 aa25.37■■□□□ 1.65
SCAMP4-201ENST00000316097 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SCAMP4-201ENST00000316097 GRIN2AQ12879 1464 aa25.32■■□□□ 1.64
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SCAMP4-201ENST00000316097 TIAM1Q13009 1591 aa25.3■■□□□ 1.64
SCAMP4-201ENST00000316097 SAMD9Q5K651 1589 aa25.3■■□□□ 1.64
SCAMP4-201ENST00000316097 ARID3CA6NKF2 412 aa25.28■■□□□ 1.64
SCAMP4-201ENST00000316097 FMN1Q68DA7 1419 aa25.28■■□□□ 1.64
SCAMP4-201ENST00000316097 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.27■■□□□ 1.64
SCAMP4-201ENST00000316097 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SCAMP4-201ENST00000316097 SYNJ2O15056 1496 aa25.25■■□□□ 1.63
SCAMP4-201ENST00000316097 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.25■■□□□ 1.63
SCAMP4-201ENST00000316097 ITGAEP38570 1179 aa25.24■■□□□ 1.63
SCAMP4-201ENST00000316097 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-201ENST00000316097 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-201ENST00000316097 CEP170Q5SW79 1584 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-201ENST00000316097 MAP3K1Q13233 1512 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-201ENST00000316097 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAMP4-201ENST00000316097 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-201ENST00000316097 DISP1Q96F81 1524 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-201ENST00000316097 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-201ENST00000316097 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-201ENST00000316097 JPH4Q96JJ6 628 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-201ENST00000316097 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-201ENST00000316097 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SCAMP4-201ENST00000316097 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.09■■□□□ 1.61
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SCAMP4-201ENST00000316097 NUP160Q12769 1436 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-201ENST00000316097 KIAA0556O60303 1618 aa25.04■■□□□ 1.6
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SCAMP4-201ENST00000316097 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.97■■□□□ 1.59
SCAMP4-201ENST00000316097 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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SCAMP4-201ENST00000316097 CHD1O14646 1710 aa24.91■■□□□ 1.58
SCAMP4-201ENST00000316097 NCOA2Q15596 1464 aa24.91■■□□□ 1.58
SCAMP4-201ENST00000316097 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.91■■□□□ 1.58
SCAMP4-201ENST00000316097 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
SCAMP4-201ENST00000316097 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.88■■□□□ 1.57
SCAMP4-201ENST00000316097 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SCAMP4-201ENST00000316097 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.85■■□□□ 1.57
SCAMP4-201ENST00000316097 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SCAMP4-201ENST00000316097 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.82■■□□□ 1.56
SCAMP4-201ENST00000316097 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.82■■□□□ 1.56
SCAMP4-201ENST00000316097 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.82■■□□□ 1.56
SCAMP4-201ENST00000316097 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.79■■□□□ 1.56
SCAMP4-201ENST00000316097 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-201ENST00000316097 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-201ENST00000316097 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-201ENST00000316097 PTPRGP23470 1445 aa24.74■■□□□ 1.55
SCAMP4-201ENST00000316097 PTPRKQ15262 1439 aa24.73■■□□□ 1.55
SCAMP4-201ENST00000316097 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-201ENST00000316097 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-201ENST00000316097 ARHGEF11O15085 1522 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-201ENST00000316097 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-201ENST00000316097 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-201ENST00000316097 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4-201ENST00000316097 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.549e-7■■■□□ 16.5
SCAMP4-201ENST00000316097 ATP10BO94823 1461 aa24.64■■□□□ 1.54
SCAMP4-201ENST00000316097 ABCA8O94911 1581 aa24.64■■□□□ 1.54
SCAMP4-201ENST00000316097 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.64■■□□□ 1.53
SCAMP4-201ENST00000316097 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.63■■□□□ 1.53
SCAMP4-201ENST00000316097 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.62■■□□□ 1.53
SCAMP4-201ENST00000316097 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.61■■□□□ 1.53
SCAMP4-201ENST00000316097 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SCAMP4-201ENST00000316097 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SCAMP4-201ENST00000316097 SHROOM2Q13796 1616 aa24.59■■□□□ 1.53
SCAMP4-201ENST00000316097 KIF14Q15058 1648 aa24.56■■□□□ 1.52
SCAMP4-201ENST00000316097 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.55■■□□□ 1.52
SCAMP4-201ENST00000316097 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SCAMP4-201ENST00000316097 UACAQ9BZF9 1416 aa24.53■■□□□ 1.52
SCAMP4-201ENST00000316097 MIA2Q96PC5 1412 aa24.53■■□□□ 1.52
SCAMP4-201ENST00000316097 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
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