RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315082.8

RHOT2-201, Transcript of ras homolog family member T2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHOT2, Length 2,539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2-201ENST00000315082 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.13■■■□□ 2.09
RHOT2-201ENST00000315082 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.12■■■□□ 2.09
RHOT2-201ENST00000315082 TOPBP1Q92547 1522 aa28.12■■■□□ 2.09
RHOT2-201ENST00000315082 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
RHOT2-201ENST00000315082 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.07■■■□□ 2.08
RHOT2-201ENST00000315082 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
RHOT2-201ENST00000315082 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.07■■■□□ 2.08
RHOT2-201ENST00000315082 NESP48681 1621 aa28.05■■■□□ 2.08
RHOT2-201ENST00000315082 P3H3Q8IVL6 736 aa28.04■■■□□ 2.08
RHOT2-201ENST00000315082 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.04■■■□□ 2.08
RHOT2-201ENST00000315082 CUL7Q14999 1698 aa28.02■■■□□ 2.08
RHOT2-201ENST00000315082 EFCAB5A4FU69 1503 aa28■■■□□ 2.07
RHOT2-201ENST00000315082 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.99■■■□□ 2.07
RHOT2-201ENST00000315082 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.98■■■□□ 2.07
RHOT2-201ENST00000315082 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.96■■■□□ 2.07
RHOT2-201ENST00000315082 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
RHOT2-201ENST00000315082 MAPKBP1O60336 1514 aa27.95■■■□□ 2.07
RHOT2-201ENST00000315082 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.95■■■□□ 2.07
RHOT2-201ENST00000315082 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
RHOT2-201ENST00000315082 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.92■■■□□ 2.06
RHOT2-201ENST00000315082 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.065e-8■■■■□ 20.8
RHOT2-201ENST00000315082 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.91■■■□□ 2.06
RHOT2-201ENST00000315082 WDR97A6NE52 1622 aa27.89■■■□□ 2.05
RHOT2-201ENST00000315082 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
RHOT2-201ENST00000315082 FMN1Q68DA7 1419 aa27.83■■■□□ 2.05
RHOT2-201ENST00000315082 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.79■■■□□ 2.045e-6■■□□□ 12
RHOT2-201ENST00000315082 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.79■■■□□ 2.04
RHOT2-201ENST00000315082 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
RHOT2-201ENST00000315082 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.76■■■□□ 2.03
RHOT2-201ENST00000315082 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.74■■■□□ 2.03
RHOT2-201ENST00000315082 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.73■■■□□ 2.03
RHOT2-201ENST00000315082 SAMD9Q5K651 1589 aa27.71■■■□□ 2.03
RHOT2-201ENST00000315082 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.7■■■□□ 2.02
RHOT2-201ENST00000315082 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.69■■■□□ 2.02
RHOT2-201ENST00000315082 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.67■■■□□ 2.02
RHOT2-201ENST00000315082 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.65■■■□□ 2.02
RHOT2-201ENST00000315082 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.61■■■□□ 2.01
RHOT2-201ENST00000315082 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.61■■■□□ 2.01
RHOT2-201ENST00000315082 GRIN2BQ13224 1484 aa27.6■■■□□ 2.01
RHOT2-201ENST00000315082 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
RHOT2-201ENST00000315082 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
RHOT2-201ENST00000315082 NCOA2Q15596 1464 aa27.55■■■□□ 2
RHOT2-201ENST00000315082 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.55■■■□□ 2
RHOT2-201ENST00000315082 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.53■■■□□ 2
RHOT2-201ENST00000315082 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.52■■■□□ 2
RHOT2-201ENST00000315082 HFM1A2PYH4 1435 aa27.52■■■□□ 2
RHOT2-201ENST00000315082 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
RHOT2-201ENST00000315082 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.51■■□□□ 1.99
RHOT2-201ENST00000315082 PTPRKQ15262 1439 aa27.51■■□□□ 1.99
RHOT2-201ENST00000315082 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
RHOT2-201ENST00000315082 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.48■■□□□ 1.99
RHOT2-201ENST00000315082 UACAQ9BZF9 1416 aa27.46■■□□□ 1.99
RHOT2-201ENST00000315082 PBRM1Q86U86 1689 aa27.44■■□□□ 1.98
RHOT2-201ENST00000315082 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
RHOT2-201ENST00000315082 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.42■■□□□ 1.98
RHOT2-201ENST00000315082 NAIPQ13075 1403 aa27.42■■□□□ 1.98
RHOT2-201ENST00000315082 ARHGEF11O15085 1522 aa27.4■■□□□ 1.98
RHOT2-201ENST00000315082 TONSLQ96HA7 1378 aa27.4■■□□□ 1.98
RHOT2-201ENST00000315082 KCNH8Q96L42 1107 aa27.39■■□□□ 1.98
RHOT2-201ENST00000315082 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.39■■□□□ 1.97
RHOT2-201ENST00000315082 IQGAP2Q13576 1575 aa27.37■■□□□ 1.97
RHOT2-201ENST00000315082 HECW1Q76N89 1606 aa27.37■■□□□ 1.97
RHOT2-201ENST00000315082 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
RHOT2-201ENST00000315082 ADAMTS12P58397 1594 aa27.35■■□□□ 1.97
RHOT2-201ENST00000315082 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
RHOT2-201ENST00000315082 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
RHOT2-201ENST00000315082 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.29■■□□□ 1.96
RHOT2-201ENST00000315082 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
RHOT2-201ENST00000315082 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.24■■□□□ 1.95
RHOT2-201ENST00000315082 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.23■■□□□ 1.95
RHOT2-201ENST00000315082 WDR62O43379 1518 aa27.23■■□□□ 1.95
RHOT2-201ENST00000315082 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
RHOT2-201ENST00000315082 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.2■■□□□ 1.95
RHOT2-201ENST00000315082 AKNAQ7Z591 1439 aa27.2■■□□□ 1.94
RHOT2-201ENST00000315082 MIA2Q96PC5 1412 aa27.2■■□□□ 1.94
RHOT2-201ENST00000315082 ANP32CO43423 234 aa27.19■■□□□ 1.94
RHOT2-201ENST00000315082 CCER2I3L3R5 266 aa27.18■■□□□ 1.94
RHOT2-201ENST00000315082 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.16■■□□□ 1.94
RHOT2-201ENST00000315082 IFT140Q96RY7 1462 aa27.15■■□□□ 1.94
RHOT2-201ENST00000315082 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
RHOT2-201ENST00000315082 ARID3CA6NKF2 412 aa27.12■■□□□ 1.93
RHOT2-201ENST00000315082 TRIM52Q96A61 297 aa27.12■■□□□ 1.93
RHOT2-201ENST00000315082 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
RHOT2-201ENST00000315082 KDM6BO15054 1643 aa27.1■■□□□ 1.93
RHOT2-201ENST00000315082 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.09■■□□□ 1.93
RHOT2-201ENST00000315082 KIAA0556O60303 1618 aa27.07■■□□□ 1.92
RHOT2-201ENST00000315082 DISP1Q96F81 1524 aa27.05■■□□□ 1.92
RHOT2-201ENST00000315082 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.03■■□□□ 1.92
RHOT2-201ENST00000315082 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
RHOT2-201ENST00000315082 DAPK1P53355 1430 aa26.99■■□□□ 1.91
RHOT2-201ENST00000315082 GRIN2AQ12879 1464 aa26.99■■□□□ 1.91
RHOT2-201ENST00000315082 ROCK1Q13464 1354 aa26.98■■□□□ 1.91
RHOT2-201ENST00000315082 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.98■■□□□ 1.91
RHOT2-201ENST00000315082 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
RHOT2-201ENST00000315082 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
RHOT2-201ENST00000315082 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
RHOT2-201ENST00000315082 ABCC5O15440 1437 aa26.94■■□□□ 1.9
RHOT2-201ENST00000315082 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
RHOT2-201ENST00000315082 FKBP8Q14318 412 aa26.92■■□□□ 1.9
RHOT2-201ENST00000315082 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms