RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311694.7

HECTD4-201, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 2,734 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HECTD4-201ENST00000311694 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
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HECTD4-201ENST00000311694 MIER1Q8N108 512 aa11.66□□□□□ -0.54
HECTD4-201ENST00000311694 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.66□□□□□ -0.54
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HECTD4-201ENST00000311694 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.45□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 FMN1Q68DA7 1419 aa11.45□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.45□□□□□ -0.58
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HECTD4-201ENST00000311694 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.42□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 MAP3K1Q13233 1512 aa11.41□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 SAMD9Q5K651 1589 aa11.41□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 IQGAP2Q13576 1575 aa11.41□□□□□ -0.58
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HECTD4-201ENST00000311694 GRIN2AQ12879 1464 aa11.37□□□□□ -0.59
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HECTD4-201ENST00000311694 SYNJ2O15056 1496 aa11.32□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 NCOA2Q15596 1464 aa11.31□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.31□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 DISP1Q96F81 1524 aa11.3□□□□□ -0.6
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HECTD4-201ENST00000311694 CEP170Q5SW79 1584 aa11.3□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.3□□□□□ -0.6
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HECTD4-201ENST00000311694 KIAA0556O60303 1618 aa11.28□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 HECW1Q76N89 1606 aa11.28□□□□□ -0.6
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HECTD4-201ENST00000311694 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.22□□□□□ -0.61
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HECTD4-201ENST00000311694 BCANQ96GW7 911 aa11.2□□□□□ -0.62
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HECTD4-201ENST00000311694 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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HECTD4-201ENST00000311694 ARHGEF11O15085 1522 aa11.17□□□□□ -0.62
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HECTD4-201ENST00000311694 HFM1A2PYH4 1435 aa11.14□□□□□ -0.63
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