RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305510.3

CNNM3-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM3, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3-201ENST00000305510 NEFLP07196 543 aa25.48■■□□□ 1.67
CNNM3-201ENST00000305510 TRIM52Q96A61 297 aa25.48■■□□□ 1.67
CNNM3-201ENST00000305510 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.48■■□□□ 1.67
CNNM3-201ENST00000305510 PRXQ9BXM0 1461 aa25.47■■□□□ 1.67
CNNM3-201ENST00000305510 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.47■■□□□ 1.67
CNNM3-201ENST00000305510 TOP2BQ02880 1626 aa25.46■■□□□ 1.67
CNNM3-201ENST00000305510 IGF1RP08069 1367 aa25.45■■□□□ 1.66
CNNM3-201ENST00000305510 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.39■■□□□ 1.66
CNNM3-201ENST00000305510 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CNNM3-201ENST00000305510 NCAPD3P42695 1498 aa25.35■■□□□ 1.65
CNNM3-201ENST00000305510 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.33■■□□□ 1.65
CNNM3-201ENST00000305510 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM3-201ENST00000305510 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM3-201ENST00000305510 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CNNM3-201ENST00000305510 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.31■■□□□ 1.64
CNNM3-201ENST00000305510 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.29■■□□□ 1.64
CNNM3-201ENST00000305510 CFTRP13569 1480 aa25.27■■□□□ 1.64
CNNM3-201ENST00000305510 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.27■■□□□ 1.64
CNNM3-201ENST00000305510 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CNNM3-201ENST00000305510 ANP32CO43423 234 aa25.25■■□□□ 1.63
CNNM3-201ENST00000305510 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.24■■□□□ 1.63
CNNM3-201ENST00000305510 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.24■■□□□ 1.63
CNNM3-201ENST00000305510 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.24■■□□□ 1.63
CNNM3-201ENST00000305510 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.24■■□□□ 1.63
CNNM3-201ENST00000305510 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.2■■□□□ 1.62
CNNM3-201ENST00000305510 TONSLQ96HA7 1378 aa25.2■■□□□ 1.62
CNNM3-201ENST00000305510 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CNNM3-201ENST00000305510 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CNNM3-201ENST00000305510 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.17■■□□□ 1.62
CNNM3-201ENST00000305510 FOXD1Q16676 465 aa25.15■■□□□ 1.62
CNNM3-201ENST00000305510 NESP48681 1621 aa25.13■■□□□ 1.61
CNNM3-201ENST00000305510 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CNNM3-201ENST00000305510 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CNNM3-201ENST00000305510 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.1■■□□□ 1.61
CNNM3-201ENST00000305510 FBLN2P98095 1184 aa25.09■■□□□ 1.61
CNNM3-201ENST00000305510 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CNNM3-201ENST00000305510 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.08■■□□□ 1.61
CNNM3-201ENST00000305510 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.08■■□□□ 1.61
CNNM3-201ENST00000305510 NBR1Q14596 966 aa25.08■■□□□ 1.61
CNNM3-201ENST00000305510 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.08■■□□□ 1.6
CNNM3-201ENST00000305510 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.08■■□□□ 1.6
CNNM3-201ENST00000305510 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CNNM3-201ENST00000305510 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM3-201ENST00000305510 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM3-201ENST00000305510 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
CNNM3-201ENST00000305510 HMGXB3Q12766 1538 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM3-201ENST00000305510 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CNNM3-201ENST00000305510 WDR97A6NE52 1622 aa24.95■■□□□ 1.58
CNNM3-201ENST00000305510 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.95■■□□□ 1.58
CNNM3-201ENST00000305510 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CNNM3-201ENST00000305510 TIAM1Q13009 1591 aa24.91■■□□□ 1.58
CNNM3-201ENST00000305510 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CNNM3-201ENST00000305510 MAPKBP1O60336 1514 aa24.86■■□□□ 1.57
CNNM3-201ENST00000305510 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CNNM3-201ENST00000305510 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.83■■□□□ 1.56
CNNM3-201ENST00000305510 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CNNM3-201ENST00000305510 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CNNM3-201ENST00000305510 IL27Q8NEV9 243 aa24.77■■□□□ 1.56
CNNM3-201ENST00000305510 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.76■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 FMN1Q68DA7 1419 aa24.75■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 TOPBP1Q92547 1522 aa24.75■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.74■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.74■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.73■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 PTPRKQ15262 1439 aa24.71■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 MRS2Q9HD23 443 aa24.71■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.71■■□□□ 1.55
CNNM3-201ENST00000305510 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.69■■□□□ 1.54
CNNM3-201ENST00000305510 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.68■■□□□ 1.54
CNNM3-201ENST00000305510 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.68■■□□□ 1.54
CNNM3-201ENST00000305510 CCDC184Q52MB2 194 aa24.67■■□□□ 1.54
CNNM3-201ENST00000305510 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.541e-6■■■□□ 16.1
CNNM3-201ENST00000305510 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.64■■□□□ 1.54
CNNM3-201ENST00000305510 CCER2I3L3R5 266 aa24.63■■□□□ 1.53
CNNM3-201ENST00000305510 NCOA2Q15596 1464 aa24.62■■□□□ 1.53
CNNM3-201ENST00000305510 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.61■■□□□ 1.53
CNNM3-201ENST00000305510 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.6■■□□□ 1.53
CNNM3-201ENST00000305510 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.58■■□□□ 1.53
CNNM3-201ENST00000305510 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.57■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.56■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.56■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.55■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.55■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 NAIPQ13075 1403 aa24.53■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 UACAQ9BZF9 1416 aa24.53■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.52■■□□□ 1.52
CNNM3-201ENST00000305510 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.49■■□□□ 1.51
CNNM3-201ENST00000305510 MAP3K1Q13233 1512 aa24.47■■□□□ 1.51
CNNM3-201ENST00000305510 HFM1A2PYH4 1435 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms