RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299705.9

TMED3-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED3, Length 1,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3-201ENST00000299705 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.43■■■□□ 2.3
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TMED3-201ENST00000299705 SHROOM2Q13796 1616 aa29.27■■■□□ 2.28
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TMED3-201ENST00000299705 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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TMED3-201ENST00000299705 CEP162Q5TB80 1403 aa28.97■■■□□ 2.23
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TMED3-201ENST00000299705 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.59■■■□□ 2.17
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TMED3-201ENST00000299705 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.15■■■□□ 2.1
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TMED3-201ENST00000299705 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.86■■■□□ 2.05
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TMED3-201ENST00000299705 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.83■■■□□ 2.05
TMED3-201ENST00000299705 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TMED3-201ENST00000299705 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.82■■■□□ 2.04
TMED3-201ENST00000299705 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.81■■■□□ 2.04
TMED3-201ENST00000299705 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.81■■■□□ 2.04
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