RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299022.9

LIPC-201, Transcript of lipase C, hepatic type, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIPC, Length 2,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPC-201ENST00000299022 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LIPC-201ENST00000299022 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.51□□□□□ -0.09
LIPC-201ENST00000299022 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LIPC-201ENST00000299022 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.5□□□□□ -0.09
LIPC-201ENST00000299022 TOPBP1Q92547 1522 aa14.48□□□□□ -0.09
LIPC-201ENST00000299022 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
LIPC-201ENST00000299022 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.47□□□□□ -0.09
LIPC-201ENST00000299022 TIAM1Q13009 1591 aa14.46□□□□□ -0.09
LIPC-201ENST00000299022 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.44□□□□□ -0.1
LIPC-201ENST00000299022 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.43□□□□□ -0.1
LIPC-201ENST00000299022 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
LIPC-201ENST00000299022 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.42□□□□□ -0.1
LIPC-201ENST00000299022 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.41□□□□□ -0.1
LIPC-201ENST00000299022 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.41□□□□□ -0.1
LIPC-201ENST00000299022 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
LIPC-201ENST00000299022 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.37□□□□□ -0.11
LIPC-201ENST00000299022 MAPKBP1O60336 1514 aa14.36□□□□□ -0.11
LIPC-201ENST00000299022 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.35□□□□□ -0.11
LIPC-201ENST00000299022 ARID3CA6NKF2 412 aa14.34□□□□□ -0.11
LIPC-201ENST00000299022 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
LIPC-201ENST00000299022 KCNH8Q96L42 1107 aa14.32□□□□□ -0.12
LIPC-201ENST00000299022 MAP3K1Q13233 1512 aa14.31□□□□□ -0.12
LIPC-201ENST00000299022 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.29□□□□□ -0.12
LIPC-201ENST00000299022 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.29□□□□□ -0.12
LIPC-201ENST00000299022 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.28□□□□□ -0.12
LIPC-201ENST00000299022 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.27□□□□□ -0.12
LIPC-201ENST00000299022 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.27□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.26□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 CUL7Q14999 1698 aa14.25□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.25□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 PTPRKQ15262 1439 aa14.24□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.24□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 WDR97A6NE52 1622 aa14.24□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.24□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.24□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.24□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.23□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 FMN1Q68DA7 1419 aa14.23□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.22□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.22□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.22□□□□□ -0.13
LIPC-201ENST00000299022 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.19□□□□□ -0.14
LIPC-201ENST00000299022 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.18□□□□□ -0.14
LIPC-201ENST00000299022 NCOA2Q15596 1464 aa14.17□□□□□ -0.14
LIPC-201ENST00000299022 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.15□□□□□ -0.14
LIPC-201ENST00000299022 GRIN2BQ13224 1484 aa14.15□□□□□ -0.14
LIPC-201ENST00000299022 SAMD9Q5K651 1589 aa14.15□□□□□ -0.14
LIPC-201ENST00000299022 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
LIPC-201ENST00000299022 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
LIPC-201ENST00000299022 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.13□□□□□ -0.15
LIPC-201ENST00000299022 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.12□□□□□ -0.15
LIPC-201ENST00000299022 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
LIPC-201ENST00000299022 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
LIPC-201ENST00000299022 NAIPQ13075 1403 aa14.1□□□□□ -0.15
LIPC-201ENST00000299022 FOXD1Q16676 465 aa14.1□□□□□ -0.15
LIPC-201ENST00000299022 TONSLQ96HA7 1378 aa14.09□□□□□ -0.15
LIPC-201ENST00000299022 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
LIPC-201ENST00000299022 HFM1A2PYH4 1435 aa14.08□□□□□ -0.15
LIPC-201ENST00000299022 TRIM52Q96A61 297 aa14.08□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.07□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 UACAQ9BZF9 1416 aa14.05□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 PBRM1Q86U86 1689 aa14.04□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.04□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 IQGAP2Q13576 1575 aa14.03□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.03□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 FBLN2P98095 1184 aa14.03□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.03□□□□□ -0.16
LIPC-201ENST00000299022 KDM6BO15054 1643 aa14.02□□□□□ -0.17
LIPC-201ENST00000299022 ADAMTS12P58397 1594 aa14.01□□□□□ -0.17
LIPC-201ENST00000299022 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
LIPC-201ENST00000299022 BCANQ96GW7 911 aa14.01□□□□□ -0.17
LIPC-201ENST00000299022 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14□□□□□ -0.17
LIPC-201ENST00000299022 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
LIPC-201ENST00000299022 ARHGEF11O15085 1522 aa13.99□□□□□ -0.17
LIPC-201ENST00000299022 HECW1Q76N89 1606 aa13.97□□□□□ -0.17
LIPC-201ENST00000299022 MPHOSPH9Q99550 1183 aa13.96□□□□□ -0.17
LIPC-201ENST00000299022 WDR62O43379 1518 aa13.96□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 ANP32CO43423 234 aa13.95□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 DISP1Q96F81 1524 aa13.94□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 KDM5BQ9UGL1 1544 aa13.94□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 L3MBTL2Q969R5 705 aa13.92□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 IFT140Q96RY7 1462 aa13.92□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 ERCC6Q03468 1493 aa13.9□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 WASHC2AQ641Q2 1341 aa13.9□□□□□ -0.18
LIPC-201ENST00000299022 FKBP8Q14318 412 aa13.89□□□□□ -0.19
LIPC-201ENST00000299022 PLB1Q6P1J6 1458 aa13.89□□□□□ -0.19
LIPC-201ENST00000299022 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa13.89□□□□□ -0.19
LIPC-201ENST00000299022 GRIN2AQ12879 1464 aa13.89□□□□□ -0.19
LIPC-201ENST00000299022 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
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