RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295704.6

RNF25-201, Transcript of ring finger protein 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF25, Length 1,914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25-201ENST00000295704 ERCC6Q03468 1493 aa22.74■■□□□ 1.23
RNF25-201ENST00000295704 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.74■■□□□ 1.23
RNF25-201ENST00000295704 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.71■■□□□ 1.23
RNF25-201ENST00000295704 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.67■■□□□ 1.22
RNF25-201ENST00000295704 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.67■■□□□ 1.22
RNF25-201ENST00000295704 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
RNF25-201ENST00000295704 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.63■■□□□ 1.21
RNF25-201ENST00000295704 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RNF25-201ENST00000295704 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.63■■□□□ 1.21
RNF25-201ENST00000295704 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.61■■□□□ 1.21
RNF25-201ENST00000295704 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.61■■□□□ 1.21
RNF25-201ENST00000295704 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
RNF25-201ENST00000295704 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
RNF25-201ENST00000295704 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
RNF25-201ENST00000295704 TOPBP1Q92547 1522 aa22.58■■□□□ 1.2
RNF25-201ENST00000295704 CUL7Q14999 1698 aa22.58■■□□□ 1.2
RNF25-201ENST00000295704 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.57■■□□□ 1.2
RNF25-201ENST00000295704 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.57■■□□□ 1.2
RNF25-201ENST00000295704 MAPKBP1O60336 1514 aa22.57■■□□□ 1.2
RNF25-201ENST00000295704 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RNF25-201ENST00000295704 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.56■■□□□ 1.2
RNF25-201ENST00000295704 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.54■■□□□ 1.2
RNF25-201ENST00000295704 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.54■■□□□ 1.2
RNF25-201ENST00000295704 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
RNF25-201ENST00000295704 ITGAEP38570 1179 aa22.51■■□□□ 1.19
RNF25-201ENST00000295704 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.51■■□□□ 1.19
RNF25-201ENST00000295704 WDR62O43379 1518 aa22.47■■□□□ 1.19
RNF25-201ENST00000295704 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.47■■□□□ 1.19
RNF25-201ENST00000295704 FMN1Q68DA7 1419 aa22.45■■□□□ 1.19
RNF25-201ENST00000295704 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.44■■□□□ 1.18
RNF25-201ENST00000295704 WDR97A6NE52 1622 aa22.42■■□□□ 1.18
RNF25-201ENST00000295704 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RNF25-201ENST00000295704 P3H3Q8IVL6 736 aa22.4■■□□□ 1.18
RNF25-201ENST00000295704 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.36■■□□□ 1.17
RNF25-201ENST00000295704 SAMD9Q5K651 1589 aa22.34■■□□□ 1.17
RNF25-201ENST00000295704 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.34■■□□□ 1.17
RNF25-201ENST00000295704 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.32■■□□□ 1.16
RNF25-201ENST00000295704 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RNF25-201ENST00000295704 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.28■■□□□ 1.16
RNF25-201ENST00000295704 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RNF25-201ENST00000295704 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.27■■□□□ 1.16
RNF25-201ENST00000295704 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RNF25-201ENST00000295704 GRIN2BQ13224 1484 aa22.25■■□□□ 1.15
RNF25-201ENST00000295704 HFM1A2PYH4 1435 aa22.25■■□□□ 1.15
RNF25-201ENST00000295704 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.24■■□□□ 1.15
RNF25-201ENST00000295704 MYT1Q01538 1121 aa22.21■■□□□ 1.15
RNF25-201ENST00000295704 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RNF25-201ENST00000295704 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RNF25-201ENST00000295704 UACAQ9BZF9 1416 aa22.21■■□□□ 1.15
RNF25-201ENST00000295704 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.19■■□□□ 1.14
RNF25-201ENST00000295704 IFT140Q96RY7 1462 aa22.18■■□□□ 1.14
RNF25-201ENST00000295704 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.18■■□□□ 1.14
RNF25-201ENST00000295704 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RNF25-201ENST00000295704 NCOA2Q15596 1464 aa22.17■■□□□ 1.14
RNF25-201ENST00000295704 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.17■■□□□ 1.14
RNF25-201ENST00000295704 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.17■■□□□ 1.14
RNF25-201ENST00000295704 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RNF25-201ENST00000295704 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.16■■□□□ 1.14
RNF25-201ENST00000295704 PTPRKQ15262 1439 aa22.15■■□□□ 1.14
RNF25-201ENST00000295704 ARHGEF11O15085 1522 aa22.15■■□□□ 1.14
RNF25-201ENST00000295704 NAIPQ13075 1403 aa22.13■■□□□ 1.13
RNF25-201ENST00000295704 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RNF25-201ENST00000295704 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF25-201ENST00000295704 CCER2I3L3R5 266 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF25-201ENST00000295704 TONSLQ96HA7 1378 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF25-201ENST00000295704 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RNF25-201ENST00000295704 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RNF25-201ENST00000295704 AKNAQ7Z591 1439 aa22.05■■□□□ 1.12
RNF25-201ENST00000295704 KCNH8Q96L42 1107 aa22.04■■□□□ 1.12
RNF25-201ENST00000295704 HECW1Q76N89 1606 aa22.03■■□□□ 1.12
RNF25-201ENST00000295704 MIA2Q96PC5 1412 aa22.01■■□□□ 1.11
RNF25-201ENST00000295704 PBRM1Q86U86 1689 aa22■■□□□ 1.11
RNF25-201ENST00000295704 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22■■□□□ 1.11
RNF25-201ENST00000295704 IQGAP2Q13576 1575 aa21.99■■□□□ 1.11
RNF25-201ENST00000295704 ANP32CO43423 234 aa21.99■■□□□ 1.11
RNF25-201ENST00000295704 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.98■■□□□ 1.11
RNF25-201ENST00000295704 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RNF25-201ENST00000295704 ADAMTS12P58397 1594 aa21.96■■□□□ 1.11
RNF25-201ENST00000295704 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.96■■□□□ 1.11
RNF25-201ENST00000295704 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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RNF25-201ENST00000295704 ROCK1Q13464 1354 aa21.85■■□□□ 1.09
RNF25-201ENST00000295704 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.84■■□□□ 1.09
RNF25-201ENST00000295704 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.82■■□□□ 1.08
RNF25-201ENST00000295704 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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RNF25-201ENST00000295704 FBLN2P98095 1184 aa21.8■■□□□ 1.08
RNF25-201ENST00000295704 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.8■■□□□ 1.08
RNF25-201ENST00000295704 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.78■■□□□ 1.08
RNF25-201ENST00000295704 KDM6BO15054 1643 aa21.77■■□□□ 1.08
RNF25-201ENST00000295704 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RNF25-201ENST00000295704 TRIM52Q96A61 297 aa21.76■■□□□ 1.07
RNF25-201ENST00000295704 DISP1Q96F81 1524 aa21.75■■□□□ 1.07
RNF25-201ENST00000295704 FKBP8Q14318 412 aa21.75■■□□□ 1.07
RNF25-201ENST00000295704 KIAA0556O60303 1618 aa21.75■■□□□ 1.07
RNF25-201ENST00000295704 CHD1O14646 1710 aa21.75■■□□□ 1.07
RNF25-201ENST00000295704 DAPK1P53355 1430 aa21.74■■□□□ 1.07
RNF25-201ENST00000295704 NEFLP07196 543 aa21.74■■□□□ 1.07
RNF25-201ENST00000295704 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
RNF25-201ENST00000295704 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
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