RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295033.7

TRIM17-201, Transcript of tripartite motif containing 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM17, Length 1,730 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM17-201ENST00000295033 PBRM1Q86U86 1689 aa27.38■■□□□ 1.97
TRIM17-201ENST00000295033 SYNJ2O15056 1496 aa27.36■■□□□ 1.97
TRIM17-201ENST00000295033 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.36■■□□□ 1.97
TRIM17-201ENST00000295033 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.36■■□□□ 1.97
TRIM17-201ENST00000295033 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
TRIM17-201ENST00000295033 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.33■■□□□ 1.96
TRIM17-201ENST00000295033 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.29■■□□□ 1.96
TRIM17-201ENST00000295033 CUL7Q14999 1698 aa27.29■■□□□ 1.96
TRIM17-201ENST00000295033 ARAP1Q96P48 1450 aa27.27■■□□□ 1.96
TRIM17-201ENST00000295033 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.2■■□□□ 1.94
TRIM17-201ENST00000295033 GRIN2AQ12879 1464 aa27.15■■□□□ 1.94
TRIM17-201ENST00000295033 ADAMTS12P58397 1594 aa27.15■■□□□ 1.94
TRIM17-201ENST00000295033 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.1■■□□□ 1.93
TRIM17-201ENST00000295033 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIM17-201ENST00000295033 CEP170Q5SW79 1584 aa27.03■■□□□ 1.92
TRIM17-201ENST00000295033 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
TRIM17-201ENST00000295033 NUP160Q12769 1436 aa27.02■■□□□ 1.92
TRIM17-201ENST00000295033 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
TRIM17-201ENST00000295033 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
TRIM17-201ENST00000295033 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27■■□□□ 1.91
TRIM17-201ENST00000295033 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.94■■□□□ 1.9
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TRIM17-201ENST00000295033 SHROOM2Q13796 1616 aa26.85■■□□□ 1.89
TRIM17-201ENST00000295033 APLP2Q06481 763 aa26.82■■□□□ 1.88
TRIM17-201ENST00000295033 JPH4Q96JJ6 628 aa26.82■■□□□ 1.88
TRIM17-201ENST00000295033 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TRIM17-201ENST00000295033 HRCP23327 699 aa26.78■■□□□ 1.88
TRIM17-201ENST00000295033 SAMD9Q5K651 1589 aa26.77■■□□□ 1.88
TRIM17-201ENST00000295033 MAP3K1Q13233 1512 aa26.73■■□□□ 1.87
TRIM17-201ENST00000295033 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TRIM17-201ENST00000295033 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.7■■□□□ 1.87
TRIM17-201ENST00000295033 IQGAP2Q13576 1575 aa26.69■■□□□ 1.86
TRIM17-201ENST00000295033 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.65■■□□□ 1.86
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TRIM17-201ENST00000295033 TIAM1Q13009 1591 aa26.63■■□□□ 1.85
TRIM17-201ENST00000295033 FMN1Q68DA7 1419 aa26.63■■□□□ 1.85
TRIM17-201ENST00000295033 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.63■■□□□ 1.85
TRIM17-201ENST00000295033 P3H3Q8IVL6 736 aa26.62■■□□□ 1.85
TRIM17-201ENST00000295033 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.62■■□□□ 1.85
TRIM17-201ENST00000295033 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TRIM17-201ENST00000295033 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.6■■□□□ 1.85
TRIM17-201ENST00000295033 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.58■■□□□ 1.85
TRIM17-201ENST00000295033 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.51■■□□□ 1.83
TRIM17-201ENST00000295033 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
TRIM17-201ENST00000295033 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
TRIM17-201ENST00000295033 DISP1Q96F81 1524 aa26.44■■□□□ 1.82
TRIM17-201ENST00000295033 KIAA0556O60303 1618 aa26.42■■□□□ 1.82
TRIM17-201ENST00000295033 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.42■■□□□ 1.82
TRIM17-201ENST00000295033 PTPRGP23470 1445 aa26.41■■□□□ 1.82
TRIM17-201ENST00000295033 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.41■■□□□ 1.82
TRIM17-201ENST00000295033 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.38■■□□□ 1.81
TRIM17-201ENST00000295033 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
TRIM17-201ENST00000295033 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.34■■□□□ 1.81
TRIM17-201ENST00000295033 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.34■■□□□ 1.81
TRIM17-201ENST00000295033 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
TRIM17-201ENST00000295033 HECW1Q76N89 1606 aa26.32■■□□□ 1.8
TRIM17-201ENST00000295033 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.31■■□□□ 1.8
TRIM17-201ENST00000295033 MAPKBP1O60336 1514 aa26.31■■□□□ 1.8
TRIM17-201ENST00000295033 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.3■■□□□ 1.8
TRIM17-201ENST00000295033 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.29■■□□□ 1.8
TRIM17-201ENST00000295033 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.27■■□□□ 1.8
TRIM17-201ENST00000295033 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TRIM17-201ENST00000295033 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
TRIM17-201ENST00000295033 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
TRIM17-201ENST00000295033 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.22■■□□□ 1.79
TRIM17-201ENST00000295033 DIP2BQ9P265 1576 aa26.22■■□□□ 1.79
TRIM17-201ENST00000295033 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.2■■□□□ 1.79
TRIM17-201ENST00000295033 ABCC2Q92887 1545 aa26.2■■□□□ 1.78
TRIM17-201ENST00000295033 UACAQ9BZF9 1416 aa26.2■■□□□ 1.78
TRIM17-201ENST00000295033 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.18■■□□□ 1.78
TRIM17-201ENST00000295033 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.16■■□□□ 1.78
TRIM17-201ENST00000295033 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.15■■□□□ 1.78
TRIM17-201ENST00000295033 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
TRIM17-201ENST00000295033 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
TRIM17-201ENST00000295033 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
TRIM17-201ENST00000295033 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
TRIM17-201ENST00000295033 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
TRIM17-201ENST00000295033 NCOA2Q15596 1464 aa26.12■■□□□ 1.77
TRIM17-201ENST00000295033 ASXL2Q76L83 1435 aa26.12■■□□□ 1.77
TRIM17-201ENST00000295033 TSPOAP1O95153 1857 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIM17-201ENST00000295033 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIM17-201ENST00000295033 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIM17-201ENST00000295033 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIM17-201ENST00000295033 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIM17-201ENST00000295033 ABCA8O94911 1581 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIM17-201ENST00000295033 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
TRIM17-201ENST00000295033 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TRIM17-201ENST00000295033 KDM6BO15054 1643 aa25.95■■□□□ 1.75
TRIM17-201ENST00000295033 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
TRIM17-201ENST00000295033 GLI2P10070 1586 aa25.95■■□□□ 1.74
TRIM17-201ENST00000295033 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TRIM17-201ENST00000295033 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TRIM17-201ENST00000295033 ARID3CA6NKF2 412 aa25.91■■□□□ 1.74
TRIM17-201ENST00000295033 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
TRIM17-201ENST00000295033 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.9■■□□□ 1.74
TRIM17-201ENST00000295033 MIA2Q96PC5 1412 aa25.9■■□□□ 1.74
TRIM17-201ENST00000295033 ITGAEP38570 1179 aa25.89■■□□□ 1.74
TRIM17-201ENST00000295033 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.88■■□□□ 1.73
TRIM17-201ENST00000295033 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TRIM17-201ENST00000295033 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
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