RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294742.6

ARPC5-201, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARPC5, Length 1,637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5-201ENST00000294742 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.08■■□□□ 1.93
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ARPC5-201ENST00000294742 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.04■■□□□ 1.92
ARPC5-201ENST00000294742 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.04■■□□□ 1.92
ARPC5-201ENST00000294742 IQGAP2Q13576 1575 aa27.01■■□□□ 1.91
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ARPC5-201ENST00000294742 SHROOM2Q13796 1616 aa26.9■■□□□ 1.9
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ARPC5-201ENST00000294742 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.78■■□□□ 1.88
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ARPC5-201ENST00000294742 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.68■■□□□ 1.86
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ARPC5-201ENST00000294742 ARHGEF11O15085 1522 aa26.66■■□□□ 1.86
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ARPC5-201ENST00000294742 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.58■■□□□ 1.85
ARPC5-201ENST00000294742 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.58■■□□□ 1.85
ARPC5-201ENST00000294742 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
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ARPC5-201ENST00000294742 UACAQ9BZF9 1416 aa26.4■■□□□ 1.82
ARPC5-201ENST00000294742 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.39■■□□□ 1.82
ARPC5-201ENST00000294742 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.37■■□□□ 1.81
ARPC5-201ENST00000294742 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.35■■□□□ 1.81
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ARPC5-201ENST00000294742 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
ARPC5-201ENST00000294742 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.33■■□□□ 1.81
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ARPC5-201ENST00000294742 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.32■■□□□ 1.8
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ARPC5-201ENST00000294742 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.22■■□□□ 1.79
ARPC5-201ENST00000294742 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.19■■□□□ 1.78
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ARPC5-201ENST00000294742 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.14■■□□□ 1.78
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ARPC5-201ENST00000294742 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.03■■□□□ 1.76
ARPC5-201ENST00000294742 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
ARPC5-201ENST00000294742 ASXL2Q76L83 1435 aa26.02■■□□□ 1.76
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ARPC5-201ENST00000294742 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26■■□□□ 1.75
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ARPC5-201ENST00000294742 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.98■■□□□ 1.75
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ARPC5-201ENST00000294742 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.98■■□□□ 1.75
ARPC5-201ENST00000294742 KIF14Q15058 1648 aa25.91■■□□□ 1.74
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ARPC5-201ENST00000294742 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.64■■□□□ 1.7
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ARPC5-201ENST00000294742 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.61■■□□□ 1.69
ARPC5-201ENST00000294742 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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