RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294702.5

GFI1-201, Transcript of growth factor independent 1 transcriptional repressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GFI1, Length 2,784 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1-201ENST00000294702 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
GFI1-201ENST00000294702 MAPKBP1O60336 1514 aa27.36■■□□□ 1.97
GFI1-201ENST00000294702 ANP32CO43423 234 aa27.36■■□□□ 1.97
GFI1-201ENST00000294702 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
GFI1-201ENST00000294702 WDR97A6NE52 1622 aa27.35■■□□□ 1.97
GFI1-201ENST00000294702 NBR1Q14596 966 aa27.31■■□□□ 1.96
GFI1-201ENST00000294702 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.28■■□□□ 1.96
GFI1-201ENST00000294702 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.27■■□□□ 1.96
GFI1-201ENST00000294702 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.26■■□□□ 1.95
GFI1-201ENST00000294702 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
GFI1-201ENST00000294702 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.26■■□□□ 1.95
GFI1-201ENST00000294702 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.24■■□□□ 1.95
GFI1-201ENST00000294702 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.24■■□□□ 1.95
GFI1-201ENST00000294702 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
GFI1-201ENST00000294702 SYNJ1O43426 1573 aa27.23■■□□□ 1.95
GFI1-201ENST00000294702 ARAP1Q96P48 1450 aa27.19■■□□□ 1.94
GFI1-201ENST00000294702 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
GFI1-201ENST00000294702 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.19■■□□□ 1.94
GFI1-201ENST00000294702 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.18■■□□□ 1.94
GFI1-201ENST00000294702 IL27Q8NEV9 243 aa27.12■■□□□ 1.93
GFI1-201ENST00000294702 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.09■■□□□ 1.93
GFI1-201ENST00000294702 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.02■■□□□ 1.92
GFI1-201ENST00000294702 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
GFI1-201ENST00000294702 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27■■□□□ 1.91
GFI1-201ENST00000294702 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
GFI1-201ENST00000294702 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
GFI1-201ENST00000294702 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa26.9■■□□□ 1.9
GFI1-201ENST00000294702 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
GFI1-201ENST00000294702 PRXQ9BXM0 1461 aa26.85■■□□□ 1.89
GFI1-201ENST00000294702 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.82■■□□□ 1.88
GFI1-201ENST00000294702 CCDC184Q52MB2 194 aa26.82■■□□□ 1.88
GFI1-201ENST00000294702 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
GFI1-201ENST00000294702 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
GFI1-201ENST00000294702 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.79■■□□□ 1.88
GFI1-201ENST00000294702 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.78■■□□□ 1.88
GFI1-201ENST00000294702 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.72■■□□□ 1.87
GFI1-201ENST00000294702 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
GFI1-201ENST00000294702 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.69■■□□□ 1.86
GFI1-201ENST00000294702 TONSLQ96HA7 1378 aa26.68■■□□□ 1.86
GFI1-201ENST00000294702 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.66■■□□□ 1.86
GFI1-201ENST00000294702 PRDM2Q13029 1718 aa26.65■■□□□ 1.86
GFI1-201ENST00000294702 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.65■■□□□ 1.86
GFI1-201ENST00000294702 TOP2BQ02880 1626 aa26.63■■□□□ 1.85
GFI1-201ENST00000294702 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
GFI1-201ENST00000294702 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.6■■□□□ 1.85
GFI1-201ENST00000294702 TIAM1Q13009 1591 aa26.59■■□□□ 1.85
GFI1-201ENST00000294702 NEFMP07197 916 aa26.58■■□□□ 1.85
GFI1-201ENST00000294702 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GFI1-201ENST00000294702 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.56■■□□□ 1.84
GFI1-201ENST00000294702 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.55■■□□□ 1.84
GFI1-201ENST00000294702 AKNAQ7Z591 1439 aa26.53■■□□□ 1.84
GFI1-201ENST00000294702 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
GFI1-201ENST00000294702 MRS2Q9HD23 443 aa26.53■■□□□ 1.84
GFI1-201ENST00000294702 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.53■■□□□ 1.84
GFI1-201ENST00000294702 MAP3K1Q13233 1512 aa26.52■■□□□ 1.84
GFI1-201ENST00000294702 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GFI1-201ENST00000294702 USP35Q9P2H5 1018 aa26.52■■□□□ 1.84
GFI1-201ENST00000294702 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GFI1-201ENST00000294702 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.47■■□□□ 1.83
GFI1-201ENST00000294702 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
GFI1-201ENST00000294702 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.46■■□□□ 1.83
GFI1-201ENST00000294702 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.45■■□□□ 1.83
GFI1-201ENST00000294702 CFTRP13569 1480 aa26.44■■□□□ 1.82
GFI1-201ENST00000294702 NCOA2Q15596 1464 aa26.44■■□□□ 1.82
GFI1-201ENST00000294702 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.43■■□□□ 1.82
GFI1-201ENST00000294702 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.42■■□□□ 1.82
GFI1-201ENST00000294702 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
GFI1-201ENST00000294702 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.36■■□□□ 1.81
GFI1-201ENST00000294702 KIF27Q86VH2 1401 aa26.36■■□□□ 1.81
GFI1-201ENST00000294702 NUDCQ9Y266 331 aa26.36■■□□□ 1.81
GFI1-201ENST00000294702 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
GFI1-201ENST00000294702 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
GFI1-201ENST00000294702 UACAQ9BZF9 1416 aa26.32■■□□□ 1.8
GFI1-201ENST00000294702 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.32■■□□□ 1.8
GFI1-201ENST00000294702 GSE1Q14687 1217 aa26.32■■□□□ 1.8
GFI1-201ENST00000294702 PDE4AP27815 886 aa26.3■■□□□ 1.8
GFI1-201ENST00000294702 CCDC7Q96M83 1385 aa26.28■■□□□ 1.8
GFI1-201ENST00000294702 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.8
GFI1-201ENST00000294702 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
GFI1-201ENST00000294702 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.8
GFI1-201ENST00000294702 BACH2Q9BYV9 841 aa26.25■■□□□ 1.79
GFI1-201ENST00000294702 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.24■■□□□ 1.79
GFI1-201ENST00000294702 NCOA1Q15788 1441 aa26.24■■□□□ 1.79
GFI1-201ENST00000294702 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
GFI1-201ENST00000294702 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
GFI1-201ENST00000294702 PTPRKQ15262 1439 aa26.23■■□□□ 1.79
GFI1-201ENST00000294702 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
GFI1-201ENST00000294702 HFM1A2PYH4 1435 aa26.2■■□□□ 1.78
GFI1-201ENST00000294702 CUX1P39880 1505 aa26.19■■□□□ 1.78
GFI1-201ENST00000294702 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.18■■□□□ 1.78
GFI1-201ENST00000294702 WDR62O43379 1518 aa26.18■■□□□ 1.78
GFI1-201ENST00000294702 NFKBIBQ15653 356 aa26.18■■□□□ 1.78
GFI1-201ENST00000294702 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.16■■□□□ 1.78
GFI1-201ENST00000294702 P3H3Q8IVL6 736 aa26.16■■□□□ 1.78
GFI1-201ENST00000294702 PKNOX2Q96KN3 472 aa26.15■■□□□ 1.78
GFI1-201ENST00000294702 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.15■■□□□ 1.78
GFI1-201ENST00000294702 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.14■■□□□ 1.77
GFI1-201ENST00000294702 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.14■■□□□ 1.77
GFI1-201ENST00000294702 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
GFI1-201ENST00000294702 NAIPQ13075 1403 aa26.12■■□□□ 1.77
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