RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 NUP160Q12769 1436 aa29.01■■■□□ 2.24
CCDC78-201ENST00000293889 GOLGA3Q08378 1498 aa28.98■■■□□ 2.23
CCDC78-201ENST00000293889 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CCDC78-201ENST00000293889 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.81■■■□□ 2.2
CCDC78-201ENST00000293889 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.81■■■□□ 2.2
CCDC78-201ENST00000293889 ARHGEF11O15085 1522 aa28.81■■■□□ 2.2
CCDC78-201ENST00000293889 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.81■■■□□ 2.2
CCDC78-201ENST00000293889 SHROOM2Q13796 1616 aa28.8■■■□□ 2.2
CCDC78-201ENST00000293889 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.8■■■□□ 2.2
CCDC78-201ENST00000293889 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.77■■■□□ 2.2
CCDC78-201ENST00000293889 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.75■■■□□ 2.19
CCDC78-201ENST00000293889 IQGAP2Q13576 1575 aa28.71■■■□□ 2.19
CCDC78-201ENST00000293889 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.7■■■□□ 2.19
CCDC78-201ENST00000293889 JPH4Q96JJ6 628 aa28.69■■■□□ 2.18
CCDC78-201ENST00000293889 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
CCDC78-201ENST00000293889 ARAP1Q96P48 1450 aa28.61■■■□□ 2.17
CCDC78-201ENST00000293889 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CCDC78-201ENST00000293889 CEP162Q5TB80 1403 aa28.56■■■□□ 2.16
CCDC78-201ENST00000293889 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.56■■■□□ 2.16
CCDC78-201ENST00000293889 DISP1Q96F81 1524 aa28.5■■■□□ 2.15
CCDC78-201ENST00000293889 CLIP1P30622 1438 aa28.5■■■□□ 2.15
CCDC78-201ENST00000293889 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.49■■■□□ 2.15
CCDC78-201ENST00000293889 KIAA0556O60303 1618 aa28.44■■■□□ 2.14
CCDC78-201ENST00000293889 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.44■■■□□ 2.14
CCDC78-201ENST00000293889 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.42■■■□□ 2.14
CCDC78-201ENST00000293889 SAMD9Q5K651 1589 aa28.38■■■□□ 2.13
CCDC78-201ENST00000293889 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.38■■■□□ 2.13
CCDC78-201ENST00000293889 P3H3Q8IVL6 736 aa28.37■■■□□ 2.13
CCDC78-201ENST00000293889 PTPRGP23470 1445 aa28.31■■■□□ 2.12
CCDC78-201ENST00000293889 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.29■■■□□ 2.12
CCDC78-201ENST00000293889 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CCDC78-201ENST00000293889 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.23■■■□□ 2.11
CCDC78-201ENST00000293889 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.14■■■□□ 2.1
CCDC78-201ENST00000293889 UACAQ9BZF9 1416 aa28.14■■■□□ 2.09
CCDC78-201ENST00000293889 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.13■■■□□ 2.09
CCDC78-201ENST00000293889 FMN1Q68DA7 1419 aa28.12■■■□□ 2.09
CCDC78-201ENST00000293889 ABCA8O94911 1581 aa28.11■■■□□ 2.09
CCDC78-201ENST00000293889 ABCC2Q92887 1545 aa28.11■■■□□ 2.09
CCDC78-201ENST00000293889 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.11■■■□□ 2.09
CCDC78-201ENST00000293889 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.02■■■□□ 2.08
CCDC78-201ENST00000293889 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CCDC78-201ENST00000293889 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.01■■■□□ 2.07
CCDC78-201ENST00000293889 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.98■■■□□ 2.07
CCDC78-201ENST00000293889 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
CCDC78-201ENST00000293889 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
CCDC78-201ENST00000293889 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.97■■■□□ 2.07
CCDC78-201ENST00000293889 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.96■■■□□ 2.07
CCDC78-201ENST00000293889 MAPKBP1O60336 1514 aa27.94■■■□□ 2.06
CCDC78-201ENST00000293889 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CCDC78-201ENST00000293889 HECW1Q76N89 1606 aa27.89■■■□□ 2.06
CCDC78-201ENST00000293889 ARID3CA6NKF2 412 aa27.87■■■□□ 2.05
CCDC78-201ENST00000293889 ATP10BO94823 1461 aa27.87■■■□□ 2.05
CCDC78-201ENST00000293889 ASXL2Q76L83 1435 aa27.84■■■□□ 2.05
CCDC78-201ENST00000293889 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC78-201ENST00000293889 APLP2Q06481 763 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC78-201ENST00000293889 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CCDC78-201ENST00000293889 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.82■■■□□ 2.04
CCDC78-201ENST00000293889 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.79■■■□□ 2.04
CCDC78-201ENST00000293889 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
CCDC78-201ENST00000293889 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CCDC78-201ENST00000293889 DIP2BQ9P265 1576 aa27.78■■■□□ 2.04
CCDC78-201ENST00000293889 TIAM1Q13009 1591 aa27.77■■■□□ 2.04
CCDC78-201ENST00000293889 MAP3K1Q13233 1512 aa27.77■■■□□ 2.04
CCDC78-201ENST00000293889 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.76■■■□□ 2.03
CCDC78-201ENST00000293889 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.75■■■□□ 2.03
CCDC78-201ENST00000293889 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.74■■■□□ 2.03
CCDC78-201ENST00000293889 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
CCDC78-201ENST00000293889 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
CCDC78-201ENST00000293889 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CCDC78-201ENST00000293889 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
CCDC78-201ENST00000293889 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.67■■■□□ 2.02
CCDC78-201ENST00000293889 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.65■■■□□ 2.02
CCDC78-201ENST00000293889 GLI2P10070 1586 aa27.64■■■□□ 2.02
CCDC78-201ENST00000293889 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
CCDC78-201ENST00000293889 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.63■■■□□ 2.01
CCDC78-201ENST00000293889 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.61■■■□□ 2.01
CCDC78-201ENST00000293889 KCNH8Q96L42 1107 aa27.61■■■□□ 2.01
CCDC78-201ENST00000293889 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.59■■■□□ 2.01
CCDC78-201ENST00000293889 TSPOAP1O95153 1857 aa27.58■■■□□ 2.01
CCDC78-201ENST00000293889 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.57■■■□□ 2
CCDC78-201ENST00000293889 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.56■■■□□ 2
CCDC78-201ENST00000293889 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CCDC78-201ENST00000293889 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CCDC78-201ENST00000293889 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.52■■■□□ 2
CCDC78-201ENST00000293889 KIF14Q15058 1648 aa27.49■■□□□ 1.99
CCDC78-201ENST00000293889 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.99
CCDC78-201ENST00000293889 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.46■■□□□ 1.99
CCDC78-201ENST00000293889 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
CCDC78-201ENST00000293889 CD109Q6YHK3 1445 aa27.44■■□□□ 1.98
CCDC78-201ENST00000293889 NCOA2Q15596 1464 aa27.44■■□□□ 1.98
CCDC78-201ENST00000293889 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.37■■□□□ 1.97
CCDC78-201ENST00000293889 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.34■■□□□ 1.97
CCDC78-201ENST00000293889 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.33■■□□□ 1.97
CCDC78-201ENST00000293889 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.31■■□□□ 1.96
CCDC78-201ENST00000293889 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.28■■□□□ 1.96
CCDC78-201ENST00000293889 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.28■■□□□ 1.96
CCDC78-201ENST00000293889 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CCDC78-201ENST00000293889 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.27■■□□□ 1.96
CCDC78-201ENST00000293889 PLCH2O75038 1416 aa27.26■■□□□ 1.95
CCDC78-201ENST00000293889 PREX2Q70Z35 1606 aa27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms