RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TRPC1-201ENST00000273482 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TRPC1-201ENST00000273482 NCAPD3P42695 1498 aa23.62■■□□□ 1.37
TRPC1-201ENST00000273482 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.62■■□□□ 1.37
TRPC1-201ENST00000273482 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
TRPC1-201ENST00000273482 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.57■■□□□ 1.36
TRPC1-201ENST00000273482 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
TRPC1-201ENST00000273482 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.56■■□□□ 1.36
TRPC1-201ENST00000273482 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
TRPC1-201ENST00000273482 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.56■■□□□ 1.36
TRPC1-201ENST00000273482 TONSLQ96HA7 1378 aa23.56■■□□□ 1.36
TRPC1-201ENST00000273482 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.55■■□□□ 1.36
TRPC1-201ENST00000273482 TSPY4P0CV99 314 aa23.55■■□□□ 1.36
TRPC1-201ENST00000273482 TSPY10P0CW01 314 aa23.55■■□□□ 1.36
TRPC1-201ENST00000273482 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TRPC1-201ENST00000273482 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TRPC1-201ENST00000273482 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.44■■□□□ 1.34
TRPC1-201ENST00000273482 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.43■■□□□ 1.34
TRPC1-201ENST00000273482 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TRPC1-201ENST00000273482 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.4■■□□□ 1.34
TRPC1-201ENST00000273482 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TRPC1-201ENST00000273482 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.38■■□□□ 1.33
TRPC1-201ENST00000273482 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.37■■□□□ 1.33
TRPC1-201ENST00000273482 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TRPC1-201ENST00000273482 NESP48681 1621 aa23.35■■□□□ 1.33
TRPC1-201ENST00000273482 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.35■■□□□ 1.33
TRPC1-201ENST00000273482 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.35■■□□□ 1.33
TRPC1-201ENST00000273482 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.34■■□□□ 1.33
TRPC1-201ENST00000273482 IGF1RP08069 1367 aa23.34■■□□□ 1.33
TRPC1-201ENST00000273482 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.32■■□□□ 1.32
TRPC1-201ENST00000273482 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.3■■□□□ 1.32
TRPC1-201ENST00000273482 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.29■■□□□ 1.32
TRPC1-201ENST00000273482 CFTRP13569 1480 aa23.29■■□□□ 1.32
TRPC1-201ENST00000273482 BCL11AQ9H165 835 aa23.28■■□□□ 1.32
TRPC1-201ENST00000273482 NBR1Q14596 966 aa23.27■■□□□ 1.32
TRPC1-201ENST00000273482 SYNJ1O43426 1573 aa23.27■■□□□ 1.32
TRPC1-201ENST00000273482 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.24■■□□□ 1.31
TRPC1-201ENST00000273482 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TRPC1-201ENST00000273482 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.22■■□□□ 1.31
TRPC1-201ENST00000273482 JPH4Q96JJ6 628 aa23.18■■□□□ 1.3
TRPC1-201ENST00000273482 FMN1Q68DA7 1419 aa23.18■■□□□ 1.3
TRPC1-201ENST00000273482 RGL3Q3MIN7 710 aa23.18■■□□□ 1.3
TRPC1-201ENST00000273482 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
TRPC1-201ENST00000273482 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
TRPC1-201ENST00000273482 HMGXB3Q12766 1538 aa23.16■■□□□ 1.3
TRPC1-201ENST00000273482 MRS2Q9HD23 443 aa23.15■■□□□ 1.3
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.14■■□□□ 1.3
TRPC1-201ENST00000273482 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.14■■□□□ 1.29
TRPC1-201ENST00000273482 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
TRPC1-201ENST00000273482 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.12■■□□□ 1.29
TRPC1-201ENST00000273482 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
TRPC1-201ENST00000273482 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.11■■□□□ 1.29
TRPC1-201ENST00000273482 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.1■■□□□ 1.29
TRPC1-201ENST00000273482 CUX1P39880 1505 aa23.07■■□□□ 1.28
TRPC1-201ENST00000273482 FOXD1Q16676 465 aa23.06■■□□□ 1.28
TRPC1-201ENST00000273482 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
TRPC1-201ENST00000273482 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.02■■□□□ 1.28
TRPC1-201ENST00000273482 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.02■■□□□ 1.28
TRPC1-201ENST00000273482 TOP2BQ02880 1626 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPC1-201ENST00000273482 TOPBP1Q92547 1522 aa22.95■■□□□ 1.27
TRPC1-201ENST00000273482 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.95■■□□□ 1.26
TRPC1-201ENST00000273482 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRPC1-201ENST00000273482 CCER2I3L3R5 266 aa22.95■■□□□ 1.26
TRPC1-201ENST00000273482 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRPC1-201ENST00000273482 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TRPC1-201ENST00000273482 KIF21BO75037 1637 aa22.93■■□□□ 1.26
TRPC1-201ENST00000273482 TMC1Q8TDI8 760 aa22.93■■□□□ 1.26
TRPC1-201ENST00000273482 ARAP1Q96P48 1450 aa22.9■■□□□ 1.26
TRPC1-201ENST00000273482 PRXQ9BXM0 1461 aa22.9■■□□□ 1.26
TRPC1-201ENST00000273482 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.9■■□□□ 1.26
TRPC1-201ENST00000273482 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
TRPC1-201ENST00000273482 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.89■■□□□ 1.25
TRPC1-201ENST00000273482 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TRPC1-201ENST00000273482 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.85■■□□□ 1.25
TRPC1-201ENST00000273482 PKD2Q13563 968 aa22.85■■□□□ 1.25
TRPC1-201ENST00000273482 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.84■■□□□ 1.25
TRPC1-201ENST00000273482 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.83■■□□□ 1.25
TRPC1-201ENST00000273482 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.82■■□□□ 1.24
TRPC1-201ENST00000273482 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TRPC1-201ENST00000273482 PTPRGP23470 1445 aa22.8■■□□□ 1.24
TRPC1-201ENST00000273482 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.8■■□□□ 1.24
TRPC1-201ENST00000273482 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TRPC1-201ENST00000273482 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.78■■□□□ 1.24
TRPC1-201ENST00000273482 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
TRPC1-201ENST00000273482 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.76■■□□□ 1.23
TRPC1-201ENST00000273482 GRIN2BQ13224 1484 aa22.76■■□□□ 1.23
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.76■■□□□ 1.23
TRPC1-201ENST00000273482 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.76■■□□□ 1.23
TRPC1-201ENST00000273482 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TRPC1-201ENST00000273482 GGT6Q6P531 493 aa22.74■■□□□ 1.23
TRPC1-201ENST00000273482 NUP155O75694 1391 aa22.74■■□□□ 1.23
TRPC1-201ENST00000273482 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRPC1-201ENST00000273482 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.71■■□□□ 1.23
TRPC1-201ENST00000273482 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRPC1-201ENST00000273482 MLECQ14165 292 aa22.7■■□□□ 1.22
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.68■■□□□ 1.22
TRPC1-201ENST00000273482 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TRPC1-201ENST00000273482 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.65■■□□□ 1.22
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