RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271688.10

CERS2-201, Transcript of ceramide synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CERS2, Length 2,544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2-201ENST00000271688 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
CERS2-201ENST00000271688 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
CERS2-201ENST00000271688 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.54■■■■■ 4.08
CERS2-201ENST00000271688 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.53■■■■■ 4.08
CERS2-201ENST00000271688 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
CERS2-201ENST00000271688 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.51■■■■■ 4.08
CERS2-201ENST00000271688 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.51■■■■■ 4.08
CERS2-201ENST00000271688 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
CERS2-201ENST00000271688 MIER1Q8N108 512 aa40.47■■■■■ 4.07
CERS2-201ENST00000271688 CUL7Q14999 1698 aa40.45■■■■■ 4.07
CERS2-201ENST00000271688 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.45■■■■■ 4.07
CERS2-201ENST00000271688 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
CERS2-201ENST00000271688 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.39■■■■■ 4.06
CERS2-201ENST00000271688 WDR97A6NE52 1622 aa40.39■■■■■ 4.06
CERS2-201ENST00000271688 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.37■■■■■ 4.05
CERS2-201ENST00000271688 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.35■■■■■ 4.05
CERS2-201ENST00000271688 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
CERS2-201ENST00000271688 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
CERS2-201ENST00000271688 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.32■■■■■ 4.04
CERS2-201ENST00000271688 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.29■■■■■ 4.04
CERS2-201ENST00000271688 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa40.26■■■■■ 4.04
CERS2-201ENST00000271688 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.26■■■■■ 4.03
CERS2-201ENST00000271688 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.25■■■■■ 4.03
CERS2-201ENST00000271688 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.24■■■■■ 4.03
CERS2-201ENST00000271688 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.24■■■■■ 4.03
CERS2-201ENST00000271688 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.23■■■■■ 4.03
CERS2-201ENST00000271688 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.18■■■■■ 4.02
CERS2-201ENST00000271688 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.15■■■■■ 4.026e-9■■■■□ 25.2
CERS2-201ENST00000271688 MAPKBP1O60336 1514 aa40.13■■■■■ 4.01
CERS2-201ENST00000271688 FMN1Q68DA7 1419 aa40.1■■■■■ 4.01
CERS2-201ENST00000271688 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.06■■■■■ 4
CERS2-201ENST00000271688 SAMD9Q5K651 1589 aa40.01■■■■■ 4
CERS2-201ENST00000271688 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
CERS2-201ENST00000271688 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.95■■■■□ 3.99
CERS2-201ENST00000271688 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.93■■■■□ 3.98
CERS2-201ENST00000271688 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.92■■■■□ 3.98
CERS2-201ENST00000271688 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.88■■■■□ 3.98
CERS2-201ENST00000271688 GRIN2BQ13224 1484 aa39.85■■■■□ 3.97
CERS2-201ENST00000271688 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.84■■■■□ 3.972e-20■■■□□ 16.6
CERS2-201ENST00000271688 PBRM1Q86U86 1689 aa39.8■■■■□ 3.96
CERS2-201ENST00000271688 NCOA2Q15596 1464 aa39.74■■■■□ 3.95
CERS2-201ENST00000271688 PTPRKQ15262 1439 aa39.72■■■■□ 3.95
CERS2-201ENST00000271688 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.69■■■■□ 3.94
CERS2-201ENST00000271688 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
CERS2-201ENST00000271688 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.65■■■■□ 3.94
CERS2-201ENST00000271688 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
CERS2-201ENST00000271688 ADAMTS12P58397 1594 aa39.63■■■■□ 3.94
CERS2-201ENST00000271688 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.63■■■■□ 3.93
CERS2-201ENST00000271688 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.61■■■■□ 3.93
CERS2-201ENST00000271688 IQGAP2Q13576 1575 aa39.61■■■■□ 3.93
CERS2-201ENST00000271688 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.59■■■■□ 3.93
CERS2-201ENST00000271688 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
CERS2-201ENST00000271688 HFM1A2PYH4 1435 aa39.55■■■■□ 3.92
CERS2-201ENST00000271688 ARID3CA6NKF2 412 aa39.53■■■■□ 3.92
CERS2-201ENST00000271688 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
CERS2-201ENST00000271688 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.53■■■■□ 3.92
CERS2-201ENST00000271688 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.52■■■■□ 3.92
CERS2-201ENST00000271688 HECW1Q76N89 1606 aa39.48■■■■□ 3.91
CERS2-201ENST00000271688 NAIPQ13075 1403 aa39.47■■■■□ 3.91
CERS2-201ENST00000271688 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.47■■■■□ 3.91
CERS2-201ENST00000271688 ARHGEF11O15085 1522 aa39.46■■■■□ 3.91
CERS2-201ENST00000271688 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
CERS2-201ENST00000271688 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
CERS2-201ENST00000271688 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
CERS2-201ENST00000271688 UACAQ9BZF9 1416 aa39.42■■■■□ 3.9
CERS2-201ENST00000271688 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
CERS2-201ENST00000271688 IFT140Q96RY7 1462 aa39.41■■■■□ 3.9
CERS2-201ENST00000271688 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.4■■■■□ 3.9
CERS2-201ENST00000271688 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
CERS2-201ENST00000271688 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.37■■■■□ 3.89
CERS2-201ENST00000271688 WDR62O43379 1518 aa39.35■■■■□ 3.89
CERS2-201ENST00000271688 KCNH8Q96L42 1107 aa39.35■■■■□ 3.89
CERS2-201ENST00000271688 TONSLQ96HA7 1378 aa39.32■■■■□ 3.89
CERS2-201ENST00000271688 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
CERS2-201ENST00000271688 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.22■■■■□ 3.87
CERS2-201ENST00000271688 DISP1Q96F81 1524 aa39.22■■■■□ 3.87
CERS2-201ENST00000271688 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
CERS2-201ENST00000271688 KIAA0556O60303 1618 aa39.19■■■■□ 3.86
CERS2-201ENST00000271688 GRIN2AQ12879 1464 aa39.17■■■■□ 3.86
CERS2-201ENST00000271688 KDM6BO15054 1643 aa39.15■■■■□ 3.86
CERS2-201ENST00000271688 TRIM52Q96A61 297 aa39.14■■■■□ 3.86
CERS2-201ENST00000271688 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.14■■■■□ 3.86
CERS2-201ENST00000271688 ERCC6Q03468 1493 aa39.14■■■■□ 3.86
CERS2-201ENST00000271688 MIA2Q96PC5 1412 aa39.13■■■■□ 3.85
CERS2-201ENST00000271688 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
CERS2-201ENST00000271688 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.84
CERS2-201ENST00000271688 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.03■■■■□ 3.84
CERS2-201ENST00000271688 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.02■■■■□ 3.84
CERS2-201ENST00000271688 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
CERS2-201ENST00000271688 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
CERS2-201ENST00000271688 AKNAQ7Z591 1439 aa39.01■■■■□ 3.84
CERS2-201ENST00000271688 FBLN2P98095 1184 aa39.01■■■■□ 3.83
CERS2-201ENST00000271688 MPHOSPH9Q99550 1183 aa38.95■■■■□ 3.83
CERS2-201ENST00000271688 CEP170Q5SW79 1584 aa38.94■■■■□ 3.82
CERS2-201ENST00000271688 FOXD1Q16676 465 aa38.94■■■■□ 3.82
CERS2-201ENST00000271688 DAPK1P53355 1430 aa38.93■■■■□ 3.82
CERS2-201ENST00000271688 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
CERS2-201ENST00000271688 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
CERS2-201ENST00000271688 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
CERS2-201ENST00000271688 ABCC5O15440 1437 aa38.89■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms