RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269980.6

BCKDHA-201, Transcript of branched chain keto acid dehydrogenase E1, alpha polypeptide, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDHA, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHA-201ENST00000269980 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
BCKDHA-201ENST00000269980 IFT140Q96RY7 1462 aa22.44■■□□□ 1.18
BCKDHA-201ENST00000269980 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.43■■□□□ 1.18
BCKDHA-201ENST00000269980 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
BCKDHA-201ENST00000269980 NEUROD1Q13562 356 aa22.37■■□□□ 1.17
BCKDHA-201ENST00000269980 TIAM1Q13009 1591 aa22.37■■□□□ 1.17
BCKDHA-201ENST00000269980 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
BCKDHA-201ENST00000269980 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.34■■□□□ 1.17
BCKDHA-201ENST00000269980 MAP3K1Q13233 1512 aa22.34■■□□□ 1.17
BCKDHA-201ENST00000269980 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
BCKDHA-201ENST00000269980 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.31■■□□□ 1.16
BCKDHA-201ENST00000269980 WDR97A6NE52 1622 aa22.29■■□□□ 1.16
BCKDHA-201ENST00000269980 FBLN2P98095 1184 aa22.29■■□□□ 1.16
BCKDHA-201ENST00000269980 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.29■■□□□ 1.16
BCKDHA-201ENST00000269980 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.29■■□□□ 1.16
BCKDHA-201ENST00000269980 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.28■■□□□ 1.16
BCKDHA-201ENST00000269980 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
BCKDHA-201ENST00000269980 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.24■■□□□ 1.15
BCKDHA-201ENST00000269980 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.24■■□□□ 1.15
BCKDHA-201ENST00000269980 CUL7Q14999 1698 aa22.24■■□□□ 1.15
BCKDHA-201ENST00000269980 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.21■■□□□ 1.15
BCKDHA-201ENST00000269980 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.2■■□□□ 1.14
BCKDHA-201ENST00000269980 MIER1Q8N108 512 aa22.18■■□□□ 1.14
BCKDHA-201ENST00000269980 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.17■■□□□ 1.14
BCKDHA-201ENST00000269980 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.17■■□□□ 1.14
BCKDHA-201ENST00000269980 GRIN2BQ13224 1484 aa22.16■■□□□ 1.14
BCKDHA-201ENST00000269980 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.15■■□□□ 1.14
BCKDHA-201ENST00000269980 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.14■■□□□ 1.14
BCKDHA-201ENST00000269980 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
BCKDHA-201ENST00000269980 P3H3Q8IVL6 736 aa22.13■■□□□ 1.13
BCKDHA-201ENST00000269980 PBRM1Q86U86 1689 aa22.11■■□□□ 1.13
BCKDHA-201ENST00000269980 MAPKBP1O60336 1514 aa22.11■■□□□ 1.13
BCKDHA-201ENST00000269980 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.1■■□□□ 1.13
BCKDHA-201ENST00000269980 ITGAEP38570 1179 aa22.1■■□□□ 1.13
BCKDHA-201ENST00000269980 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
BCKDHA-201ENST00000269980 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.09■■□□□ 1.13
BCKDHA-201ENST00000269980 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.08■■□□□ 1.12
BCKDHA-201ENST00000269980 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.07■■□□□ 1.12
BCKDHA-201ENST00000269980 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.06■■□□□ 1.12
BCKDHA-201ENST00000269980 SAMD9Q5K651 1589 aa22.03■■□□□ 1.12
BCKDHA-201ENST00000269980 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.01■■□□□ 1.11
BCKDHA-201ENST00000269980 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
BCKDHA-201ENST00000269980 CHD1O14646 1710 aa21.99■■□□□ 1.11
BCKDHA-201ENST00000269980 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
BCKDHA-201ENST00000269980 ADAMTS12P58397 1594 aa21.98■■□□□ 1.11
BCKDHA-201ENST00000269980 SYNJ2O15056 1496 aa21.97■■□□□ 1.11
BCKDHA-201ENST00000269980 OSCARQ8IYS5 282 aa21.95■■□□□ 1.1
BCKDHA-201ENST00000269980 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
BCKDHA-201ENST00000269980 FMN1Q68DA7 1419 aa21.94■■□□□ 1.1
BCKDHA-201ENST00000269980 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
BCKDHA-201ENST00000269980 GRIN2AQ12879 1464 aa21.92■■□□□ 1.1
BCKDHA-201ENST00000269980 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.13e-6■■■■■ 41.5
BCKDHA-201ENST00000269980 CEP170Q5SW79 1584 aa21.86■■□□□ 1.09
BCKDHA-201ENST00000269980 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.86■■□□□ 1.09
BCKDHA-201ENST00000269980 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.8■■□□□ 1.08
BCKDHA-201ENST00000269980 PTPRKQ15262 1439 aa21.8■■□□□ 1.08
BCKDHA-201ENST00000269980 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.79■■□□□ 1.08
BCKDHA-201ENST00000269980 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
BCKDHA-201ENST00000269980 NCOA2Q15596 1464 aa21.78■■□□□ 1.08
BCKDHA-201ENST00000269980 NUP160Q12769 1436 aa21.77■■□□□ 1.08
BCKDHA-201ENST00000269980 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
BCKDHA-201ENST00000269980 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.77■■□□□ 1.08
BCKDHA-201ENST00000269980 ARHGEF11O15085 1522 aa21.75■■□□□ 1.07
BCKDHA-201ENST00000269980 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.75■■□□□ 1.07
BCKDHA-201ENST00000269980 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.74■■□□□ 1.07
BCKDHA-201ENST00000269980 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.74■■□□□ 1.07
BCKDHA-201ENST00000269980 JPH4Q96JJ6 628 aa21.73■■□□□ 1.07
BCKDHA-201ENST00000269980 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.73■■□□□ 1.07
BCKDHA-201ENST00000269980 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.73■■□□□ 1.07
BCKDHA-201ENST00000269980 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.73■■□□□ 1.07
BCKDHA-201ENST00000269980 IQGAP2Q13576 1575 aa21.72■■□□□ 1.07
BCKDHA-201ENST00000269980 HFM1A2PYH4 1435 aa21.71■■□□□ 1.07
BCKDHA-201ENST00000269980 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.7■■□□□ 1.06
BCKDHA-201ENST00000269980 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.7■■□□□ 1.06
BCKDHA-201ENST00000269980 HECW1Q76N89 1606 aa21.66■■□□□ 1.06
BCKDHA-201ENST00000269980 NAIPQ13075 1403 aa21.66■■□□□ 1.06
BCKDHA-201ENST00000269980 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.64■■□□□ 1.05
BCKDHA-201ENST00000269980 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.64■■□□□ 1.05
BCKDHA-201ENST00000269980 UACAQ9BZF9 1416 aa21.63■■□□□ 1.05
BCKDHA-201ENST00000269980 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
BCKDHA-201ENST00000269980 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
BCKDHA-201ENST00000269980 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
BCKDHA-201ENST00000269980 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
BCKDHA-201ENST00000269980 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
BCKDHA-201ENST00000269980 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.59■■□□□ 1.05
BCKDHA-201ENST00000269980 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.58■■□□□ 1.05
BCKDHA-201ENST00000269980 KCNH8Q96L42 1107 aa21.56■■□□□ 1.04
BCKDHA-201ENST00000269980 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.56■■□□□ 1.04
BCKDHA-201ENST00000269980 KDM6BO15054 1643 aa21.55■■□□□ 1.04
BCKDHA-201ENST00000269980 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
BCKDHA-201ENST00000269980 DISP1Q96F81 1524 aa21.52■■□□□ 1.04
BCKDHA-201ENST00000269980 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.51■■□□□ 1.03
BCKDHA-201ENST00000269980 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.51■■□□□ 1.03
BCKDHA-201ENST00000269980 KIAA0556O60303 1618 aa21.51■■□□□ 1.03
BCKDHA-201ENST00000269980 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.51■■□□□ 1.03
BCKDHA-201ENST00000269980 ARID3CA6NKF2 412 aa21.5■■□□□ 1.03
BCKDHA-201ENST00000269980 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
BCKDHA-201ENST00000269980 SHROOM2Q13796 1616 aa21.5■■□□□ 1.03
BCKDHA-201ENST00000269980 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
BCKDHA-201ENST00000269980 TONSLQ96HA7 1378 aa21.46■■□□□ 1.03
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