RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264266.12

MFSD1-201, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MFSD1, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-201ENST00000264266 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.53■■■□□ 2.48
MFSD1-201ENST00000264266 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.47■■■□□ 2.47
MFSD1-201ENST00000264266 SHROOM2Q13796 1616 aa30.41■■■□□ 2.46
MFSD1-201ENST00000264266 PRXQ9BXM0 1461 aa30.41■■■□□ 2.46
MFSD1-201ENST00000264266 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.39■■■□□ 2.46
MFSD1-201ENST00000264266 ARAP1Q96P48 1450 aa30.36■■■□□ 2.45
MFSD1-201ENST00000264266 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.36■■■□□ 2.45
MFSD1-201ENST00000264266 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.32■■■□□ 2.44
MFSD1-201ENST00000264266 IQGAP2Q13576 1575 aa30.29■■■□□ 2.44
MFSD1-201ENST00000264266 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
MFSD1-201ENST00000264266 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.27■■■□□ 2.44
MFSD1-201ENST00000264266 JPH4Q96JJ6 628 aa30.26■■■□□ 2.43
MFSD1-201ENST00000264266 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.23■■■□□ 2.43
MFSD1-201ENST00000264266 GOLGA3Q08378 1498 aa30.22■■■□□ 2.43
MFSD1-201ENST00000264266 KIF21BO75037 1637 aa30.21■■■□□ 2.43
MFSD1-201ENST00000264266 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.17■■■□□ 2.42
MFSD1-201ENST00000264266 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
MFSD1-201ENST00000264266 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.08■■■□□ 2.41
MFSD1-201ENST00000264266 DISP1Q96F81 1524 aa30.05■■■□□ 2.4
MFSD1-201ENST00000264266 KIAA0556O60303 1618 aa30.02■■■□□ 2.4
MFSD1-201ENST00000264266 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.01■■■□□ 2.39
MFSD1-201ENST00000264266 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
MFSD1-201ENST00000264266 CEP162Q5TB80 1403 aa29.95■■■□□ 2.39
MFSD1-201ENST00000264266 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
MFSD1-201ENST00000264266 PTPRGP23470 1445 aa29.89■■■□□ 2.37
MFSD1-201ENST00000264266 SAMD9Q5K651 1589 aa29.86■■■□□ 2.37
MFSD1-201ENST00000264266 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.85■■■□□ 2.37
MFSD1-201ENST00000264266 P3H3Q8IVL6 736 aa29.81■■■□□ 2.36
MFSD1-201ENST00000264266 CLIP1P30622 1438 aa29.74■■■□□ 2.35
MFSD1-201ENST00000264266 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.73■■■□□ 2.35
MFSD1-201ENST00000264266 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.71■■■□□ 2.35
MFSD1-201ENST00000264266 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.7■■■□□ 2.35
MFSD1-201ENST00000264266 ABCC2Q92887 1545 aa29.7■■■□□ 2.34
MFSD1-201ENST00000264266 UACAQ9BZF9 1416 aa29.7■■■□□ 2.34
MFSD1-201ENST00000264266 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.64■■■□□ 2.34
MFSD1-201ENST00000264266 ABCA8O94911 1581 aa29.64■■■□□ 2.34
MFSD1-201ENST00000264266 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.63■■■□□ 2.33
MFSD1-201ENST00000264266 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
MFSD1-201ENST00000264266 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
MFSD1-201ENST00000264266 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
MFSD1-201ENST00000264266 MAPKBP1O60336 1514 aa29.55■■■□□ 2.32
MFSD1-201ENST00000264266 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.54■■■□□ 2.32
MFSD1-201ENST00000264266 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.53■■■□□ 2.32
MFSD1-201ENST00000264266 ARID3CA6NKF2 412 aa29.5■■■□□ 2.31
MFSD1-201ENST00000264266 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.49■■■□□ 2.31
MFSD1-201ENST00000264266 ASXL2Q76L83 1435 aa29.44■■■□□ 2.3
MFSD1-201ENST00000264266 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.44■■■□□ 2.3
MFSD1-201ENST00000264266 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
MFSD1-201ENST00000264266 DIP2BQ9P265 1576 aa29.43■■■□□ 2.3
MFSD1-201ENST00000264266 FMN1Q68DA7 1419 aa29.39■■■□□ 2.3
MFSD1-201ENST00000264266 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.38■■■□□ 2.29
MFSD1-201ENST00000264266 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
MFSD1-201ENST00000264266 ATP10BO94823 1461 aa29.37■■■□□ 2.29
MFSD1-201ENST00000264266 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
MFSD1-201ENST00000264266 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.33■■■□□ 2.29
MFSD1-201ENST00000264266 HECW1Q76N89 1606 aa29.33■■■□□ 2.29
MFSD1-201ENST00000264266 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
MFSD1-201ENST00000264266 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.3■■■□□ 2.28
MFSD1-201ENST00000264266 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.3■■■□□ 2.28
MFSD1-201ENST00000264266 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
MFSD1-201ENST00000264266 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
MFSD1-201ENST00000264266 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
MFSD1-201ENST00000264266 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
MFSD1-201ENST00000264266 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.26■■■□□ 2.27
MFSD1-201ENST00000264266 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
MFSD1-201ENST00000264266 TSPOAP1O95153 1857 aa29.22■■■□□ 2.27
MFSD1-201ENST00000264266 APLP2Q06481 763 aa29.21■■■□□ 2.27
MFSD1-201ENST00000264266 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.2■■■□□ 2.27
MFSD1-201ENST00000264266 GLI2P10070 1586 aa29.19■■■□□ 2.26
MFSD1-201ENST00000264266 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.18■■■□□ 2.26
MFSD1-201ENST00000264266 KCNH8Q96L42 1107 aa29.18■■■□□ 2.26
MFSD1-201ENST00000264266 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.14■■■□□ 2.26
MFSD1-201ENST00000264266 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
MFSD1-201ENST00000264266 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.07■■■□□ 2.24
MFSD1-201ENST00000264266 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.07■■■□□ 2.24
MFSD1-201ENST00000264266 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.05■■■□□ 2.24
MFSD1-201ENST00000264266 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.04■■■□□ 2.24
MFSD1-201ENST00000264266 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.01■■■□□ 2.23
MFSD1-201ENST00000264266 TTC37Q6PGP7 1564 aa29■■■□□ 2.23
MFSD1-201ENST00000264266 KIF14Q15058 1648 aa29■■■□□ 2.23
MFSD1-201ENST00000264266 CD109Q6YHK3 1445 aa29■■■□□ 2.23
MFSD1-201ENST00000264266 MAP3K1Q13233 1512 aa28.99■■■□□ 2.23
MFSD1-201ENST00000264266 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
MFSD1-201ENST00000264266 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
MFSD1-201ENST00000264266 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
MFSD1-201ENST00000264266 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.92■■■□□ 2.22
MFSD1-201ENST00000264266 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
MFSD1-201ENST00000264266 KDM6BO15054 1643 aa28.9■■■□□ 2.22
MFSD1-201ENST00000264266 TIAM1Q13009 1591 aa28.88■■■□□ 2.21
MFSD1-201ENST00000264266 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.82■■■□□ 2.2
MFSD1-201ENST00000264266 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.81■■■□□ 2.2
MFSD1-201ENST00000264266 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.81■■■□□ 2.2
MFSD1-201ENST00000264266 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
MFSD1-201ENST00000264266 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.79■■■□□ 2.2
MFSD1-201ENST00000264266 FANCAO15360 1455 aa28.75■■■□□ 2.19
MFSD1-201ENST00000264266 NEO1Q92859 1461 aa28.73■■■□□ 2.19
MFSD1-201ENST00000264266 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.72■■■□□ 2.19
MFSD1-201ENST00000264266 PREX2Q70Z35 1606 aa28.72■■■□□ 2.19
MFSD1-201ENST00000264266 PLCH2O75038 1416 aa28.72■■■□□ 2.19
MFSD1-201ENST00000264266 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.71■■■□□ 2.19
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