RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263036.9

OPTN-201, Transcript of optineurin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene OPTN, Length 2,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-201ENST00000263036 BCL11AQ9H165 835 aa15.32■□□□□ 0.04
OPTN-201ENST00000263036 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
OPTN-201ENST00000263036 ITGAEP38570 1179 aa15.3■□□□□ 0.04
OPTN-201ENST00000263036 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.29■□□□□ 0.04
OPTN-201ENST00000263036 MAP3K1Q13233 1512 aa15.29■□□□□ 0.04
OPTN-201ENST00000263036 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
OPTN-201ENST00000263036 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
OPTN-201ENST00000263036 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.28■□□□□ 0.04
OPTN-201ENST00000263036 NEFLP07196 543 aa15.28■□□□□ 0.04
OPTN-201ENST00000263036 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
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OPTN-201ENST00000263036 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
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OPTN-201ENST00000263036 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.21■□□□□ 0.02
OPTN-201ENST00000263036 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.19■□□□□ 0.02
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OPTN-201ENST00000263036 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
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OPTN-201ENST00000263036 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.013e-7■■□□□ 11.5
OPTN-201ENST00000263036 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.96□□□□□ -0.01
OPTN-201ENST00000263036 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.96□□□□□ -0.01
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OPTN-201ENST00000263036 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.92□□□□□ -0.02
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OPTN-201ENST00000263036 NAIPQ13075 1403 aa14.87□□□□□ -0.03
OPTN-201ENST00000263036 NCOA2Q15596 1464 aa14.86□□□□□ -0.03
OPTN-201ENST00000263036 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.86□□□□□ -0.03
OPTN-201ENST00000263036 FMN1Q68DA7 1419 aa14.86□□□□□ -0.03
OPTN-201ENST00000263036 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
OPTN-201ENST00000263036 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.83□□□□□ -0.04
OPTN-201ENST00000263036 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.83□□□□□ -0.04
OPTN-201ENST00000263036 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.82□□□□□ -0.04
OPTN-201ENST00000263036 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
OPTN-201ENST00000263036 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.81□□□□□ -0.04
OPTN-201ENST00000263036 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
OPTN-201ENST00000263036 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.8□□□□□ -0.04
OPTN-201ENST00000263036 CCDC184Q52MB2 194 aa14.78□□□□□ -0.04
OPTN-201ENST00000263036 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
OPTN-201ENST00000263036 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.77□□□□□ -0.04
OPTN-201ENST00000263036 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.76□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 NCOA1Q15788 1441 aa14.76□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 CUL7Q14999 1698 aa14.75□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 CCDC7Q96M83 1385 aa14.75□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.74□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 MRS2Q9HD23 443 aa14.73□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 HECW1Q76N89 1606 aa14.73□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.73□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 AKNAQ7Z591 1439 aa14.73□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 GRIN2BQ13224 1484 aa14.72□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.72□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.71□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 ARHGEF11O15085 1522 aa14.71□□□□□ -0.05
OPTN-201ENST00000263036 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
OPTN-201ENST00000263036 SAMD9Q5K651 1589 aa14.7□□□□□ -0.06
OPTN-201ENST00000263036 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.7□□□□□ -0.06
OPTN-201ENST00000263036 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.7□□□□□ -0.06
OPTN-201ENST00000263036 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
OPTN-201ENST00000263036 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.7□□□□□ -0.06
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