RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261731.3

LHX5-201, Transcript of LIM homeobox 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX5, Length 2,939 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5-201ENST00000261731 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX5-201ENST00000261731 ITGAEP38570 1179 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX5-201ENST00000261731 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
LHX5-201ENST00000261731 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
LHX5-201ENST00000261731 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
LHX5-201ENST00000261731 TOPBP1Q92547 1522 aa23.11■■□□□ 1.29
LHX5-201ENST00000261731 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.09■■□□□ 1.29
LHX5-201ENST00000261731 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.06■■□□□ 1.28
LHX5-201ENST00000261731 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
LHX5-201ENST00000261731 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
LHX5-201ENST00000261731 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23■■□□□ 1.27
LHX5-201ENST00000261731 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
LHX5-201ENST00000261731 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.97■■□□□ 1.27
LHX5-201ENST00000261731 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.97■■□□□ 1.27
LHX5-201ENST00000261731 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
LHX5-201ENST00000261731 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.96■■□□□ 1.27
LHX5-201ENST00000261731 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
LHX5-201ENST00000261731 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
LHX5-201ENST00000261731 TIAM1Q13009 1591 aa22.92■■□□□ 1.26
LHX5-201ENST00000261731 MSH5O43196 834 aa22.91■■□□□ 1.26
LHX5-201ENST00000261731 BCANQ96GW7 911 aa22.9■■□□□ 1.26
LHX5-201ENST00000261731 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LHX5-201ENST00000261731 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.9■■□□□ 1.26
LHX5-201ENST00000261731 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
LHX5-201ENST00000261731 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.88■■□□□ 1.25
LHX5-201ENST00000261731 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.87■■□□□ 1.25
LHX5-201ENST00000261731 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.85■■□□□ 1.25
LHX5-201ENST00000261731 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.84■■□□□ 1.25
LHX5-201ENST00000261731 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
LHX5-201ENST00000261731 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.8■■□□□ 1.24
LHX5-201ENST00000261731 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.78■■□□□ 1.24
LHX5-201ENST00000261731 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.78■■□□□ 1.24
LHX5-201ENST00000261731 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.78■■□□□ 1.24
LHX5-201ENST00000261731 WDR97A6NE52 1622 aa22.77■■□□□ 1.24
LHX5-201ENST00000261731 CUL7Q14999 1698 aa22.75■■□□□ 1.23
LHX5-201ENST00000261731 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.74■■□□□ 1.23
LHX5-201ENST00000261731 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.72■■□□□ 1.23
LHX5-201ENST00000261731 ARID3CA6NKF2 412 aa22.71■■□□□ 1.23
LHX5-201ENST00000261731 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.7■■□□□ 1.22
LHX5-201ENST00000261731 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
LHX5-201ENST00000261731 MAP3K1Q13233 1512 aa22.68■■□□□ 1.22
LHX5-201ENST00000261731 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
LHX5-201ENST00000261731 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.66■■□□□ 1.22
LHX5-201ENST00000261731 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.65■■□□□ 1.22
LHX5-201ENST00000261731 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.65■■□□□ 1.22
LHX5-201ENST00000261731 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
LHX5-201ENST00000261731 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.64■■□□□ 1.21
LHX5-201ENST00000261731 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
LHX5-201ENST00000261731 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.61■■□□□ 1.21
LHX5-201ENST00000261731 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.61■■□□□ 1.21
LHX5-201ENST00000261731 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.61■■□□□ 1.21
LHX5-201ENST00000261731 MAPKBP1O60336 1514 aa22.6■■□□□ 1.21
LHX5-201ENST00000261731 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.59■■□□□ 1.21
LHX5-201ENST00000261731 FKBP8Q14318 412 aa22.59■■□□□ 1.21
LHX5-201ENST00000261731 FMN1Q68DA7 1419 aa22.58■■□□□ 1.21
LHX5-201ENST00000261731 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.58■■□□□ 1.2
LHX5-201ENST00000261731 SLC24A1O60721 1099 aa22.57■■□□□ 1.2
LHX5-201ENST00000261731 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.57■■□□□ 1.2
LHX5-201ENST00000261731 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LHX5-201ENST00000261731 SAMD9Q5K651 1589 aa22.52■■□□□ 1.2
LHX5-201ENST00000261731 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.5■■□□□ 1.19
LHX5-201ENST00000261731 PBRM1Q86U86 1689 aa22.49■■□□□ 1.19
LHX5-201ENST00000261731 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.48■■□□□ 1.19
LHX5-201ENST00000261731 PTPRKQ15262 1439 aa22.47■■□□□ 1.19
LHX5-201ENST00000261731 GRIN2BQ13224 1484 aa22.47■■□□□ 1.19
LHX5-201ENST00000261731 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LHX5-201ENST00000261731 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
LHX5-201ENST00000261731 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.45■■□□□ 1.18
LHX5-201ENST00000261731 NCOA2Q15596 1464 aa22.45■■□□□ 1.18
LHX5-201ENST00000261731 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.44■■□□□ 1.18
LHX5-201ENST00000261731 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.43■■□□□ 1.18
LHX5-201ENST00000261731 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.42■■□□□ 1.18
LHX5-201ENST00000261731 IL27Q8NEV9 243 aa22.42■■□□□ 1.18
LHX5-201ENST00000261731 ADAMTS12P58397 1594 aa22.4■■□□□ 1.18
LHX5-201ENST00000261731 PLEKHG5O94827 1062 aa22.4■■□□□ 1.18
LHX5-201ENST00000261731 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
LHX5-201ENST00000261731 IQGAP2Q13576 1575 aa22.38■■□□□ 1.17
LHX5-201ENST00000261731 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.37■■□□□ 1.17
LHX5-201ENST00000261731 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.36■■□□□ 1.17
LHX5-201ENST00000261731 FBLN2P98095 1184 aa22.35■■□□□ 1.17
LHX5-201ENST00000261731 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.34■■□□□ 1.17
LHX5-201ENST00000261731 NBR1Q14596 966 aa22.33■■□□□ 1.17
LHX5-201ENST00000261731 KCNH8Q96L42 1107 aa22.32■■□□□ 1.16
LHX5-201ENST00000261731 ERCC6Q03468 1493 aa22.32■■□□□ 1.16
LHX5-201ENST00000261731 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
LHX5-201ENST00000261731 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.29■■□□□ 1.16
LHX5-201ENST00000261731 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LHX5-201ENST00000261731 IFT140Q96RY7 1462 aa22.28■■□□□ 1.16
LHX5-201ENST00000261731 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
LHX5-201ENST00000261731 NEFLP07196 543 aa22.27■■□□□ 1.16
LHX5-201ENST00000261731 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
LHX5-201ENST00000261731 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.26■■□□□ 1.15
LHX5-201ENST00000261731 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.26■■□□□ 1.15
LHX5-201ENST00000261731 NAIPQ13075 1403 aa22.26■■□□□ 1.15
LHX5-201ENST00000261731 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
LHX5-201ENST00000261731 WDR62O43379 1518 aa22.25■■□□□ 1.15
LHX5-201ENST00000261731 HFM1A2PYH4 1435 aa22.24■■□□□ 1.15
LHX5-201ENST00000261731 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
LHX5-201ENST00000261731 HECW1Q76N89 1606 aa22.24■■□□□ 1.15
LHX5-201ENST00000261731 TRIM52Q96A61 297 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms