RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CSDE1-201ENST00000261443 PRXQ9BXM0 1461 aa10.1□□□□□ -0.79
CSDE1-201ENST00000261443 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CSDE1-201ENST00000261443 CUX2O14529 1486 aa10.09□□□□□ -0.79
CSDE1-201ENST00000261443 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CSDE1-201ENST00000261443 CFTRP13569 1480 aa10.08□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 PRDM2Q13029 1718 aa10.08□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 WDR97A6NE52 1622 aa10.06□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 ARAP1Q96P48 1450 aa10.05□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 NBR1Q14596 966 aa10.05□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 MAPKBP1O60336 1514 aa10.05□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.05□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.04□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.04□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 ERICH6BQ5W0A0 696 aa10.03□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
CSDE1-201ENST00000261443 PPP4R2Q9NY27 417 aa10.02□□□□□ -0.81
CSDE1-201ENST00000261443 SIN3AQ96ST3 1273 aa10.02□□□□□ -0.81
CSDE1-201ENST00000261443 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CSDE1-201ENST00000261443 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CSDE1-201ENST00000261443 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.97□□□□□ -0.81
CSDE1-201ENST00000261443 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CSDE1-201ENST00000261443 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.96□□□□□ -0.81
CSDE1-201ENST00000261443 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.96□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.95□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.95□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.95□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.94□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 IL27Q8NEV9 243 aa9.93□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 KIF27Q86VH2 1401 aa9.92□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 IGF1RP08069 1367 aa9.91□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.91□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.9□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CSDE1-201ENST00000261443 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CSDE1-201ENST00000261443 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CSDE1-201ENST00000261443 TONSLQ96HA7 1378 aa9.87□□□□□ -0.83
CSDE1-201ENST00000261443 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.86□□□□□ -0.83
CSDE1-201ENST00000261443 NESP48681 1621 aa9.86□□□□□ -0.83
CSDE1-201ENST00000261443 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.83□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.83□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.83□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC184Q52MB2 194 aa9.82□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 TIAM1Q13009 1591 aa9.82□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.82□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.82□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.82□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.81□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 TOPBP1Q92547 1522 aa9.8□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 NEFMP07197 916 aa9.8□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.8□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.79□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 MAP3K1Q13233 1512 aa9.79□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.79□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.79□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.79□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 MRS2Q9HD23 443 aa9.79□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.79□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 USP35Q9P2H5 1018 aa9.78□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CSDE1-201ENST00000261443 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.76□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.75□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.75□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.75□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 AKNAQ7Z591 1439 aa9.75□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 NCOA2Q15596 1464 aa9.73□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.73□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.72□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 CUL7Q14999 1698 aa9.72□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.72□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 UACAQ9BZF9 1416 aa9.71□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.71□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.71□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 NUDCQ9Y266 331 aa9.71□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.71□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.7□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.7□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 SAMD9Q5K651 1589 aa9.7□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 GSE1Q14687 1217 aa9.69□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms