RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253968.10

BARX1-201, Transcript of BARX homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BARX1, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1-201ENST00000253968 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.52■■■■■ 4.4
BARX1-201ENST00000253968 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.52■■■■■ 4.4
BARX1-201ENST00000253968 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
BARX1-201ENST00000253968 IQGAP2Q13576 1575 aa42.43■■■■■ 4.38
BARX1-201ENST00000253968 SHROOM2Q13796 1616 aa42.32■■■■■ 4.37
BARX1-201ENST00000253968 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.32■■■■■ 4.37
BARX1-201ENST00000253968 JPH4Q96JJ6 628 aa42.28■■■■■ 4.36
BARX1-201ENST00000253968 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.23■■■■■ 4.35
BARX1-201ENST00000253968 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.21■■■■■ 4.35
BARX1-201ENST00000253968 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
BARX1-201ENST00000253968 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.08■■■■■ 4.33
BARX1-201ENST00000253968 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
BARX1-201ENST00000253968 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.08■■■■■ 4.33
BARX1-201ENST00000253968 ARHGEF11O15085 1522 aa42.07■■■■■ 4.33
BARX1-201ENST00000253968 DISP1Q96F81 1524 aa42.06■■■■■ 4.32
BARX1-201ENST00000253968 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.03■■■■■ 4.32
BARX1-201ENST00000253968 KIAA0556O60303 1618 aa42.02■■■■■ 4.32
BARX1-201ENST00000253968 SAMD9Q5K651 1589 aa42.01■■■■■ 4.32
BARX1-201ENST00000253968 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42■■■■■ 4.31
BARX1-201ENST00000253968 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42■■■■■ 4.31
BARX1-201ENST00000253968 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42■■■■■ 4.31
BARX1-201ENST00000253968 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.97■■■■■ 4.31
BARX1-201ENST00000253968 CEP162Q5TB80 1403 aa41.91■■■■■ 4.3
BARX1-201ENST00000253968 CLIP1P30622 1438 aa41.89■■■■■ 4.3
BARX1-201ENST00000253968 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.88■■■■■ 4.29
BARX1-201ENST00000253968 P3H3Q8IVL6 736 aa41.86■■■■■ 4.29
BARX1-201ENST00000253968 ARAP1Q96P48 1450 aa41.8■■■■■ 4.28
BARX1-201ENST00000253968 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.79■■■■■ 4.28
BARX1-201ENST00000253968 PTPRGP23470 1445 aa41.74■■■■■ 4.27
BARX1-201ENST00000253968 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
BARX1-201ENST00000253968 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.62■■■■■ 4.25
BARX1-201ENST00000253968 FMN1Q68DA7 1419 aa41.55■■■■■ 4.24
BARX1-201ENST00000253968 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.52■■■■■ 4.24
BARX1-201ENST00000253968 ABCA8O94911 1581 aa41.5■■■■■ 4.23
BARX1-201ENST00000253968 UACAQ9BZF9 1416 aa41.49■■■■■ 4.23
BARX1-201ENST00000253968 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.45■■■■■ 4.23
BARX1-201ENST00000253968 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.43■■■■■ 4.22
BARX1-201ENST00000253968 ABCC2Q92887 1545 aa41.43■■■■■ 4.22
BARX1-201ENST00000253968 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.42■■■■■ 4.22
BARX1-201ENST00000253968 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
BARX1-201ENST00000253968 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.35■■■■■ 4.21
BARX1-201ENST00000253968 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.32■■■■■ 4.21
BARX1-201ENST00000253968 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
BARX1-201ENST00000253968 HECW1Q76N89 1606 aa41.29■■■■■ 4.2
BARX1-201ENST00000253968 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.28■■■■■ 4.2
BARX1-201ENST00000253968 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
BARX1-201ENST00000253968 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.22■■■■■ 4.19
BARX1-201ENST00000253968 ARID3CA6NKF2 412 aa41.18■■■■■ 4.18
BARX1-201ENST00000253968 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
BARX1-201ENST00000253968 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.15■■■■■ 4.18
BARX1-201ENST00000253968 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.15■■■■■ 4.18
BARX1-201ENST00000253968 ATP10BO94823 1461 aa41.14■■■■■ 4.18
BARX1-201ENST00000253968 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
BARX1-201ENST00000253968 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
BARX1-201ENST00000253968 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.08■■■■■ 4.17
BARX1-201ENST00000253968 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
BARX1-201ENST00000253968 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
BARX1-201ENST00000253968 MAPKBP1O60336 1514 aa41■■■■■ 4.15
BARX1-201ENST00000253968 ASXL2Q76L83 1435 aa40.94■■■■■ 4.14
BARX1-201ENST00000253968 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.93■■■■■ 4.14
BARX1-201ENST00000253968 TIAM1Q13009 1591 aa40.9■■■■■ 4.14
BARX1-201ENST00000253968 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.88■■■■■ 4.13
BARX1-201ENST00000253968 MAP3K1Q13233 1512 aa40.87■■■■■ 4.13
BARX1-201ENST00000253968 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
BARX1-201ENST00000253968 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.84■■■■■ 4.13
BARX1-201ENST00000253968 APLP2Q06481 763 aa40.83■■■■■ 4.13
BARX1-201ENST00000253968 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.81■■■■■ 4.12
BARX1-201ENST00000253968 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
BARX1-201ENST00000253968 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.72■■■■■ 4.11
BARX1-201ENST00000253968 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.7■■■■■ 4.11
BARX1-201ENST00000253968 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.7■■■■■ 4.11
BARX1-201ENST00000253968 KCNH8Q96L42 1107 aa40.7■■■■■ 4.11
BARX1-201ENST00000253968 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.69■■■■■ 4.1
BARX1-201ENST00000253968 DIP2BQ9P265 1576 aa40.68■■■■■ 4.1
BARX1-201ENST00000253968 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
BARX1-201ENST00000253968 KIF14Q15058 1648 aa40.63■■■■■ 4.1
BARX1-201ENST00000253968 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.6■■■■■ 4.09
BARX1-201ENST00000253968 GLI2P10070 1586 aa40.59■■■■■ 4.09
BARX1-201ENST00000253968 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.57■■■■■ 4.08
BARX1-201ENST00000253968 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.54■■■■■ 4.08
BARX1-201ENST00000253968 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.54■■■■■ 4.08
BARX1-201ENST00000253968 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
BARX1-201ENST00000253968 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.51■■■■■ 4.08
BARX1-201ENST00000253968 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
BARX1-201ENST00000253968 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.46■■■■■ 4.07
BARX1-201ENST00000253968 NCOA2Q15596 1464 aa40.46■■■■■ 4.07
BARX1-201ENST00000253968 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
BARX1-201ENST00000253968 CD109Q6YHK3 1445 aa40.4■■■■■ 4.06
BARX1-201ENST00000253968 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.36■■■■■ 4.05
BARX1-201ENST00000253968 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.34■■■■■ 4.05
BARX1-201ENST00000253968 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.33■■■■■ 4.05
BARX1-201ENST00000253968 TSPOAP1O95153 1857 aa40.32■■■■■ 4.05
BARX1-201ENST00000253968 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
BARX1-201ENST00000253968 PREX2Q70Z35 1606 aa40.3■■■■■ 4.04
BARX1-201ENST00000253968 PLCH2O75038 1416 aa40.29■■■■■ 4.04
BARX1-201ENST00000253968 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
BARX1-201ENST00000253968 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.27■■■■■ 4.04
BARX1-201ENST00000253968 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.25■■■■■ 4.03
BARX1-201ENST00000253968 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.25■■■■■ 4.03
BARX1-201ENST00000253968 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.24■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms