RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253413.9

ATP6V1E1-201, Transcript of ATPase H+ transporting V1 subunit E1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP6V1E1, Length 1,402 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.75■■■□□ 2.03
ATP6V1E1-201ENST00000253413 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.72■■■□□ 2.03
ATP6V1E1-201ENST00000253413 SHROOM2Q13796 1616 aa27.68■■■□□ 2.02
ATP6V1E1-201ENST00000253413 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
ATP6V1E1-201ENST00000253413 JPH4Q96JJ6 628 aa27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ARAP1Q96P48 1450 aa27.6■■■□□ 2.01
ATP6V1E1-201ENST00000253413 IQGAP2Q13576 1575 aa27.57■■■□□ 2
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.56■■■□□ 2
ATP6V1E1-201ENST00000253413 KIF21BO75037 1637 aa27.53■■■□□ 2
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.5■■□□□ 1.99
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.48■■□□□ 1.99
ATP6V1E1-201ENST00000253413 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.44■■□□□ 1.98
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.42■■□□□ 1.98
ATP6V1E1-201ENST00000253413 GOLGA3Q08378 1498 aa27.39■■□□□ 1.98
ATP6V1E1-201ENST00000253413 DISP1Q96F81 1524 aa27.36■■□□□ 1.97
ATP6V1E1-201ENST00000253413 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.33■■□□□ 1.97
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.32■■□□□ 1.96
ATP6V1E1-201ENST00000253413 KIAA0556O60303 1618 aa27.32■■□□□ 1.96
ATP6V1E1-201ENST00000253413 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PTPRGP23470 1445 aa27.27■■□□□ 1.96
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
ATP6V1E1-201ENST00000253413 SAMD9Q5K651 1589 aa27.18■■□□□ 1.94
ATP6V1E1-201ENST00000253413 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
ATP6V1E1-201ENST00000253413 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.13■■□□□ 1.93
ATP6V1E1-201ENST00000253413 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.12■■□□□ 1.93
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.12■■□□□ 1.93
ATP6V1E1-201ENST00000253413 UACAQ9BZF9 1416 aa27.11■■□□□ 1.93
ATP6V1E1-201ENST00000253413 P3H3Q8IVL6 736 aa27.09■■□□□ 1.93
ATP6V1E1-201ENST00000253413 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.08■■□□□ 1.93
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ABCC2Q92887 1545 aa27.06■■□□□ 1.92
ATP6V1E1-201ENST00000253413 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
ATP6V1E1-201ENST00000253413 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.03■■□□□ 1.92
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.02■■□□□ 1.92
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ABCA8O94911 1581 aa27■■□□□ 1.91
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.99■■□□□ 1.91
ATP6V1E1-201ENST00000253413 MAPKBP1O60336 1514 aa26.95■■□□□ 1.9
ATP6V1E1-201ENST00000253413 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.94■■□□□ 1.9
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CLIP1P30622 1438 aa26.9■■□□□ 1.9
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
ATP6V1E1-201ENST00000253413 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.88■■□□□ 1.89
ATP6V1E1-201ENST00000253413 FMN1Q68DA7 1419 aa26.87■■□□□ 1.89
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CEP162Q5TB80 1403 aa26.82■■□□□ 1.88
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ASXL2Q76L83 1435 aa26.82■■□□□ 1.88
ATP6V1E1-201ENST00000253413 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.79■■□□□ 1.88
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ATP10BO94823 1461 aa26.77■■□□□ 1.88
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ARID3CA6NKF2 412 aa26.75■■□□□ 1.87
ATP6V1E1-201ENST00000253413 DIP2BQ9P265 1576 aa26.74■■□□□ 1.87
ATP6V1E1-201ENST00000253413 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.72■■□□□ 1.87
ATP6V1E1-201ENST00000253413 HECW1Q76N89 1606 aa26.71■■□□□ 1.87
ATP6V1E1-201ENST00000253413 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.71■■□□□ 1.87
ATP6V1E1-201ENST00000253413 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.67■■□□□ 1.86
ATP6V1E1-201ENST00000253413 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.67■■□□□ 1.86
ATP6V1E1-201ENST00000253413 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
ATP6V1E1-201ENST00000253413 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ATP6V1E1-201ENST00000253413 GLI2P10070 1586 aa26.65■■□□□ 1.86
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
ATP6V1E1-201ENST00000253413 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.63■■□□□ 1.85
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
ATP6V1E1-201ENST00000253413 KCNH8Q96L42 1107 aa26.56■■□□□ 1.84
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.56■■□□□ 1.84
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.56■■□□□ 1.84
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
ATP6V1E1-201ENST00000253413 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.5■■□□□ 1.83
ATP6V1E1-201ENST00000253413 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.49■■□□□ 1.83
ATP6V1E1-201ENST00000253413 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.49■■□□□ 1.83
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.46■■□□□ 1.83
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CD109Q6YHK3 1445 aa26.44■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.44■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.41■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TSPOAP1O95153 1857 aa26.4■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.4■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.812e-11■□□□□ 11.1
ATP6V1E1-201ENST00000253413 KIF14Q15058 1648 aa26.35■■□□□ 1.81
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.34■■□□□ 1.81
ATP6V1E1-201ENST00000253413 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.28■■□□□ 1.8
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TIAM1Q13009 1591 aa26.28■■□□□ 1.8
ATP6V1E1-201ENST00000253413 KDM6BO15054 1643 aa26.27■■□□□ 1.8
ATP6V1E1-201ENST00000253413 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.26■■□□□ 1.79
ATP6V1E1-201ENST00000253413 MAP3K1Q13233 1512 aa26.24■■□□□ 1.79
ATP6V1E1-201ENST00000253413 NEO1Q92859 1461 aa26.23■■□□□ 1.79
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PLCH2O75038 1416 aa26.23■■□□□ 1.79
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.23■■□□□ 1.79
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.2■■□□□ 1.79
ATP6V1E1-201ENST00000253413 FANCAO15360 1455 aa26.2■■□□□ 1.78
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.19■■□□□ 1.78
ATP6V1E1-201ENST00000253413 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1E1-201ENST00000253413 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
ATP6V1E1-201ENST00000253413 APLP2Q06481 763 aa26.17■■□□□ 1.78
ATP6V1E1-201ENST00000253413 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.16■■□□□ 1.78
ATP6V1E1-201ENST00000253413 AKNAQ7Z591 1439 aa26.14■■□□□ 1.77
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.13■■□□□ 1.77
ATP6V1E1-201ENST00000253413 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.13■■□□□ 1.77
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PREX2Q70Z35 1606 aa26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms