RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253413.9

ATP6V1E1-201, Transcript of ATPase H+ transporting V1 subunit E1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP6V1E1, Length 1,402 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.75■■■□□ 2.03
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ATP6V1E1-201ENST00000253413 ARAP1Q96P48 1450 aa27.6■■■□□ 2.01
ATP6V1E1-201ENST00000253413 IQGAP2Q13576 1575 aa27.57■■■□□ 2
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
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ATP6V1E1-201ENST00000253413 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.42■■□□□ 1.98
ATP6V1E1-201ENST00000253413 GOLGA3Q08378 1498 aa27.39■■□□□ 1.98
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ATP6V1E1-201ENST00000253413 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.12■■□□□ 1.93
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ATP6V1E1-201ENST00000253413 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.72■■□□□ 1.87
ATP6V1E1-201ENST00000253413 HECW1Q76N89 1606 aa26.71■■□□□ 1.87
ATP6V1E1-201ENST00000253413 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.71■■□□□ 1.87
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ATP6V1E1-201ENST00000253413 GLI2P10070 1586 aa26.65■■□□□ 1.86
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ATP6V1E1-201ENST00000253413 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.63■■□□□ 1.85
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ATP6V1E1-201ENST00000253413 KCNH8Q96L42 1107 aa26.56■■□□□ 1.84
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.56■■□□□ 1.84
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.56■■□□□ 1.84
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
ATP6V1E1-201ENST00000253413 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.5■■□□□ 1.83
ATP6V1E1-201ENST00000253413 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.49■■□□□ 1.83
ATP6V1E1-201ENST00000253413 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.49■■□□□ 1.83
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.46■■□□□ 1.83
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CD109Q6YHK3 1445 aa26.44■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.44■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.41■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TSPOAP1O95153 1857 aa26.4■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.4■■□□□ 1.82
ATP6V1E1-201ENST00000253413 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.812e-11■□□□□ 11.1
ATP6V1E1-201ENST00000253413 KIF14Q15058 1648 aa26.35■■□□□ 1.81
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.34■■□□□ 1.81
ATP6V1E1-201ENST00000253413 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.28■■□□□ 1.8
ATP6V1E1-201ENST00000253413 TIAM1Q13009 1591 aa26.28■■□□□ 1.8
ATP6V1E1-201ENST00000253413 KDM6BO15054 1643 aa26.27■■□□□ 1.8
ATP6V1E1-201ENST00000253413 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.26■■□□□ 1.79
ATP6V1E1-201ENST00000253413 MAP3K1Q13233 1512 aa26.24■■□□□ 1.79
ATP6V1E1-201ENST00000253413 NEO1Q92859 1461 aa26.23■■□□□ 1.79
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PLCH2O75038 1416 aa26.23■■□□□ 1.79
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.23■■□□□ 1.79
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.2■■□□□ 1.79
ATP6V1E1-201ENST00000253413 FANCAO15360 1455 aa26.2■■□□□ 1.78
ATP6V1E1-201ENST00000253413 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.19■■□□□ 1.78
ATP6V1E1-201ENST00000253413 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1E1-201ENST00000253413 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
ATP6V1E1-201ENST00000253413 APLP2Q06481 763 aa26.17■■□□□ 1.78
ATP6V1E1-201ENST00000253413 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.16■■□□□ 1.78
ATP6V1E1-201ENST00000253413 AKNAQ7Z591 1439 aa26.14■■□□□ 1.77
ATP6V1E1-201ENST00000253413 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.13■■□□□ 1.77
ATP6V1E1-201ENST00000253413 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.13■■□□□ 1.77
ATP6V1E1-201ENST00000253413 PREX2Q70Z35 1606 aa26.12■■□□□ 1.77
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