RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249923.7

COPB1-201, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPB1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1-201ENST00000249923 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
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COPB1-201ENST00000249923 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.93□□□□□ -0.02
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COPB1-201ENST00000249923 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.063e-9■■□□□ 11.4
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COPB1-201ENST00000249923 ARHGEF11O15085 1522 aa14.6□□□□□ -0.07
COPB1-201ENST00000249923 PBRM1Q86U86 1689 aa14.59□□□□□ -0.07
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COPB1-201ENST00000249923 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.47□□□□□ -0.09
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COPB1-201ENST00000249923 CCER2I3L3R5 266 aa14.31□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 TRIM52Q96A61 297 aa14.31□□□□□ -0.12
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COPB1-201ENST00000249923 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.29□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 CEP170Q5SW79 1584 aa14.29□□□□□ -0.12
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