RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.75□□□□□ -1.01
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TMOD2-201ENST00000249700 TRIM52Q96A61 297 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD2-201ENST00000249700 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.73□□□□□ -1.01
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TMOD2-201ENST00000249700 MIER1Q8N108 512 aa8.72□□□□□ -1.01
TMOD2-201ENST00000249700 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.72□□□□□ -1.01
TMOD2-201ENST00000249700 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
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TMOD2-201ENST00000249700 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.66□□□□□ -1.02
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TMOD2-201ENST00000249700 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.61□□□□□ -1.03
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TMOD2-201ENST00000249700 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.59□□□□□ -1.03
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TMOD2-201ENST00000249700 KCNH8Q96L42 1107 aa8.54□□□□□ -1.04
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TMOD2-201ENST00000249700 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD2-201ENST00000249700 NAIPQ13075 1403 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD2-201ENST00000249700 HFM1A2PYH4 1435 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD2-201ENST00000249700 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
TMOD2-201ENST00000249700 GRIN2AQ12879 1464 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD2-201ENST00000249700 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
TMOD2-201ENST00000249700 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD2-201ENST00000249700 UACAQ9BZF9 1416 aa8.37□□□□□ -1.07
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