RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000231357.6

IRX4-201, Transcript of iroquois homeobox 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IRX4, Length 2,221 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4-201ENST00000231357 TOPBP1Q92547 1522 aa31.7■■■□□ 2.67
IRX4-201ENST00000231357 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.7■■■□□ 2.67
IRX4-201ENST00000231357 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
IRX4-201ENST00000231357 ITGAEP38570 1179 aa31.69■■■□□ 2.66
IRX4-201ENST00000231357 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
IRX4-201ENST00000231357 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.65■■■□□ 2.66
IRX4-201ENST00000231357 NESP48681 1621 aa31.64■■■□□ 2.66
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IRX4-201ENST00000231357 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.55■■■□□ 2.64
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IRX4-201ENST00000231357 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.47■■■□□ 2.63
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IRX4-201ENST00000231357 FMN1Q68DA7 1419 aa31.34■■■□□ 2.61
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IRX4-201ENST00000231357 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.29■■■□□ 2.6
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IRX4-201ENST00000231357 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.15■■■□□ 2.58
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IRX4-201ENST00000231357 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
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IRX4-201ENST00000231357 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.64■■■□□ 2.5
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IRX4-201ENST00000231357 ROCK1Q13464 1354 aa30.39■■■□□ 2.46
IRX4-201ENST00000231357 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
IRX4-201ENST00000231357 ABCC5O15440 1437 aa30.36■■■□□ 2.45
IRX4-201ENST00000231357 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
IRX4-201ENST00000231357 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
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IRX4-201ENST00000231357 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
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