RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219473.11

USP10-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP10, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-201ENST00000219473 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
USP10-201ENST00000219473 TIAM1Q13009 1591 aa22.04■■□□□ 1.12
USP10-201ENST00000219473 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.03■■□□□ 1.12
USP10-201ENST00000219473 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.99■■□□□ 1.11
USP10-201ENST00000219473 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
USP10-201ENST00000219473 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.99■■□□□ 1.11
USP10-201ENST00000219473 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.99■■□□□ 1.11
USP10-201ENST00000219473 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.98■■□□□ 1.11
USP10-201ENST00000219473 CUL7Q14999 1698 aa21.96■■□□□ 1.11
USP10-201ENST00000219473 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
USP10-201ENST00000219473 WDR97A6NE52 1622 aa21.91■■□□□ 1.1
USP10-201ENST00000219473 MAP3K1Q13233 1512 aa21.9■■□□□ 1.1
USP10-201ENST00000219473 NEUROD1Q13562 356 aa21.89■■□□□ 1.1
USP10-201ENST00000219473 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.89■■□□□ 1.09
USP10-201ENST00000219473 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.89■■□□□ 1.09
USP10-201ENST00000219473 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
USP10-201ENST00000219473 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.88■■□□□ 1.09
USP10-201ENST00000219473 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.87■■□□□ 1.09
USP10-201ENST00000219473 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.87■■□□□ 1.09
USP10-201ENST00000219473 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.099e-7■■■■■ 27.8
USP10-201ENST00000219473 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.85■■□□□ 1.09
USP10-201ENST00000219473 MIER1Q8N108 512 aa21.85■■□□□ 1.09
USP10-201ENST00000219473 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.84■■□□□ 1.09
USP10-201ENST00000219473 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
USP10-201ENST00000219473 FMN1Q68DA7 1419 aa21.83■■□□□ 1.08
USP10-201ENST00000219473 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.82■■□□□ 1.08
USP10-201ENST00000219473 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.81■■□□□ 1.08
USP10-201ENST00000219473 ARID3CA6NKF2 412 aa21.8■■□□□ 1.08
USP10-201ENST00000219473 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
USP10-201ENST00000219473 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
USP10-201ENST00000219473 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.78■■□□□ 1.08
USP10-201ENST00000219473 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.74■■□□□ 1.07
USP10-201ENST00000219473 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.73■■□□□ 1.07
USP10-201ENST00000219473 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.72■■□□□ 1.07
USP10-201ENST00000219473 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
USP10-201ENST00000219473 SAMD9Q5K651 1589 aa21.68■■□□□ 1.06
USP10-201ENST00000219473 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.66■■□□□ 1.06
USP10-201ENST00000219473 PBRM1Q86U86 1689 aa21.66■■□□□ 1.06
USP10-201ENST00000219473 MAPKBP1O60336 1514 aa21.66■■□□□ 1.06
USP10-201ENST00000219473 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.65■■□□□ 1.06
USP10-201ENST00000219473 GRIN2BQ13224 1484 aa21.63■■□□□ 1.05
USP10-201ENST00000219473 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.62■■□□□ 1.05
USP10-201ENST00000219473 NCOA2Q15596 1464 aa21.61■■□□□ 1.05
USP10-201ENST00000219473 ERCC6Q03468 1493 aa21.6■■□□□ 1.05
USP10-201ENST00000219473 ADAMTS12P58397 1594 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-201ENST00000219473 FBLN2P98095 1184 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-201ENST00000219473 IQGAP2Q13576 1575 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-201ENST00000219473 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.58■■□□□ 1.04
USP10-201ENST00000219473 PTPRKQ15262 1439 aa21.56■■□□□ 1.04
USP10-201ENST00000219473 IFT140Q96RY7 1462 aa21.55■■□□□ 1.04
USP10-201ENST00000219473 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.54■■□□□ 1.04
USP10-201ENST00000219473 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
USP10-201ENST00000219473 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.53■■□□□ 1.04
USP10-201ENST00000219473 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.52■■□□□ 1.04
USP10-201ENST00000219473 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
USP10-201ENST00000219473 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
USP10-201ENST00000219473 WDR62O43379 1518 aa21.49■■□□□ 1.03
USP10-201ENST00000219473 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.49■■□□□ 1.03
USP10-201ENST00000219473 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
USP10-201ENST00000219473 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
USP10-201ENST00000219473 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.48■■□□□ 1.03
USP10-201ENST00000219473 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USP10-201ENST00000219473 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
USP10-201ENST00000219473 HECW1Q76N89 1606 aa21.45■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.43■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 HFM1A2PYH4 1435 aa21.42■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.42■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 TRIM52Q96A61 297 aa21.42■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 NAIPQ13075 1403 aa21.41■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 GRIN2AQ12879 1464 aa21.4■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.4■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
USP10-201ENST00000219473 TONSLQ96HA7 1378 aa21.38■■□□□ 1.01
USP10-201ENST00000219473 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
USP10-201ENST00000219473 DISP1Q96F81 1524 aa21.37■■□□□ 1.01
USP10-201ENST00000219473 UACAQ9BZF9 1416 aa21.36■■□□□ 1.01
USP10-201ENST00000219473 ARHGEF11O15085 1522 aa21.34■■□□□ 1.01
USP10-201ENST00000219473 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
USP10-201ENST00000219473 KIAA0556O60303 1618 aa21.33■■□□□ 1.01
USP10-201ENST00000219473 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.31■■□□□ 1
USP10-201ENST00000219473 KCNH8Q96L42 1107 aa21.3■■□□□ 1
USP10-201ENST00000219473 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
USP10-201ENST00000219473 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
USP10-201ENST00000219473 FOXD1Q16676 465 aa21.28■■□□□ 1
USP10-201ENST00000219473 JPH4Q96JJ6 628 aa21.28■■□□□ 1
USP10-201ENST00000219473 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
USP10-201ENST00000219473 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
USP10-201ENST00000219473 SYNJ2O15056 1496 aa21.26■□□□□ 0.99
USP10-201ENST00000219473 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.26■□□□□ 0.99
USP10-201ENST00000219473 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
USP10-201ENST00000219473 CEP170Q5SW79 1584 aa21.25■□□□□ 0.99
USP10-201ENST00000219473 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
USP10-201ENST00000219473 MIA2Q96PC5 1412 aa21.24■□□□□ 0.99
USP10-201ENST00000219473 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.23■□□□□ 0.99
USP10-201ENST00000219473 KDM6BO15054 1643 aa21.22■□□□□ 0.99
USP10-201ENST00000219473 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.2■□□□□ 0.98
USP10-201ENST00000219473 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
USP10-201ENST00000219473 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.17■□□□□ 0.98
USP10-201ENST00000219473 DAPK1P53355 1430 aa21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms