RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215882.9

SLC25A1-201, Transcript of solute carrier family 25 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A1, Length 1,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1-201ENST00000215882 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.33■■■■□ 3.57
SLC25A1-201ENST00000215882 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.3■■■■□ 3.56
SLC25A1-201ENST00000215882 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
SLC25A1-201ENST00000215882 IQGAP2Q13576 1575 aa37.22■■■■□ 3.55
SLC25A1-201ENST00000215882 SHROOM2Q13796 1616 aa37.16■■■■□ 3.54
SLC25A1-201ENST00000215882 JPH4Q96JJ6 628 aa37.15■■■■□ 3.54
SLC25A1-201ENST00000215882 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.09■■■■□ 3.53
SLC25A1-201ENST00000215882 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.08■■■■□ 3.53
SLC25A1-201ENST00000215882 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.03■■■■□ 3.52
SLC25A1-201ENST00000215882 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.02■■■■□ 3.52
SLC25A1-201ENST00000215882 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
SLC25A1-201ENST00000215882 ARHGEF11O15085 1522 aa36.97■■■■□ 3.51
SLC25A1-201ENST00000215882 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.94■■■■□ 3.5
SLC25A1-201ENST00000215882 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
SLC25A1-201ENST00000215882 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.91■■■■□ 3.5
SLC25A1-201ENST00000215882 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.91■■■■□ 3.5
SLC25A1-201ENST00000215882 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.91■■■■□ 3.5
SLC25A1-201ENST00000215882 DISP1Q96F81 1524 aa36.91■■■■□ 3.5
SLC25A1-201ENST00000215882 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.91■■■■□ 3.5
SLC25A1-201ENST00000215882 KIAA0556O60303 1618 aa36.85■■■■□ 3.49
SLC25A1-201ENST00000215882 SAMD9Q5K651 1589 aa36.83■■■■□ 3.49
SLC25A1-201ENST00000215882 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.79■■■■□ 3.48
SLC25A1-201ENST00000215882 P3H3Q8IVL6 736 aa36.74■■■■□ 3.47
SLC25A1-201ENST00000215882 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.71■■■■□ 3.47
SLC25A1-201ENST00000215882 CLIP1P30622 1438 aa36.71■■■■□ 3.47
SLC25A1-201ENST00000215882 CEP162Q5TB80 1403 aa36.71■■■■□ 3.47
SLC25A1-201ENST00000215882 ARAP1Q96P48 1450 aa36.71■■■■□ 3.47
SLC25A1-201ENST00000215882 PTPRGP23470 1445 aa36.66■■■■□ 3.46
SLC25A1-201ENST00000215882 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
SLC25A1-201ENST00000215882 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.63■■■■□ 3.45
SLC25A1-201ENST00000215882 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.61■■■■□ 3.45
SLC25A1-201ENST00000215882 FMN1Q68DA7 1419 aa36.45■■■■□ 3.43
SLC25A1-201ENST00000215882 UACAQ9BZF9 1416 aa36.44■■■■□ 3.42
SLC25A1-201ENST00000215882 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.43■■■■□ 3.42
SLC25A1-201ENST00000215882 ABCA8O94911 1581 aa36.41■■■■□ 3.42
SLC25A1-201ENST00000215882 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.36■■■■□ 3.41
SLC25A1-201ENST00000215882 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.36■■■■□ 3.41
SLC25A1-201ENST00000215882 ABCC2Q92887 1545 aa36.36■■■■□ 3.41
SLC25A1-201ENST00000215882 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.35■■■■□ 3.41
SLC25A1-201ENST00000215882 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
SLC25A1-201ENST00000215882 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.23■■■■□ 3.39
SLC25A1-201ENST00000215882 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.22■■■■□ 3.39
SLC25A1-201ENST00000215882 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
SLC25A1-201ENST00000215882 HECW1Q76N89 1606 aa36.2■■■■□ 3.39
SLC25A1-201ENST00000215882 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.19■■■■□ 3.38
SLC25A1-201ENST00000215882 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
SLC25A1-201ENST00000215882 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.19■■■■□ 3.38
SLC25A1-201ENST00000215882 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.18■■■■□ 3.38
SLC25A1-201ENST00000215882 ARID3CA6NKF2 412 aa36.13■■■■□ 3.37
SLC25A1-201ENST00000215882 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
SLC25A1-201ENST00000215882 ATP10BO94823 1461 aa36.12■■■■□ 3.37
SLC25A1-201ENST00000215882 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.09■■■■□ 3.37
SLC25A1-201ENST00000215882 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
SLC25A1-201ENST00000215882 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
SLC25A1-201ENST00000215882 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
SLC25A1-201ENST00000215882 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
SLC25A1-201ENST00000215882 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.02■■■■□ 3.36
SLC25A1-201ENST00000215882 MAPKBP1O60336 1514 aa36.01■■■■□ 3.35
SLC25A1-201ENST00000215882 ASXL2Q76L83 1435 aa35.94■■■■□ 3.34
SLC25A1-201ENST00000215882 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
SLC25A1-201ENST00000215882 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.88■■■■□ 3.33
SLC25A1-201ENST00000215882 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.87■■■■□ 3.33
SLC25A1-201ENST00000215882 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.85■■■■□ 3.33
SLC25A1-201ENST00000215882 TIAM1Q13009 1591 aa35.84■■■■□ 3.33
SLC25A1-201ENST00000215882 APLP2Q06481 763 aa35.83■■■■□ 3.33
SLC25A1-201ENST00000215882 MAP3K1Q13233 1512 aa35.83■■■■□ 3.33
SLC25A1-201ENST00000215882 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.76■■■■□ 3.32
SLC25A1-201ENST00000215882 KCNH8Q96L42 1107 aa35.75■■■■□ 3.31
SLC25A1-201ENST00000215882 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
SLC25A1-201ENST00000215882 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.75■■■■□ 3.31
SLC25A1-201ENST00000215882 DIP2BQ9P265 1576 aa35.72■■■■□ 3.31
SLC25A1-201ENST00000215882 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.72■■■■□ 3.31
SLC25A1-201ENST00000215882 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.68■■■■□ 3.3
SLC25A1-201ENST00000215882 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.67■■■■□ 3.3
SLC25A1-201ENST00000215882 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.67■■■■□ 3.3
SLC25A1-201ENST00000215882 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.66■■■■□ 3.3
SLC25A1-201ENST00000215882 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
SLC25A1-201ENST00000215882 GLI2P10070 1586 aa35.65■■■■□ 3.3
SLC25A1-201ENST00000215882 KIF14Q15058 1648 aa35.64■■■■□ 3.3
SLC25A1-201ENST00000215882 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
SLC25A1-201ENST00000215882 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.58■■■■□ 3.29
SLC25A1-201ENST00000215882 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.57■■■■□ 3.294e-10■■□□□ 11.5
SLC25A1-201ENST00000215882 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
SLC25A1-201ENST00000215882 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.53■■■■□ 3.28
SLC25A1-201ENST00000215882 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.52■■■■□ 3.28
SLC25A1-201ENST00000215882 CD109Q6YHK3 1445 aa35.48■■■■□ 3.27
SLC25A1-201ENST00000215882 NCOA2Q15596 1464 aa35.46■■■■□ 3.27
SLC25A1-201ENST00000215882 TSPOAP1O95153 1857 aa35.44■■■■□ 3.26
SLC25A1-201ENST00000215882 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
SLC25A1-201ENST00000215882 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.42■■■■□ 3.26
SLC25A1-201ENST00000215882 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.38■■■■□ 3.25
SLC25A1-201ENST00000215882 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.38■■■■□ 3.25
SLC25A1-201ENST00000215882 PLCH2O75038 1416 aa35.37■■■■□ 3.25
SLC25A1-201ENST00000215882 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
SLC25A1-201ENST00000215882 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
SLC25A1-201ENST00000215882 PREX2Q70Z35 1606 aa35.34■■■■□ 3.25
SLC25A1-201ENST00000215882 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.33■■■■□ 3.25
SLC25A1-201ENST00000215882 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.33■■■■□ 3.25
SLC25A1-201ENST00000215882 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.32■■■■□ 3.24
SLC25A1-201ENST00000215882 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.3■■■■□ 3.24
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