RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
STRADB-201ENST00000194530 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.35■■■□□ 2.45
STRADB-201ENST00000194530 ITGAEP38570 1179 aa30.33■■■□□ 2.45
STRADB-201ENST00000194530 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
STRADB-201ENST00000194530 CUL7Q14999 1698 aa30.27■■■□□ 2.44
STRADB-201ENST00000194530 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.27■■■□□ 2.44
STRADB-201ENST00000194530 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.27■■■□□ 2.44
STRADB-201ENST00000194530 NESP48681 1621 aa30.26■■■□□ 2.44
STRADB-201ENST00000194530 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.26■■■□□ 2.43
STRADB-201ENST00000194530 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
STRADB-201ENST00000194530 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.24■■■□□ 2.43
STRADB-201ENST00000194530 P3H3Q8IVL6 736 aa30.23■■■□□ 2.43
STRADB-201ENST00000194530 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.21■■■□□ 2.43
STRADB-201ENST00000194530 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.2■■■□□ 2.42
STRADB-201ENST00000194530 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.19■■■□□ 2.42
STRADB-201ENST00000194530 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.19■■■□□ 2.42
STRADB-201ENST00000194530 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.18■■■□□ 2.42
STRADB-201ENST00000194530 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.17■■■□□ 2.42
STRADB-201ENST00000194530 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
STRADB-201ENST00000194530 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.14■■■□□ 2.42
STRADB-201ENST00000194530 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
STRADB-201ENST00000194530 MAPKBP1O60336 1514 aa30.11■■■□□ 2.41
STRADB-201ENST00000194530 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
STRADB-201ENST00000194530 WDR97A6NE52 1622 aa30.09■■■□□ 2.41
STRADB-201ENST00000194530 FMN1Q68DA7 1419 aa30.08■■■□□ 2.41
STRADB-201ENST00000194530 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.07■■■□□ 2.4
STRADB-201ENST00000194530 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.01■■■□□ 2.39
STRADB-201ENST00000194530 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30■■■□□ 2.39
STRADB-201ENST00000194530 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
STRADB-201ENST00000194530 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.97■■■□□ 2.39
STRADB-201ENST00000194530 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.94■■■□□ 2.38
STRADB-201ENST00000194530 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.93■■■□□ 2.38
STRADB-201ENST00000194530 SAMD9Q5K651 1589 aa29.92■■■□□ 2.38
STRADB-201ENST00000194530 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.89■■■□□ 2.37
STRADB-201ENST00000194530 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.87■■■□□ 2.37
STRADB-201ENST00000194530 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.84■■■□□ 2.37
STRADB-201ENST00000194530 GRIN2BQ13224 1484 aa29.8■■■□□ 2.36
STRADB-201ENST00000194530 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
STRADB-201ENST00000194530 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.77■■■□□ 2.36
STRADB-201ENST00000194530 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
STRADB-201ENST00000194530 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.73■■■□□ 2.35
STRADB-201ENST00000194530 NCOA2Q15596 1464 aa29.73■■■□□ 2.35
STRADB-201ENST00000194530 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.72■■■□□ 2.35
STRADB-201ENST00000194530 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.71■■■□□ 2.35
STRADB-201ENST00000194530 HFM1A2PYH4 1435 aa29.71■■■□□ 2.35
STRADB-201ENST00000194530 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
STRADB-201ENST00000194530 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.7■■■□□ 2.34
STRADB-201ENST00000194530 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
STRADB-201ENST00000194530 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.68■■■□□ 2.34
STRADB-201ENST00000194530 PTPRKQ15262 1439 aa29.67■■■□□ 2.34
STRADB-201ENST00000194530 UACAQ9BZF9 1416 aa29.65■■■□□ 2.34
STRADB-201ENST00000194530 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.63■■■□□ 2.33
STRADB-201ENST00000194530 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.6■■■□□ 2.33
STRADB-201ENST00000194530 PBRM1Q86U86 1689 aa29.6■■■□□ 2.33
STRADB-201ENST00000194530 NAIPQ13075 1403 aa29.59■■■□□ 2.33
STRADB-201ENST00000194530 ARHGEF11O15085 1522 aa29.59■■■□□ 2.33
STRADB-201ENST00000194530 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
STRADB-201ENST00000194530 TONSLQ96HA7 1378 aa29.56■■■□□ 2.32
STRADB-201ENST00000194530 IQGAP2Q13576 1575 aa29.55■■■□□ 2.32
STRADB-201ENST00000194530 HECW1Q76N89 1606 aa29.54■■■□□ 2.32
STRADB-201ENST00000194530 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.52■■■□□ 2.32
STRADB-201ENST00000194530 ADAMTS12P58397 1594 aa29.52■■■□□ 2.32
STRADB-201ENST00000194530 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.51■■■□□ 2.32
STRADB-201ENST00000194530 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
STRADB-201ENST00000194530 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
STRADB-201ENST00000194530 KCNH8Q96L42 1107 aa29.46■■■□□ 2.31
STRADB-201ENST00000194530 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
STRADB-201ENST00000194530 MIA2Q96PC5 1412 aa29.4■■■□□ 2.3
STRADB-201ENST00000194530 AKNAQ7Z591 1439 aa29.39■■■□□ 2.3
STRADB-201ENST00000194530 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
STRADB-201ENST00000194530 WDR62O43379 1518 aa29.38■■■□□ 2.29
STRADB-201ENST00000194530 IFT140Q96RY7 1462 aa29.37■■■□□ 2.29
STRADB-201ENST00000194530 CCER2I3L3R5 266 aa29.36■■■□□ 2.29
STRADB-201ENST00000194530 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.36■■■□□ 2.29
STRADB-201ENST00000194530 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.36■■■□□ 2.29
STRADB-201ENST00000194530 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
STRADB-201ENST00000194530 ANP32CO43423 234 aa29.34■■■□□ 2.29
STRADB-201ENST00000194530 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.33■■■□□ 2.29
STRADB-201ENST00000194530 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.29■■■□□ 2.28
STRADB-201ENST00000194530 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.28■■■□□ 2.28
STRADB-201ENST00000194530 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
STRADB-201ENST00000194530 TRIM52Q96A61 297 aa29.27■■■□□ 2.28
STRADB-201ENST00000194530 KIAA0556O60303 1618 aa29.22■■■□□ 2.27
STRADB-201ENST00000194530 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
STRADB-201ENST00000194530 DISP1Q96F81 1524 aa29.21■■■□□ 2.27
STRADB-201ENST00000194530 ARID3CA6NKF2 412 aa29.2■■■□□ 2.26
STRADB-201ENST00000194530 KDM6BO15054 1643 aa29.19■■■□□ 2.26
STRADB-201ENST00000194530 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.19■■■□□ 2.26
STRADB-201ENST00000194530 ROCK1Q13464 1354 aa29.18■■■□□ 2.26
STRADB-201ENST00000194530 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
STRADB-201ENST00000194530 GRIN2AQ12879 1464 aa29.15■■■□□ 2.26
STRADB-201ENST00000194530 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
STRADB-201ENST00000194530 DAPK1P53355 1430 aa29.14■■■□□ 2.26
STRADB-201ENST00000194530 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.12■■■□□ 2.25
STRADB-201ENST00000194530 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
STRADB-201ENST00000194530 ABCC5O15440 1437 aa29.09■■■□□ 2.25
STRADB-201ENST00000194530 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
STRADB-201ENST00000194530 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
STRADB-201ENST00000194530 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
STRADB-201ENST00000194530 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
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