RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000167588.3

KRT20-201, Transcript of keratin 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRT20, Length 1,737 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20-201ENST00000167588 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.18■■□□□ 1.14
KRT20-201ENST00000167588 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT20-201ENST00000167588 MIER1Q8N108 512 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT20-201ENST00000167588 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
KRT20-201ENST00000167588 WDR97A6NE52 1622 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT20-201ENST00000167588 TOPBP1Q92547 1522 aa22.12■■□□□ 1.13
KRT20-201ENST00000167588 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
KRT20-201ENST00000167588 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.1■■□□□ 1.13
KRT20-201ENST00000167588 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
KRT20-201ENST00000167588 MAPKBP1O60336 1514 aa22.08■■□□□ 1.13
KRT20-201ENST00000167588 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.05■■□□□ 1.12
KRT20-201ENST00000167588 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.04■■□□□ 1.12
KRT20-201ENST00000167588 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.02■■□□□ 1.12
KRT20-201ENST00000167588 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.02■■□□□ 1.12
KRT20-201ENST00000167588 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.01■■□□□ 1.11
KRT20-201ENST00000167588 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.01■■□□□ 1.11
KRT20-201ENST00000167588 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
KRT20-201ENST00000167588 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.99■■□□□ 1.11
KRT20-201ENST00000167588 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
KRT20-201ENST00000167588 SAMD9Q5K651 1589 aa21.96■■□□□ 1.11
KRT20-201ENST00000167588 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.94■■□□□ 1.1
KRT20-201ENST00000167588 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.94■■□□□ 1.1
KRT20-201ENST00000167588 NESP48681 1621 aa21.93■■□□□ 1.1
KRT20-201ENST00000167588 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
KRT20-201ENST00000167588 FMN1Q68DA7 1419 aa21.92■■□□□ 1.1
KRT20-201ENST00000167588 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.91■■□□□ 1.1
KRT20-201ENST00000167588 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
KRT20-201ENST00000167588 ITGAEP38570 1179 aa21.85■■□□□ 1.09
KRT20-201ENST00000167588 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.85■■□□□ 1.09
KRT20-201ENST00000167588 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.83■■□□□ 1.08
KRT20-201ENST00000167588 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.81■■□□□ 1.08
KRT20-201ENST00000167588 GRIN2BQ13224 1484 aa21.79■■□□□ 1.08
KRT20-201ENST00000167588 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.79■■□□□ 1.08
KRT20-201ENST00000167588 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.77■■□□□ 1.08
KRT20-201ENST00000167588 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
KRT20-201ENST00000167588 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
KRT20-201ENST00000167588 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.76■■□□□ 1.07
KRT20-201ENST00000167588 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
KRT20-201ENST00000167588 P3H3Q8IVL6 736 aa21.75■■□□□ 1.07
KRT20-201ENST00000167588 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.72■■□□□ 1.07
KRT20-201ENST00000167588 PBRM1Q86U86 1689 aa21.72■■□□□ 1.07
KRT20-201ENST00000167588 HFM1A2PYH4 1435 aa21.71■■□□□ 1.07
KRT20-201ENST00000167588 ARHGEF11O15085 1522 aa21.7■■□□□ 1.06
KRT20-201ENST00000167588 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.69■■□□□ 1.06
KRT20-201ENST00000167588 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.68■■□□□ 1.06
KRT20-201ENST00000167588 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.68■■□□□ 1.06
KRT20-201ENST00000167588 NCOA2Q15596 1464 aa21.68■■□□□ 1.06
KRT20-201ENST00000167588 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.67■■□□□ 1.06
KRT20-201ENST00000167588 HECW1Q76N89 1606 aa21.65■■□□□ 1.06
KRT20-201ENST00000167588 UACAQ9BZF9 1416 aa21.65■■□□□ 1.06
KRT20-201ENST00000167588 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
KRT20-201ENST00000167588 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
KRT20-201ENST00000167588 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT20-201ENST00000167588 ADAMTS12P58397 1594 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT20-201ENST00000167588 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
KRT20-201ENST00000167588 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.6■■□□□ 1.05
KRT20-201ENST00000167588 PTPRKQ15262 1439 aa21.6■■□□□ 1.05
KRT20-201ENST00000167588 IQGAP2Q13576 1575 aa21.59■■□□□ 1.05
KRT20-201ENST00000167588 NAIPQ13075 1403 aa21.59■■□□□ 1.05
KRT20-201ENST00000167588 AKNAQ7Z591 1439 aa21.57■■□□□ 1.04
KRT20-201ENST00000167588 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
KRT20-201ENST00000167588 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.57■■□□□ 1.04
KRT20-201ENST00000167588 WDR62O43379 1518 aa21.52■■□□□ 1.04
KRT20-201ENST00000167588 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
KRT20-201ENST00000167588 TONSLQ96HA7 1378 aa21.49■■□□□ 1.03
KRT20-201ENST00000167588 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.49■■□□□ 1.03
KRT20-201ENST00000167588 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
KRT20-201ENST00000167588 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.49■■□□□ 1.03
KRT20-201ENST00000167588 MIA2Q96PC5 1412 aa21.47■■□□□ 1.03
KRT20-201ENST00000167588 MYT1Q01538 1121 aa21.46■■□□□ 1.03
KRT20-201ENST00000167588 CCER2I3L3R5 266 aa21.44■■□□□ 1.02
KRT20-201ENST00000167588 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
KRT20-201ENST00000167588 KIAA0556O60303 1618 aa21.38■■□□□ 1.01
KRT20-201ENST00000167588 IFT140Q96RY7 1462 aa21.38■■□□□ 1.01
KRT20-201ENST00000167588 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
KRT20-201ENST00000167588 KCNH8Q96L42 1107 aa21.37■■□□□ 1.01
KRT20-201ENST00000167588 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
KRT20-201ENST00000167588 KDM6BO15054 1643 aa21.34■■□□□ 1.01
KRT20-201ENST00000167588 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
KRT20-201ENST00000167588 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.33■■□□□ 1
KRT20-201ENST00000167588 ANP32CO43423 234 aa21.32■■□□□ 1
KRT20-201ENST00000167588 ROCK1Q13464 1354 aa21.31■■□□□ 1
KRT20-201ENST00000167588 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.31■■□□□ 1
KRT20-201ENST00000167588 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.3■■□□□ 1
KRT20-201ENST00000167588 DISP1Q96F81 1524 aa21.3■■□□□ 1
KRT20-201ENST00000167588 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
KRT20-201ENST00000167588 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.24■□□□□ 0.99
KRT20-201ENST00000167588 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
KRT20-201ENST00000167588 DAPK1P53355 1430 aa21.24■□□□□ 0.99
KRT20-201ENST00000167588 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
KRT20-201ENST00000167588 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.23■□□□□ 0.99
KRT20-201ENST00000167588 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.23■□□□□ 0.99
KRT20-201ENST00000167588 GRIN2AQ12879 1464 aa21.23■□□□□ 0.99
KRT20-201ENST00000167588 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
KRT20-201ENST00000167588 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.21■□□□□ 0.99
KRT20-201ENST00000167588 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
KRT20-201ENST00000167588 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.18■□□□□ 0.98
KRT20-201ENST00000167588 ABCC5O15440 1437 aa21.18■□□□□ 0.98
KRT20-201ENST00000167588 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
KRT20-201ENST00000167588 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms