RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 FXYD2P54710 66 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 C15orf53Q8NAA6 179 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 hADV29S1A0JD25 119 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 LINC01006Q8NI28 216 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZUT4 128 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 PLA2G2AP14555 144 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 IGLV1-40P01703 118 aa12.75□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa12.75□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 LINC01620Q4KN68 170 aa12.75□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.75□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 UBE2AP49459 152 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 TTTY13Q9BZ97 58 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 GDF5OSQ5U4N7 250 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 C10orf99Q6UWK7 81 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 DIRC1Q969H9 104 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 DAND5Q8N907 189 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 REG3AQ06141 175 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa12.73□□□□□ -0.37
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NISCH-213ENST00000489895 FAM231AP0DMU4 169 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 FAM231CP0DMU5 169 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 CDSNQ15517 529 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 UFSP1Q6NVU6 142 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 NCR3O14931 201 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 RS1O15537 224 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 TEN1Q86WV5 123 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 WNK1Q9H4A3 2382 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-213ENST00000489895 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 IGF2RP11717 2491 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 CRIP1P50238 77 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 H3BT86 120 aa12.7□□□□□ -0.38
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NISCH-213ENST00000489895 SPANXCQ9NY87 97 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 M0QY20 66 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 TRACP01848 142 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 U3KQK5 164 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 NDUFB1O75438 58 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 LINC00467Q9BRT7 94 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 TAX1BP3O14907 124 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 IGLV2-11P01706 119 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa12.68□□□□□ -0.38
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NISCH-213ENST00000489895 NFE4Q86UQ8 179 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 A0A0B4J2C4 111 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 LECT2O14960 151 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 LINC00482Q8N8I6 264 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa12.67□□□□□ -0.38
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NISCH-213ENST00000489895 KLLNB2CW77 178 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 A0A0J9YXY3 114 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 NDUFS5O43920 106 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 RNF183Q96D59 192 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-213ENST00000489895 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa12.65□□□□□ -0.39
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NISCH-213ENST00000489895 PDE6GP18545 87 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 NREPQ16612 68 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 COX7BP24311 80 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 RNF185Q96GF1 192 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 HIGD2BQ4VC39 106 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 C4orf48Q5BLP8 95 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZS46 218 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa12.62□□□□□ -0.39
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NISCH-213ENST00000489895 B9D2Q9BPU9 175 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 DCANP1Q8TF63 244 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 YPEL4Q96NS1 127 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 RBM3P98179 157 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 TMEM223A0PJW6 202 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 WFDC2Q14508 124 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 FAM110AQ9BQ89 295 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 ZNF580Q9UK33 172 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 BRI3O95415 125 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 C18orf65Q6ZTR6 163 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 CLEC2BQ92478 149 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 C9orf85Q96MD7 179 aa12.59□□□□□ -0.39
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