RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000198180.4

Csde1-211, Transcript of Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Csde1, Length 3,849 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1-211ENSMUST00000198180 Timm23Q9WTQ8 209 aa6.31□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Gm14214V9GX35 225 aa6.31□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 TrrapQ80YV3 2565 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Lgals1P16045 135 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Bmpr1bP36898 502 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 SlaQ60898 281 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 AdipoqQ60994 247 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Olfr263Q7TQT8 317 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Olfr1246Q7TQZ6 314 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 MavsQ8VCF0 503 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Olfr1295Q8VF48 312 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Nus1Q99LJ8 297 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Tmem167aQ9CR64 72 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Olfr972Q9EQA2 314 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 BlnkQ9QUN3 457 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Cbln1Q9R171 193 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Supt4h1bQ9Z199 117 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Ighv1-18A0A0A6YXN4 117 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Tcf21O35437 179 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Ptbp1P17225 527 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Sfrp2P97299 295 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Gm4894Q8CA09 118 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Cypt1Q8CH20 168 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Rnf2Q9CQJ4 336 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Immp1lQ9CQU8 166 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 EppinQ9DA01 134 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Nudt3Q9JI46 168 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 BC053393A0A0B4J1F6 192 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Tmem262D3Z338 116 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Inafm1E9PV59 130 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Ndufs8Q8K3J1 212 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Olfr123Q8VFQ1 309 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Tmub1Q9JMG3 245 aa6.3□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Ighv1-81A0A075B5Y4 117 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Gm5741B2RVA4 72 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Tmem139E9PX92 214 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Ucp1P12242 307 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Cd81P35762 236 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Dnajc30P59041 219 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 F7P70375 446 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Gm17324Q8C6J8 137 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Klk15Q8CGR4 254 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Poc1aQ8JZX3 405 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Pitpnc1Q8K4R4 332 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Cldn16Q925N4 235 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Npc2Q9Z0J0 149 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Zfp114B2RRA8 586 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Ccl6P27784 116 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Cdkn2aQ64364 169 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Dkk4Q8VEJ3 221 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Slc25a2Q99ML6 265 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Olfr961Q9EQ84 314 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Ttc28Q80XJ3 2450 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Rhox7bA6PW38 321 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Znf431E9QAG8 526 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Wt1P22561 449 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Rnase9P60154 184 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Map6d1Q14BB9 191 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Nanos1Q80WY3 267 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Cbln4Q8BME9 198 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 RnasekQ8K3C0 98 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Olfr1009Q8VFK1 314 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Mpv17lQ99MS3 194 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 ChodlQ9CXM0 273 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Kcnk5Q9JK62 502 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Ndufaf3Q9JKL4 185 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Cst10Q9JM84 148 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Opn3Q9WUK7 400 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Wdfy4E9Q2M9 3149 aa6.29□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Trav7n-5A0A075B604 112 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Ighv1-67A0A0G2JFN9 117 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Hoxa3P02831 443 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Prop1P97458 223 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Cnn1Q08091 297 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Znf48Q3US17 591 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Msrb2Q78J03 175 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Lhfpl1Q80SV1 220 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Gng5Q80SZ7 68 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Olfr976Q8VF15 326 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Olfr303Q8VFP0 319 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Mrpl27Q99N92 148 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Ssbp2Q9CYZ8 361 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Mrps11Q9DCA2 191 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 LenepQ9WVB6 61 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Trbv31A0A075B5J5 111 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Zfp980A2A9J5 645 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Olfr1337A2ACY8 315 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 P01649 108 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 IappP12968 93 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 AmelxP63277 210 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 MidnQ3TPJ7 465 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 IqcjQ8BPW0 110 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 EpcamQ99JW5 315 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Ndufa11Q9D8B4 141 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Gm3045A0A1D5RMA1 209 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 Gm10271F6WY25 52 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 PpoxP51175 477 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 SrstQ06666 185 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 YrdcQ3U5F4 280 aa6.28□□□□□ -1.4
Csde1-211ENSMUST00000198180 C1ql4Q4ZJM9 238 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.2 ms