Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z199

Supt4h1b, Transcription elongation factor SPT4-B, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt4h1bQ9Z199 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Supt4h1bQ9Z199 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Supt4h1bQ9Z199 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Supt4h1bQ9Z199 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Supt4h1bQ9Z199 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Supt4h1bQ9Z199 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
Supt4h1bQ9Z199 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Supt4h1bQ9Z199 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Supt4h1bQ9Z199 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Supt4h1bQ9Z199 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Supt4h1bQ9Z199 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Supt4h1bQ9Z199 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Supt4h1bQ9Z199 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Supt4h1bQ9Z199 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Supt4h1bQ9Z199 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Supt4h1bQ9Z199 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Supt4h1bQ9Z199 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Supt4h1bQ9Z199 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Supt4h1bQ9Z199 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,2■■□□□ 1,46
Supt4h1bQ9Z199 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Supt4h1bQ9Z199 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Supt4h1bQ9Z199 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Supt4h1bQ9Z199 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Supt4h1bQ9Z199 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Supt4h1bQ9Z199 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Supt4h1bQ9Z199 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,64■■□□□ 1,37
Supt4h1bQ9Z199 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Supt4h1bQ9Z199 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,58■■□□□ 1,36
Supt4h1bQ9Z199 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Supt4h1bQ9Z199 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Supt4h1bQ9Z199 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Supt4h1bQ9Z199 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Supt4h1bQ9Z199 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Supt4h1bQ9Z199 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Supt4h1bQ9Z199 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Supt4h1bQ9Z199 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,38■■□□□ 1,33
Supt4h1bQ9Z199 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Supt4h1bQ9Z199 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Supt4h1bQ9Z199 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Supt4h1bQ9Z199 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,33■■□□□ 1,33
Supt4h1bQ9Z199 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Supt4h1bQ9Z199 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Supt4h1bQ9Z199 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Supt4h1bQ9Z199 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Supt4h1bQ9Z199 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Supt4h1bQ9Z199 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Supt4h1bQ9Z199 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Supt4h1bQ9Z199 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Supt4h1bQ9Z199 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Supt4h1bQ9Z199 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Supt4h1bQ9Z199 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Supt4h1bQ9Z199 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Supt4h1bQ9Z199 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Supt4h1bQ9Z199 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Supt4h1bQ9Z199 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Supt4h1bQ9Z199 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Supt4h1bQ9Z199 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Supt4h1bQ9Z199 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Supt4h1bQ9Z199 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Supt4h1bQ9Z199 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Supt4h1bQ9Z199 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Supt4h1bQ9Z199 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Supt4h1bQ9Z199 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Supt4h1bQ9Z199 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Supt4h1bQ9Z199 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Supt4h1bQ9Z199 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Supt4h1bQ9Z199 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,51■■□□□ 1,19
Supt4h1bQ9Z199 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Supt4h1bQ9Z199 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Supt4h1bQ9Z199 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Supt4h1bQ9Z199 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Supt4h1bQ9Z199 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Supt4h1bQ9Z199 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Supt4h1bQ9Z199 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,32■■□□□ 1,16
Supt4h1bQ9Z199 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,15
Supt4h1bQ9Z199 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Supt4h1bQ9Z199 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Supt4h1bQ9Z199 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Supt4h1bQ9Z199 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Supt4h1bQ9Z199 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Supt4h1bQ9Z199 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Supt4h1bQ9Z199 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Supt4h1bQ9Z199 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Supt4h1bQ9Z199 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Supt4h1bQ9Z199 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Supt4h1bQ9Z199 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Supt4h1bQ9Z199 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Supt4h1bQ9Z199 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,06■■□□□ 1,12
Supt4h1bQ9Z199 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Supt4h1bQ9Z199 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Supt4h1bQ9Z199 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Supt4h1bQ9Z199 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Supt4h1bQ9Z199 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Supt4h1bQ9Z199 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Supt4h1bQ9Z199 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Supt4h1bQ9Z199 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Supt4h1bQ9Z199 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Supt4h1bQ9Z199 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Supt4h1bQ9Z199 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Supt4h1bQ9Z199 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
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