Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR64

Tmem167a, Protein kish-A, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem167aQ9CR64 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmem167aQ9CR64 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmem167aQ9CR64 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tmem167aQ9CR64 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmem167aQ9CR64 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmem167aQ9CR64 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem167aQ9CR64 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem167aQ9CR64 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmem167aQ9CR64 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem167aQ9CR64 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem167aQ9CR64 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem167aQ9CR64 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem167aQ9CR64 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem167aQ9CR64 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem167aQ9CR64 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem167aQ9CR64 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem167aQ9CR64 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem167aQ9CR64 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem167aQ9CR64 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem167aQ9CR64 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem167aQ9CR64 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem167aQ9CR64 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem167aQ9CR64 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem167aQ9CR64 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem167aQ9CR64 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem167aQ9CR64 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem167aQ9CR64 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem167aQ9CR64 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem167aQ9CR64 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmem167aQ9CR64 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem167aQ9CR64 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem167aQ9CR64 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem167aQ9CR64 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem167aQ9CR64 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem167aQ9CR64 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem167aQ9CR64 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem167aQ9CR64 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem167aQ9CR64 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem167aQ9CR64 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem167aQ9CR64 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem167aQ9CR64 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem167aQ9CR64 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem167aQ9CR64 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem167aQ9CR64 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem167aQ9CR64 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem167aQ9CR64 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem167aQ9CR64 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem167aQ9CR64 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmem167aQ9CR64 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmem167aQ9CR64 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem167aQ9CR64 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem167aQ9CR64 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem167aQ9CR64 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem167aQ9CR64 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem167aQ9CR64 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem167aQ9CR64 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem167aQ9CR64 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem167aQ9CR64 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem167aQ9CR64 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem167aQ9CR64 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem167aQ9CR64 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem167aQ9CR64 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem167aQ9CR64 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem167aQ9CR64 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem167aQ9CR64 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem167aQ9CR64 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem167aQ9CR64 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem167aQ9CR64 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem167aQ9CR64 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem167aQ9CR64 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem167aQ9CR64 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem167aQ9CR64 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem167aQ9CR64 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem167aQ9CR64 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem167aQ9CR64 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem167aQ9CR64 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem167aQ9CR64 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem167aQ9CR64 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem167aQ9CR64 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem167aQ9CR64 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem167aQ9CR64 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem167aQ9CR64 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem167aQ9CR64 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmem167aQ9CR64 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem167aQ9CR64 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem167aQ9CR64 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem167aQ9CR64 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem167aQ9CR64 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem167aQ9CR64 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem167aQ9CR64 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem167aQ9CR64 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem167aQ9CR64 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem167aQ9CR64 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem167aQ9CR64 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem167aQ9CR64 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem167aQ9CR64 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem167aQ9CR64 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem167aQ9CR64 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem167aQ9CR64 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem167aQ9CR64 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms