RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

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Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 UBE2D3P61077 147 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 UBE2D2P62837 147 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 RAB19A4D1S5 217 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGHV3-30P01768 117 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGHV3-33P01772 117 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 GNG4P50150 75 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 BLOC1S1P78537 153 aa4.95□□□□□ -1.62
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UBE2CP4-201ENST00000561405 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 NUDT11Q96G61 164 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.95□□□□□ -1.62
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UBE2CP4-201ENST00000561405 MED9Q9NWA0 146 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 C9orf118A6NHY6 69 aa4.94□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM250H0YL14 139 aa4.94□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.94□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 WDR73Q6P4I2 378 aa4.94□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 ALKAL2Q6UX46 152 aa4.94□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 NIT1Q86X76 327 aa4.94□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.94□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.94□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR2D3Q8NGH3 330 aa4.94□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 CNFNQ9BYD5 112 aa4.94□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 A0A1B0GVG6 124 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 XKRY2A2RUG3 117 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 F2Z2F3 143 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 K7EN84 100 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 P01737 135 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 GZMBP10144 247 aa4.93□□□□□ -1.62
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UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF56Q15929 161 aa4.93□□□□□ -1.62
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UBE2CP4-201ENST00000561405 AP1S3Q96PC3 154 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 TM2D2Q9BX73 214 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.93□□□□□ -1.62
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UBE2CP4-201ENST00000561405 M0QY20 66 aa4.92□□□□□ -1.62
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UBE2CP4-201ENST00000561405 KRTAP10-1P60331 282 aa4.92□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.92□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.92□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 Q8N1X5 172 aa4.92□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 Q8N814 137 aa4.92□□□□□ -1.62
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UBE2CP4-201ENST00000561405 Q9HAA7 133 aa4.92□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.92□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSCAO43653 123 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMIM17P0DL12 118 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 XGP55808 180 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 ELOBQ15370 118 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 COX11Q9Y6N1 276 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAT1Q14517 4588 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2CP4-201ENST00000561405 F5H697 171 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2CP4-201ENST00000561405 H7C1H1 209 aa4.9□□□□□ -1.63
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UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM210AQ96ND0 272 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2CP4-201ENST00000561405 TPPP3Q9BW30 176 aa4.9□□□□□ -1.63
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UBE2CP4-201ENST00000561405 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.9□□□□□ -1.63
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UBE2CP4-201ENST00000561405 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2CP4-201ENST00000561405 A0A087WX48 190 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2CP4-201ENST00000561405 Q0VG73 95 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2CP4-201ENST00000561405 IQCJQ1A5X6 159 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2CP4-201ENST00000561405 MPV17L2Q567V2 206 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2CP4-201ENST00000561405 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2CP4-201ENST00000561405 RASL11AQ6T310 242 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2CP4-201ENST00000561405 ENHOQ6UWT2 76 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2CP4-201ENST00000561405 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
UBE2CP4-201ENST00000561405 GTSF1Q8WW33 167 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2CP4-201ENST00000561405 FRZBQ92765 325 aa4.89□□□□□ -1.63
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