RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 LYRM9A8MSI8 78 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 J3KRW8 73 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 INSP01308 110 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZQT7 251 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 PTH2Q96A98 100 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf85Q96MD7 179 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 SPINK4O60575 86 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 APCSP02743 223 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 NTF3P20783 257 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00315P59091 139 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 SLAQ13239 276 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 H3BVH4 76 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 GNRH2O43555 120 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 CAMPP49913 170 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 Q0VG73 95 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 MUC21Q5SSG8 566 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 TPPP3Q9BW30 176 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 NIT2Q9NQR4 276 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 NAGKQ9UJ70 344 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 PPBPP02775 128 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP10-1P60331 282 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 RAB4BP61018 213 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 TWIST1Q15672 202 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 UPK3BQ9BT76 320 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 CBY3A6NI87 242 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 ESDP10768 282 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 GCSHP23434 173 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 HAMPP81172 84 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM18Q96B42 140 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 SPXQ9BT56 116 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 IFITM10A6NMD0 228 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 RAB4AP20338 218 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 SRIP30626 198 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF415Q09FC8 603 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 RNF185Q96GF1 192 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 AP1S3Q96PC3 154 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 LINC01587Q99440 93 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0J9YY99 117 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 PYY3Q5JQD4 70 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 NFE4Q86UQ8 179 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 AMN1Q8IY45 258 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 ORMDL3Q8N138 153 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 MRAP2Q96G30 205 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 PRSS47A8MTI9 375 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 M0R2P5 195 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 M0R381 172 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 FABP4P15090 132 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 HTN1P15515 57 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 EVI2AP22794 236 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 CTAG1AP78358 180 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 ESRGQ1W209 222 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 BAGE3Q86Y29 109 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 RASL10AQ92737 203 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 C16orf74Q96GX8 76 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 A8MWV9 139 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 SIVA1O15304 175 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 PPP1R17O96001 155 aa6.36□□□□□ -1.39
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