RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516926.1

RNU6-528P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 528, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-528P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-528P-201ENST00000516926 RERGLQ9H628 205 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 LINC00312Q9Y6C7 94 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 CFTRP13569 1480 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 EFCAB10A6NFE3 127 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 SMIM6P0DI80 62 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 GCHFRP30047 84 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 CCL8P80075 99 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 INSL4Q14641 139 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 VMO1Q7Z5L0 202 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 SERP1Q9Y6X1 66 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-528P-201ENST00000516926 MBD5Q9P267 1494 aa0.59□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 FOCADQ5VW36 1801 aa0.59□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 KCPQ6ZWJ8 1503 aa0.59□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 NWD2Q9ULI1 1742 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 NAIPQ13075 1403 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 CLPSL1A2RUU4 121 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 PRH1P02810 166 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 AQP10Q96PS8 301 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 NAA60Q9H7X0 242 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 IFT140Q96RY7 1462 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 F5P12259 2224 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 KDM6BO15054 1643 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 TMEM14DPA8MWL7 114 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 NMBP08949 121 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 C12orf73Q69YU5 71 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 Q6AWC8 147 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 PROK2Q9HC23 129 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 A0A1B0GV90 55 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 HCG22E2RYF7 251 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 SNAPC5O75971 98 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 FGF7P21781 194 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 BTG2P78543 158 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 C10orf128Q5T292 105 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 Q6ZRX8 168 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 Q8N8P6 123 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 SMR3AQ99954 134 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 SSC5DA1L4H1 1573 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 ARAP2Q8WZ64 1704 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 GOLGA3Q08378 1498 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 APCP25054 2843 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 SIX6O95475 246 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 PPP1R17O96001 155 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 AKAIN1P0CW23 69 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 CATR1Q13166 79 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 Q56UQ5 140 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 TTC9CQ8N5M4 171 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 WFDC6Q9BQY6 131 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 NPVFQ9HCQ7 196 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 LRRC37A3O60309 1634 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 DOCK11Q5JSL3 2073 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 COX6A2Q02221 97 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 CFAP126Q5VTH2 177 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 SPINK6Q6UWN8 80 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 BAGE3Q86Y29 109 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-528P-201ENST00000516926 NAV3Q8IVL0 2385 aa0.53□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 JMJD1CQ15652 2540 aa0.53□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 IFT172Q9UG01 1749 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 APOC2P02655 101 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 PPP3R2Q96LZ3 170 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 MRC1P22897 1456 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 UNC13BO14795 1591 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 DLEU1O43261 78 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 MYH8P13535 1937 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 TNCP24821 2201 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 C9orf153Q5TBE3 101 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 PP6455Q8WZ26 134 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 R4GMQ9 66 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 V9GYH0 126 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 CUL7Q14999 1698 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 IFNGP01579 166 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 CCL18P55774 89 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 TSLPQ969D9 159 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 SCN3BQ9NY72 215 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 PATJQ8NI35 1801 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 PRDM2Q13029 1718 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 FRAS1Q86XX4 4008 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 G3V318 75 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-528P-201ENST00000516926 S100A1P23297 94 aa0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms