RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 MGPP08493 103 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 IGLC6P0CF74 106 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 GNG4P50150 75 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 LINC01620Q4KN68 170 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 TEX46H3BTG2 121 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 AKAP14Q86UN6 197 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 UBE2WQ96B02 151 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7□□□□□ -1.29
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NELFE-213ENST00000494956 EPM2AB3EWF7 344 aa7□□□□□ -1.29
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NELFE-213ENST00000494956 IFNA1P01562 189 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 MPV17L2Q567V2 206 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 Q5VSD8 79 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 C15orf54Q8N8G6 183 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 AP1S3Q96PC3 154 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 TM2D2Q9BX73 214 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 VAX2Q9UIW0 290 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 A0A087WX48 190 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 K7EN84 100 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 P01737 135 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 SMIM17P0DL12 118 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 ENHOQ6UWT2 76 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 Q8N976 141 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 OCC1Q8TAD7 63 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 NUDT11Q96G61 164 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 M0QY20 66 aa6.98□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 NTF3P20783 257 aa6.98□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 GAGE6Q13070 117 aa6.98□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 TOR2AQ5JU69 321 aa6.98□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.98□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.98□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.98□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 SMIM12Q96EX1 92 aa6.97□□□□□ -1.29
NELFE-213ENST00000494956 CEBPGP53567 150 aa6.96□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 CACNG7P62955 275 aa6.96□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.96□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.96□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.96□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 CTRLP40313 264 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 RBX1P62877 108 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 GTSF1Q8WW33 167 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 FRZBQ92765 325 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 RMI2Q96E14 147 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 XKRY2A2RUG3 117 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 F2Z2F3 143 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 HLA-DQA1P01909 254 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 CRPP02741 224 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 BLOC1S1P78537 153 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 ELOBQ15370 118 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 TWIST1Q15672 202 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 RASL11AQ6T310 242 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 BIN3Q9NQY0 253 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 COX11Q9Y6N1 276 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.93□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 TRGC1P0CF51 173 aa6.93□□□□□ -1.3
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NELFE-213ENST00000494956 Q0VG73 95 aa6.93□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 IQCJQ1A5X6 159 aa6.93□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 TMEM250H0YL14 139 aa6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 H7C1H1 209 aa6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZSA8 131 aa6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 GATD1Q8NB37 220 aa6.92□□□□□ -1.3
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