RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 C10orf142B7Z368 130 aa-0.53□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 NEFHP12036 1026 aa-0.53□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 ACYP2P14621 99 aa-0.53□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 INSL4Q14641 139 aa-0.53□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC153Q494R4 210 aa-0.53□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 LINC01545Q5VT33 79 aa-0.53□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 SPANXCQ9NY87 97 aa-0.53□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.53□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 GOLGA3Q08378 1498 aa-0.54□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-0.54□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.54□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-0.54□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa-0.54□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM14DPA8MWL7 114 aa-0.54□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 NDUFA12Q9UI09 145 aa-0.54□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 AKAP6Q13023 2319 aa-0.55□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 IFITM1P13164 125 aa-0.55□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 SPANXA1Q9NS26 97 aa-0.55□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.55□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-0.55□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 CREBBPQ92793 2442 aa-0.56□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 DBIP07108 87 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 TAC4Q86UU9 113 aa-0.56□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 PKHD1P08F94 4074 aa-0.56□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.57□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 G3V318 75 aa-0.57□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 GCHFRP30047 84 aa-0.57□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 B2MP61769 119 aa-0.57□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-0.57□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.58□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-0.58□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-0.58□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-0.58□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 BATF3Q9NR55 127 aa-0.58□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 PDZD2O15018 2839 aa-0.58□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.58□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 ADGRB1O14514 1584 aa-0.58□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 LAMA3Q16787 3333 aa-0.58□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.58□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.58□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 C2CD3Q4AC94 2353 aa-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 ZANQ9Y493 2812 aa-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 CLPSL1A2RUU4 121 aa-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF815PA8K554 130 aa-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 EDDM3BP56851 147 aa-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 NCS1P62166 190 aa-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 MIC13Q5XKP0 118 aa-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 PTPN13Q12923 2485 aa-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 COL6A3P12111 3177 aa-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.59□□□□□ -2.5
ITGA4-211ENST00000490435 ACANP16112 2415 aa-0.6□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-0.6□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-0.6□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-0.6□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa-0.6□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 C10orf82Q8WW14 230 aa-0.6□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 WFDC6Q9BQY6 131 aa-0.6□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 SAR1AQ9NR31 198 aa-0.6□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-0.6□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 OVOS2Q6IE36 1432 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 M0R129 80 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 PITX3O75364 302 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 PIRTP0C851 137 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 IGLC6P0CF74 106 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 SPRR2DP22532 72 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 UBE2D1P51668 147 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 MMGT1Q8N4V1 131 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 IFT172Q9UG01 1749 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 APC2O95996 2303 aa-0.61□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.62□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 NF1P21359 2839 aa-0.62□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 SCGB1A1P11684 91 aa-0.62□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 VWFP04275 2813 aa-0.62□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-0.63□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 AIF1LQ9BQI0 150 aa-0.63□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 CNFNQ9BYD5 112 aa-0.63□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.63□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms